; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001165 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001165
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationchr4:25872056..25876719
RNA-Seq ExpressionLag0001165
SyntenyLag0001165
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold
IPR025558 - Domain of unknown function DUF4283


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022156860.1 polygalacturonase-like [Momordica charantia]4.2e-17779.27Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW
        S     F   F Q SSA +YNV+SFGA PDGK DST PFLKAW+  C+SPT STI VP GRFLLT+TTF+GPC S ITFRLNG+LVAPLDYRAL NSG+W
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW

Query:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
        ILF KV+ VSV+GGNIDA GAGYWACKKSG NCP GARS+TFNWAN+I+ISGLTS+NS+Q HLVIN CNNV V+NVK++APDQSPNTDGIHVQSST+V I
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Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
         GSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMS+IKCGPGHGVSIGSLGKE  ENGV+NVTL N++F  SDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNV+NPI+IDQN
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        YCPNN+GCPL SSG+KIS V+Y+NI+GTSAT +A+TFDCSP+ PCSDIRLEDIKLTYK+KAATSSCKNIGGS++G+L+PES
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

XP_023531182.1 polygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-17175Show/hide
Query:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA
        MA    T ++II    FF+Q SSA  YNVI++GA PDGK DST PFLKAW L CSS T STI+VP GRFLL  TTF+GPCK+ ITFRLNG+LVAPLDYRA
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Query:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ
        L +SG+WILF KVN VS  GGNIDA GA YWAC+ SGK+CP GARS+TFNWAN+I +SGLTS+NSRQ+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIHVQ
Subjt:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN
        SSTDV I G+T+QTGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMN++FT+SDNGVRIKTW RP  GFVK+V+FQNI+MNNV+N
Subjt:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN

Query:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PI+IDQNYCP+NEGCP +S+GVKIS+VTY+NI GTSAT +A+TFDCS +NPC DIRLEDIKLTYK+KA+TS+C N+GGSSVG+L+P+S
Subjt:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

XP_023531904.1 polygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-16974.23Show/hide
Query:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA
        MA    T ++II    FF+Q SSA  +NVI++GA PDGK DST PFLKAW   CSS T STI+VP GRFLL  TTF+GPCK+ ITFRLNG+LVAPLDYRA
Subjt:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA

Query:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ
        L +SG+WILF KVN VS  GGNIDA GA YWAC+ SGK+CP GARS+TFNWAN+I +SGLTS+NSRQ+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIHVQ
Subjt:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN
        SSTDV I G+T+QTGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMN++FT+SDNGVRIKTW RP  GFVK+V+FQNI+MNNV+N
Subjt:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN

Query:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PI+IDQNYCP+NEGCP +S+GVKIS+VTY+NI GTSAT +A+TFDCS +NPC DIRLEDIKLTYK+KA+TS+C N+GGSS+G+L+P+S
Subjt:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

XP_038876456.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida]1.8e-17276.78Show/hide
Query:  IIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWIL
        ++IIF  FF+Q SSA +YNVI+ GA PDGK DST  F+KAW+  CSS T S I+VP GRFLLT  TF+GPCK+ ITFRLNG+LVAPLDYR L NSG+WIL
Subjt:  IIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWIL

Query:  FTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKIQG
        F KV+ VS IGGNID     YW CK SGKNCP GARSITFNWAN+I+ISGLTS+NS+Q+H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIHVQSST+V I G
Subjt:  FTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKIQG

Query:  STLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQNYC
        ST++TGDDCISIGDGTKNLFM++IKCGPGHGVSIGSLGKE NENGV+NVTLMN++FT+SDNGVRIKTWP PS GFVK+VLFQNIIMNNV+NPILIDQNYC
Subjt:  STLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQNYC

Query:  PNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PNN+GCPL+SSGVKIS+VTY+NI+GTSAT KA+TFDCS SNPCSDIRL+DIKLTYK+KAATSSCKN+ GSS+G+L+P +
Subjt:  PNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

XP_038888873.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida]5.0e-17076.09Show/hide
Query:  LATTSVIIIIFICFF----VQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYR
        +A TS I   F  FF    +QTSSA ++NVISFGA  DGK DST  FLKAW   CSS T STI+VP GRFLLT  TF+GPC + ITFRLNG+LVAPLDYR
Subjt:  LATTSVIIIIFICFF----VQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYR

Query:  ALRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV
        AL NSG+WILF KV+ VS  GGNIDA GAGYWACKK+GK CPVGARS+TFNWAN+I +SG+TS+NS+Q HLVIN C NV+V+NVK++APDQSPNTDGIHV
Subjt:  ALRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV

Query:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE
        QSS +V I GSTLQTGDDCISIGDGTK+L MS +KCGPGHGVSIGSLGKEFNE+GV+NVTL N++F  SDNGVRIKTWP  S GFVKNVLFQNIIM NV+
Subjt:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE

Query:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        NPILIDQNYCPNN+GCP +SSGVKIS VTYRNIQGTSAT +AMTFDCSPSNPCSDI+L+DIKLTYK+K  TSSCKNIGGSS+G+L+PES
Subjt:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M0F3 Uncharacterized protein4.6e-16973.89Show/hide
Query:  TTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSG
        T S++ I+F   F+Q S+A NYNVISFGA PDGK DST  FLKAW   CSS T STI+VP GRFLLT  TF+GPCK+ ITF LNG+LVAPLDYRAL +SG
Subjt:  TTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSG

Query:  FWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDV
        +WILF KV+ VS +GG ID  G  YWACK S KNCP GARSITFNWAN+I++SGLTS+NS+Q H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIHVQSST+V
Subjt:  FWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDV

Query:  KIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILID
         I GST++TGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKE NENGV+NVTL+N++FT+SDNGVRIKTWP PS GFV++V+FQNI+M NV+NPILID
Subjt:  KIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILID

Query:  QNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        QNYCPN++ C L+SSGVKI++VTY++I+GTSAT +A+TFDCS SNPCSDI+LEDIKLTYK+K  TSSCKNIGGSS+G+++PE+
Subjt:  QNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

A0A6J1DRI6 polygalacturonase-like2.1e-17779.27Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW
        S     F   F Q SSA +YNV+SFGA PDGK DST PFLKAW+  C+SPT STI VP GRFLLT+TTF+GPC S ITFRLNG+LVAPLDYRAL NSG+W
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW

Query:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
        ILF KV+ VSV+GGNIDA GAGYWACKKSG NCP GARS+TFNWAN+I+ISGLTS+NS+Q HLVIN CNNV V+NVK++APDQSPNTDGIHVQSST+V I
Subjt:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI

Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
         GSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMS+IKCGPGHGVSIGSLGKE  ENGV+NVTL N++F  SDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNV+NPI+IDQN
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        YCPNN+GCPL SSG+KIS V+Y+NI+GTSAT +A+TFDCSP+ PCSDIRLEDIKLTYK+KAATSSCKNIGGS++G+L+PES
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

A0A6J1EIK0 polygalacturonase-like1.7e-16873.71Show/hide
Query:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA
        MA    T ++II  I FF+Q SSA  YNVI++GA P+GK DST PFLKAW   CSS T STI+VP GRFLL   TF+GPC + ITFRLNG+LVAPLDYRA
Subjt:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA

Query:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ
        L +SG+WILF KVN VS  GGNIDA GA YWAC+ SGK+CP GARSITFNWAN+I++SGLTS+NSRQ+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIHVQ
Subjt:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN
        SSTDV I G+T+QTGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMN++FT+SDNGVRIKTW RP  GFVK+V+FQNI+MNNV+N
Subjt:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN

Query:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PI+IDQNYCP+NEGCP +S+GVKIS+VTY+NI GTSAT +A+TFDCS +NPC D+RLEDIKLTY +KA+TS+C N+GGSS+G+L+P+S
Subjt:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

A0A6J1EMF9 polygalacturonase-like4.6e-16973.97Show/hide
Query:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA
        MA    T ++II  I FF+Q SSA  YNVI++GA P+GK DST PFLKAW   CSS T STI+VP GRFLL   TF+GPC + ITFRLNG+LVAPLDYRA
Subjt:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA

Query:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ
        L +SG+WILF KVN VS  GGNIDA GA YWAC+ SGK+CP GARSITFNWAN+I++SGLTS+NSRQ+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIHVQ
Subjt:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN
        SSTDV I G+T+QTGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMN++FT+SDNGVRIKTW RP  GFVK+V+FQNI+MNNV+N
Subjt:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN

Query:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PI+IDQNYCP+NEGCP +S+GVKIS+V Y+NI GTSAT +A+TFDCSP+NPC DIRLEDIKLTY +KA TS+C N+GGSS+G+L+P+S
Subjt:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

A0A6J1JKS6 polygalacturonase-like3.3e-16773.2Show/hide
Query:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA
        MA    T ++II    FF+Q SSA  YNVI++GA PDGK DST PFLKAW   C+S T STI+VP GRFLL   TF+GPCK+ ITFRLNG+LVAPLD+RA
Subjt:  MAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRA

Query:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ
        L +SG+WILF KVN VS  GGNIDA GA YWACK SGK+CP GARS+TFNWAN+I +SGLTS+NSRQ+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIHVQ
Subjt:  LRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQ

Query:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN
        SSTDV I G+T+QTGDDCISIGDGTKNLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMN++FT+SDNGVRIKTW RP  GFVK+V+F+NIIMNNV+N
Subjt:  SSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVEN

Query:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        PI+IDQNYCP+N GCP +S+GVKIS+V Y+NI GTSAT +AMTFDCS +NPC ++RLEDIKLTYK+KA+TS+C N+GGSS G+L+P+S
Subjt:  PILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22818 Probable polygalacturonase At2g438602.4e-9846.67Show/hide
Query:  MYSSIMAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKG-PCK-SPITFRLNGSLV
        +Y++   IL    +I+   +   +        NV+S+GA PDG  DST  FL AW + C+S   +TI VP GRFL+    F G  CK +PI+ R+ GS+V
Subjt:  MYSSIMAILATTSVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKG-PCK-SPITFRLNGSLV

Query:  APLDYRALRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSP
        AP D+R + +S  WI F  V  VS+ GG +DA G   W CK + G NCP GA+S+ F+ +N+I ISGLTS+NS++ H+VI++ NNV ++ VK+ A + SP
Subjt:  APLDYRALRNSGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSP

Query:  NTDGIHVQSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQN
        NTDGIHV+SS  V I  S + TGDDCISIG G+ N+F+  I+CGPGHG+SIGSLG+   E GV NVT+ N  F  ++NGVRIKTW + S  F +N++FQ+
Subjt:  NTDGIHVQSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQN

Query:  IIMNNVENPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPESARRC
        I M  V+NPI+IDQ+YC  ++ CP + SGVK+S V Y +I GTS T+ A+  DCS   PC+ I ++D+ L    + A +SC N  GS+   ++P +   C
Subjt:  IIMNNVENPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPESARRC

Query:  LQSEV
        L+ E+
Subjt:  LQSEV

O23147 Polygalacturonase ADPG13.0e-7741.44Show/hide
Query:  TSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGR-FLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWILFTKVNRVSVI
        T  A   +V +FGA  DGK D T  F KAW+  CS+   +T  VP G+ +LL +T F+GPCKS   F++ G+L A       ++   W++   VN +S+ 
Subjt:  TSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGR-FLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWILFTKVNRVSVI

Query:  GGN---IDANGAGYW--ACK-KSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKIQGSTLQ
        GG+   I+ NG  +W  +CK    K C     ++T     ++ +  L   N++Q  + I  CN V V NV++ AP  SPNTDGIH+ ++ ++++  S + 
Subjt:  GGN---IDANGAGYW--ACK-KSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKIQGSTLQ

Query:  TGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQNYCPNNE
        TGDDCISI DGT+NL + D+ CGPGHG+SIGSLG + ++  V  + +  + F+ SDNGVRIKT+ +   G  KN+ FQNI M NV+NPI+IDQ+YC + +
Subjt:  TGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQNYCPNNE

Query:  GCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPE
         C  + S V++  V Y+NI GTSAT  A+T +CS   PC  I LE++K+    K  T+SCKN    + G + P+
Subjt:  GCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPE

P48979 Polygalacturonase3.8e-11252.76Show/hide
Query:  IIFICFFVQTSSAD--NYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCK-SPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWI
        +IF+ F + ++ A    YNV S GA  DGK DST  FL AW   C+S     I VP G F L    F GPCK + ITFR+ G+LVAP DYR + N+  WI
Subjt:  IIFICFFVQTSSAD--NYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCK-SPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFWI

Query:  LFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKK-SGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
         F  VN V++ GG +D  G   WACK   G++CP GA ++ F+ +N+I++SGL S+NS+  H+VIN   NV ++ V++     SPNTDGIHVQ S+ V I
Subjt:  LFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKK-SGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI

Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
          S + TGDDC+SIG GT NL++  + CGPGHG+SIGSLGKE  E GVQNVT+    F+ + NG+RIK+W RPS GF +N+LFQ+  M NVENPI+IDQ+
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        YCP+N+GCP + SGV+IS+VTY +I GTSAT+ A+ FDCSP +PC +I+LED+KLTYK++AA SSC +  G++ G++ P S
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

Q39766 Polygalacturonase3.1e-8241.75Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVIS-FGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGF
        S+ +++ +         D ++V++ FGA  DGK D + PFL AW+  C+S T ST+ +P G +LL+    +GPCK+PI   + G++ AP D  A ++   
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVIS-FGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGF

Query:  WILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-------GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV
        W+ F  V    + GG I  +G G  A +K+           PV   +I F++  + LI  +TS +S+  H+ +  C N+ +E +K+ APD+SPNTDGIH+
Subjt:  WILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-------GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV

Query:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE
          S  V I  S ++TGDDCISIGDGTKN+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  V+ + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I MNNV 
Subjt:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE

Query:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYK-SKAATSSCKNIGGSSVGMLIP
        +PILIDQ YCP N+    E S VK+S ++++NI+GTSA  +A+ F CS S+PC ++ L DI + +  ++ ATS C N+   ++G L P
Subjt:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYK-SKAATSSCKNIGGSSVGMLIP

Q39786 Polygalacturonase9.1e-8241.75Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVIS-FGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGF
        S+ +++ +        +D ++V++ FGA  DGK D + PFL AW+  C+S T ST+ +P G +LL+    +GPCK+PI   + G++ AP D  A ++   
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVIS-FGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGF

Query:  WILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-------GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV
        W+ F  V    + GG I  +G G  A +K+           PV   +I F++  + LI  +TS +S+  H+ +  C N+ +E +K+ APD+SPNTDGIH+
Subjt:  WILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKS-------GKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHV

Query:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE
          S  V I  S ++TGDDCISIGDGTKN+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  V+ + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I MNNV 
Subjt:  QSSTDVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVE

Query:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYK-SKAATSSCKNIGGSSVGMLIP
        +PILIDQ YCP N+    E S VK+S ++++NI+GTSA  +A+ F CS S+PC ++ L DI + +  ++ ATS C N+   + G L P
Subjt:  NPILIDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYK-SKAATSSCKNIGGSSVGMLIP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05650.1 Pectin lyase-like superfamily protein5.6e-13559.07Show/hide
Query:  ATTSVIIIIFICFF-VQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRN
        A T  +I   + F  V +S++  +NV+SFGA PDG  DST  FLKAW+  C S   +T+ VP G FLL   TF GPCKS ITF++ G++VAP DYR   N
Subjt:  ATTSVIIIIFICFF-VQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRN

Query:  SGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSST
        SG WILF KVNR S++GG  DA G+G+W+C+KSG+NCP G RSI+FN A D++ISG+ S+NS+ +H+ +N C NV V N++++AP  SPNTDG  VQ ST
Subjt:  SGFWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSST

Query:  DVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPIL
         V + GST+QTGDDC++IG GT+N  +S + CGPGHGVSIGSL K+ NE+GV+NVT+ +S+FT S NGVRIK+W RPS GFV+NV FQN+IM NV+NPI+
Subjt:  DVKIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPIL

Query:  IDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTY-KSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        IDQNYCP+N+GCP E SGVKI++VTY+NIQGTSATQ+AM   CS SNPC+ I L+DIKLTY K   ATS C N  G ++G++ P S
Subjt:  IDQNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTY-KSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

AT1G05660.1 Pectin lyase-like superfamily protein6.2e-13459.16Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW
        S++  +     V  S+++ +NV+SFGA PDG  DST  FLKAW+  C S + +T+ VP G FLL   TF GPCKS ITF++ G+++AP DYR   NSGFW
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW

Query:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
        ILF KVNR S++GG  DA   G+W+C+KSG+NCP G RSI+FN A D++ISG+ S+NS+  H+ +N C NV+V NVK++AP  SPNTDG HVQ ST V  
Subjt:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI

Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
         GST+QTGDDC++IG GT+NL ++ + CGPGHGVSIGSL KE  E+GV+NVT+ +S+FT S NGVRIK+W RPS GFV+ V FQ+++M NVENPI+IDQN
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTY-KSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES
        YCP +EGCP E SGVKIS+VTY+NIQGTSATQ+AM   CS S+PC+ I L+DIKLTY K   ATS C N  G S+G++ P S
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTY-KSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPES

AT2G43870.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.3e-12354.35Show/hide
Query:  IIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKG-PCK-SPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW
        ++++F+ FF+ + SA +YNV+SFGA PDGK D+T  F+  W+  C+S    TI VP GRFLL + TF G  CK  P+TFR++G+LVAP DYR + N  +W
Subjt:  IIIIFICFFVQTSSADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKG-PCK-SPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW

Query:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
        I F  ++ ++V GG +DA GA  W CKKSGKNCP GA +I F  ++++++SGLTS+NS+  H+VIN CNNV ++ VK++A   SPNTDGIHVQSS+ V I
Subjt:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI

Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
          + + TGDDC+SIG GT  L++ ++ CGPGHG+SIGSLGK+  E+GVQNVT+    FT +DNGVRIK+W RPS GF KN+ FQ+ +MNNVENPI+IDQN
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIP
        YCP+++ CP + SG+KIS+V + +I GTSAT+  +  DCS   PC+ IRLED+KLTY++K A S+C + GG   G   P
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIP

AT2G43880.1 Pectin lyase-like superfamily protein4.6e-12955.18Show/hide
Query:  VIIIIFICFFVQTSSA-DNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW
        +   I I F +++S A  ++NV  +GA  DG+ D+T  FL AW L C S   + + VP G +L+    F GPCK+ ITF+ +G+LVAP +Y  + NSG+W
Subjt:  VIIIIFICFFVQTSSA-DNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSGFW

Query:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI
        ILF KVNR+SV GG IDA GAGYW+C+K G +CP GARSI+F+W N++L+SGL+S NS+  H+ ++H +NV +ENV++ AP  SPNTDGIHVQSS+ V I
Subjt:  ILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDVKI

Query:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN
         G T+ TGDDCI++  G++N+++  + CGPGHG+SIGSLG   NE GVQNVT+ +S+FT++ NGVRIKTW RPS+GFV NV+F+N+IMNNVENP++IDQN
Subjt:  QGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILIDQN

Query:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPESARRCL
        YCPN +GCP +SSGVKIS VT+ NI+GTS T  AM  DCS SN C+ +RL+DIKLTY  +++ S C+N  G + G+++P   R C+
Subjt:  YCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPESARRCL

AT2G43890.1 Pectin lyase-like superfamily protein6.6e-15263.87Show/hide
Query:  SVIIIIFICFFVQTSS--ADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSG
        +V+++ F  F +  SS  A NYNV+SFGA PDG+ DST  FL AW+  C S    T+ VP G FLL    F+GPC+S ITF++ G++VAP DYR L NSG
Subjt:  SVIIIIFICFFVQTSS--ADNYNVISFGANPDGKVDSTLPFLKAWRLVCSSPTESTIDVPNGRFLLTTTTFKGPCKSPITFRLNGSLVAPLDYRALRNSG

Query:  FWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDV
        +WILF KVNR+S+IGG +DA GA +WAC+KSGK+CPVGARS+TFNWAND+++SGLTS+NS+  HLVIN CNNV+V  VK++APDQSPNTDG+HVQ S  V
Subjt:  FWILFTKVNRVSVIGGNIDANGAGYWACKKSGKNCPVGARSITFNWANDILISGLTSVNSRQAHLVINHCNNVLVENVKMIAPDQSPNTDGIHVQSSTDV

Query:  KIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILID
         +   T  TGDDCISIG GT+NL+MS + CGPGHG+SIGSLG++ NE GV+N+TL+NS+F+ SDNGVRIKTW R S GFV+NVLFQN+IM NV+NPI++D
Subjt:  KIQGSTLQTGDDCISIGDGTKNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNENGVQNVTLMNSMFTRSDNGVRIKTWPRPSKGFVKNVLFQNIIMNNVENPILID

Query:  QNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPE
        QNYCP+N+GCP + SGVKIS+V YRNIQGTS TQ+A+TFDCS SNPC  IRL DIKLT+  ++ATS+CKNI G   G+++P+
Subjt:  QNYCPNNEGCPLESSGVKISEVTYRNIQGTSATQKAMTFDCSPSNPCSDIRLEDIKLTYKSKAATSSCKNIGGSSVGMLIPE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTATTCTTCAATTATGGCAATCCTAGCGACAACTTCAGTCATCATCATCATCTTCATTTGTTTTTTCGTTCAAACATCAAGTGCAGATAATTACAATGTCATCAGTTT
TGGTGCCAATCCTGATGGAAAAGTTGATTCCACATTGCCATTTCTCAAGGCATGGAGATTAGTTTGTAGCTCCCCAACCGAGTCCACCATCGACGTCCCTAATGGAAGGT
TTCTGCTAACAACCACAACATTTAAAGGACCGTGCAAGAGCCCGATTACCTTTCGCTTGAACGGATCGCTTGTGGCACCTCTAGATTATCGCGCCCTTAGAAATTCTGGG
TTTTGGATTTTATTCACTAAAGTTAATAGGGTTTCTGTGATCGGTGGCAACATTGATGCAAACGGAGCTGGATATTGGGCCTGCAAGAAATCAGGAAAGAATTGTCCAGT
AGGAGCTCGGTCAATAACATTTAATTGGGCGAATGACATCTTGATTAGTGGGTTAACATCAGTTAATAGCCGCCAAGCTCATCTTGTAATCAATCATTGTAACAATGTGT
TGGTTGAGAATGTGAAGATGATAGCTCCAGATCAAAGTCCCAACACCGATGGTATTCACGTCCAATCCTCCACGGATGTAAAAATTCAGGGAAGTACCCTCCAAACTGGA
GATGATTGCATATCCATTGGAGATGGAACTAAGAATCTGTTTATGAGTGACATTAAATGTGGGCCTGGCCATGGTGTAAGCATCGGTAGCTTGGGAAAAGAGTTTAACGA
AAATGGAGTACAAAATGTAACATTGATGAATTCAATGTTCACTCGATCCGATAATGGAGTGAGGATAAAGACATGGCCTAGGCCTAGTAAAGGTTTCGTAAAAAATGTTC
TCTTTCAGAACATCATTATGAACAACGTTGAAAATCCAATTCTAATTGACCAAAATTATTGTCCAAACAATGAAGGTTGTCCTCTCGAGAGCTCTGGGGTGAAGATTAGT
GAAGTGACATATAGAAATATTCAAGGTACGTCAGCAACACAAAAAGCTATGACATTTGATTGTAGTCCCAGCAACCCATGCAGTGACATCCGATTAGAAGACATCAAGCT
CACATATAAGAGCAAGGCAGCAACATCCTCCTGCAAGAATATTGGTGGATCGTCTGTGGGAATGCTCATACCTGAAAGTGCTCGACGTTGTCTGCAGTCGGAGGTCAAGG
TTTTGGGTAGCGTGGGGCAGTCGAGCGTCCACAGGATCAGTGAAGGCGGGGGTTTGGTCGGAGCGGCTTCGTGGGCGGCGGTGACGGGCATAGTCGTCATCTGGTTTCAG
ATTGAGACAGTTGATCGCTGGGGTGGTGGTGGCGCTGTTCGTGGCTTGTTGCAGGCGGTGGTTTTCGGTGGTGTTGGTATTGCCGTTTGGTCTGGTTTTTTGGTGGCCCA
TCGTTTTGTTGCAGGCGGTGGTGTTTCGGTGGTTTGTTTCGTACATTCTATGCGGCGGGCGATGAGGTGGGCAGGAACTGGTTTGGAAGCGGAGCAGGTAGGTTTTGTGG
GGTGGGTACGGTGGGGCGGGAGGACGATGGAGGATTTGGTGAGTAAGTGGAGGTCCTGGAAGTTTACGGAGGAGGAAGCAGAGAATGTGAAGCCGGGGGATGTGGCGCCG
ACCTTATCTGAGGGATCGAGAGAGCTTTGTGTGGTGGGGAAGGTGCTCTCGTCGAAGCGTGTGAATATGGATGCTTTTCGAAATGTGATAAGAGCGACATGGAGAACCCA
TGGGGCGACTCGTATAGAAGTGGCGGGGGATAATTTGTTTGCGATCCAGTTTCGGTCCAAAGGGGAGAAGGTAAGAGTTATGTCGTCGGGGCCATGGGTGTTCGACAGAT
CCCTTGTGATTCTAAAGGATGCACAGTTGGTATCATCAGTTCTGGATGTGGAGTTTAAGGACTGCTCTTTCTGGGTCCAGATCCACAATGTCCCCATGCGTTGGCAGACT
AAGGGGATGGCGAAGCATCTAGGAGGGAAGATTGGTGTTGTAGAGGAGGTAGATGGGGCGCAGGGGAGCGAGTGGACGGGACCAGTCTTAAGAATGAGAGTGCGCCTGAG
GGTTGATCGGCCTCTACGAAGAGGTTTTCATATGACACTCGAGGAGGGAGTGTGGGGTGGTGGGAGAAGGTTCTTCGGAGTAGGGAGAGGATCAGTATGGGGAGTGGTTG
CGGGCGGGGGGGTAAGGGTGGTAAGGGAGGGAGGAGAGGTTCTGGAGACCCAGGTTGGGGGAGCTAGTATTGAAGTGGCTCCCCAGTCGGGCGAGGTTGGGGAGAAGGGG
CCTGATGAGGGGATGATAGATAAGGGGAAGGGGAAGCAAAAGGTGGGGGTTGCCTCTATGGAGCTTAGGGCCACCTATGTGGGAGAAGACGTGATGGCAGTAGATGAGGT
GGGAGGTGGGGGGTCTGAGGGGGCTGAGAGGGCAGGTAAAACAGGCAGTATTAAAGGTTGGAAGAGAAAGGCGAGGGATGCACTTGCAGACATCTCAAATAGGGAAGTCC
TGATGGAGTCTGTTGGGGGCAAAAGGAAAGGGGAGGAGGGTGAGATGCCAATTCAGGGAGGAAAGAAGGCGAGGGGTGGGGGGGAGACAAAATCTGTTGTTTCGGCGGTG
GCTGGTTCTCAGCCCCGCCGGACGCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTATTCTTCAATTATGGCAATCCTAGCGACAACTTCAGTCATCATCATCATCTTCATTTGTTTTTTCGTTCAAACATCAAGTGCAGATAATTACAATGTCATCAGTTT
TGGTGCCAATCCTGATGGAAAAGTTGATTCCACATTGCCATTTCTCAAGGCATGGAGATTAGTTTGTAGCTCCCCAACCGAGTCCACCATCGACGTCCCTAATGGAAGGT
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TTTTGGATTTTATTCACTAAAGTTAATAGGGTTTCTGTGATCGGTGGCAACATTGATGCAAACGGAGCTGGATATTGGGCCTGCAAGAAATCAGGAAAGAATTGTCCAGT
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