; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001141 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001141
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr4:25215757..25219893
RNA-Seq ExpressionLag0001141
SyntenyLag0001141
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CEL76513.1 TPA: RNA helicase, putative [Toxoplasma gondii VEG]5.3e-0857.76Show/hide
Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK
        PSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS 
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLS
          LS A SPSS   LS
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLS

ESS32480.1 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein, partial [Toxoplasma gondii VEG]5.3e-0857.76Show/hide
Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK
        PSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS 
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLS
          LS A SPSS   LS
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLS

KAE8553197.1 hypothetical protein EYB25_004579 [Talaromyces marneffei]4.8e-0938.89Show/hide
Query:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH
        PPS+          SS       +S        SS    S ++    P+     S +       +S   S A ++ S     S +  A S S    +S  
Subjt:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH

Query:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS
         + S    AS     P +  +     PSPSS A++S   SPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PS
Subjt:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
        PSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

QGA16673.1 hypothetical protein EYB26_004340 [Talaromyces marneffei]4.8e-0938.89Show/hide
Query:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH
        PPS+          SS       +S        SS    S ++    P+     S +       +S   S A ++ S     S +  A S S    +S  
Subjt:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH

Query:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS
         + S    AS     P +  +     PSPSS A++S   SPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PS
Subjt:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
        PSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

XP_002147803.1 class III chitinase ChiA1 [Talaromyces marneffei ATCC 18224]2.0e-0735.91Show/hide
Query:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH
        PPS+          SS       +S        SS    S ++    P+     S +       +S   S A ++ S     S +  A S S    +S  
Subjt:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH

Query:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS
         + S    AS     P +  +     PSPSS A++S   SPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PS
Subjt:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL----STPLFEGGEVTAIESDDDRCRQVG
        PSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++    + P   GG  +   + +     VG
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL----STPLFEGGEVTAIESDDDRCRQVG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative2.6e-0857.76Show/hide
Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK
        PSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS 
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLS
          LS A SPSS   LS
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLS

A0A1I8IUL4 DDE_Tnp_IS1595 domain-containing protein2.0e-0845.9Show/hide
Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKAL-------LSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLST
        PS  AL+  AP+P+S AL+S A +P+S AL        S AP+P+S AL+   P+P+S AL+  AP+P+S AL+  AP+P+S+ L+  AP+P+S AL+  
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKAL-------LSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLST

Query:  APSPSSKALLSTAPSPSSKVLL
        AP+P+S AL+  AP+P+S  L+
Subjt:  APSPSSKALLSTAPSPSSKVLL

A0A7C8H5H8 Chitinase2.3e-0938.89Show/hide
Query:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH
        PPS+          SS       +S        SS    S ++    P+     S +       +S   S A ++ S     S +  A S S    +S  
Subjt:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH

Query:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS
         + S    AS     P +  +     PSPSS A++S   SPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PS
Subjt:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
        PSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

B6QFQ7 Chitinase9.8e-0835.91Show/hide
Query:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH
        PPS+          SS       +S        SS    S ++    P+     S +       +S   S A ++ S     S +  A S S    +S  
Subjt:  PPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFEGSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLH

Query:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS
         + S    AS     P +  +     PSPSS A++S   SPSS A++ST PSPSS A++S TPSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PS
Subjt:  CSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL----STPLFEGGEVTAIESDDDRCRQVG
        PSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++    + P   GG  +   + +     VG
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL----STPLFEGGEVTAIESDDDRCRQVG

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)2.6e-0857.76Show/hide
Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK
        PSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS 
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLS
          LS A SPSS   LS
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGCGAATGGAAGTTGCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCT
CACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCACAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTC
CCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTTCGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCC
AAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGCAGCTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAATTCATTCCTCCCTTAGTTTGAAGGTTCTCACGTT
GCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGTTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCACGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTC
CAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCTTTCCTCCCAAATTCAAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAATTCCTTCCTCCAAGTTCGAA
GGTTCTCATGCGCTTCGCTGCACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTCCTCCAACTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGC
TCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGCTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
GTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGC
TGCTCCTTCTCCAAGTTCGAACGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTG
CTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTTTGAAGGTGGTGAAGTCACTGCAATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCAAGTCGGGTCTGGTGAC
CACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGAGTGCATCACTGAAGGCGAATGTGGTGACTAC
CCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGACTGGTCTAGTAGGAGTGCATCACTAAAGGCGAATCTGGTGACTACCCCTGCAGAGGAGGCCACCATTCATTTTG
GGGGGATTGAGCCAGAGGCAGAGAGGACAGAGTCCAGAGCATTCTCCCAAGATCCAGAGTCATCAAAATCCAAAGAGTTCAGAGAATTCAGAGATCCGAGATTTAGAATT
CAAAGGATTCAAGACTCAGAAGATTTGAAGACTAGAAGACTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGCGAATGGAAGTTGCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCAAATTCGAAGGTTCT
CACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCACAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTC
CCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTCGCTTCGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCC
AAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGCAGCTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAATTCATTCCTCCCTTAGTTTGAAGGTTCTCACGTT
GCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGTTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCACGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTC
CAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCTTTCCTCCCAAATTCAAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAATTCCTTCCTCCAAGTTCGAA
GGTTCTCATGCGCTTCGCTGCACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTCCTCCAACTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGC
TCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGCTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
GTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGC
TGCTCCTTCTCCAAGTTCGAACGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTG
CTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTTTGAAGGTGGTGAAGTCACTGCAATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCAAGTCGGGTCTGGTGAC
CACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGAGTGCATCACTGAAGGCGAATGTGGTGACTAC
CCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGACTGGTCTAGTAGGAGTGCATCACTAAAGGCGAATCTGGTGACTACCCCTGCAGAGGAGGCCACCATTCATTTTG
GGGGGATTGAGCCAGAGGCAGAGAGGACAGAGTCCAGAGCATTCTCCCAAGATCCAGAGTCATCAAAATCCAAAGAGTTCAGAGAATTCAGAGATCCGAGATTTAGAATT
CAAAGGATTCAAGACTCAGAAGATTTGAAGACTAGAAGACTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMLLAHTSLKANGSCFLQVRRFSRASLQFLPPNSKVLTCFAAVPSPKFEGSHALRCSSFLTVRRFSRASLQFLPPKFEGSHVASLQFLPPSLKVLTSLRFALRFVAVPSS
KFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAIHSSLSLKVLTLLRCSSFLQVRRFSCVLLQFLLSTFKGSHAFRYSSFPPSSKVLTRFGEVLSSQIQRFLRASLQFLPPIPSSKFE
GSHALRCTVPSSKFEGSHALRCYLPPTSKVLSRAAAAPSSKFEGSLTRFARSFSKFEGASLHCSFSKFEGASLRCYLPPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLS
TAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTPLFEGGEVTAIESDDDRCRQVGSGD
HPCRLLRSPNKMGTGLAGVHHCRQIWSASLKANVVTTPAGYSDHPIKWDWSSRSASLKANLVTTPAEEATIHFGGIEPEAERTESRAFSQDPESSKSKEFREFRDPRFRI
QRIQDSEDLKTRRL