; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001205 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001205
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionDEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
Genome locationchr4:26526558..26532219
RNA-Seq ExpressionLag0001205
SyntenyLag0001205
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8553197.1 hypothetical protein EYB25_004579 [Talaromyces marneffei]3.2e-0840.55Show/hide
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        SS    S +   S  S +S V+T   T P+    GS +       SS   S S++A  S    +++  A S +    + + + S S+ +    A+   VR
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          + +      PS   P+  S   SPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++S TPS               A++ST PSPSS 
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        A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
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MBP7963185.1 PKD domain-containing protein [Caldilineaceae bacterium]1.0e-0636.62Show/hide
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        PS      A+L  SPS    ++T PSPS    ++  PSPS    ++T PSPS    ++ TPS      SP +       ++T PSPS    ++T PSPS 
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            +T PSPS     +T PSPS    ++T PSPS    ++T
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QGA16673.1 hypothetical protein EYB26_004340 [Talaromyces marneffei]1.0e-0637.8Show/hide
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        S+    + T   S  S +S   +  ++  SS    S ++    P  +   S S+++ SS    S +    S S    + +++ + SS +    ++   V 
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            A    + P+ +  S      SPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++S TPS               A++ST PSPSS 
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        A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
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RUS88736.1 hypothetical protein EGW08_003551, partial [Elysia chlorotica]3.0e-0641.01Show/hide
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        ST PS S K +LS    + +++  S      +   L      S   S S K +LST P  S K +LS  PS S K +LST PS S K +LS  PS     
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           +LL    + ++ +LST P+ S K +LST PS S K +LST PS   K +LST PS S K +LST PS   K +LS
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XP_039541419.1 ice-structuring glycoprotein-like isoform X2 [Pimephales promelas]3.9e-0629.77Show/hide
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        PS +   S        + PS++   S     S  S  S   T    + PS++   S A      PS++  + +A+ PS++   S   T    S +  E T
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         STA +PS+++  S A          T       S A  +    +   PS  S A + S++A  STA +PS+++  S A +PS+++  STA +PS  S A
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          ++TPS      S        +  STA +PS+++  STA +PS+++  STA +PS+++  ST  +PS+++  STA +PS++     +STP  E +P   
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Query:  SFSKFEGSP
        S    E +P
Subjt:  SFSKFEGSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1I8IUL4 DDE_Tnp_IS1595 domain-containing protein1.1e-0642.86Show/hide
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        PS  AL+  AP+P+S AL+S AP+P+S AL   AP+P+S A   A+ + V    +P       AL+  AP+P+S AL+  AP+P+S  L+  AP+P+S  
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        L+  AP+P+S AL+  AP+P+S  L+
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A0A433U4J1 Uncharacterized protein (Fragment)1.4e-0641.01Show/hide
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        ST PS S K +LS    + +++  S      +   L      S   S S K +LST P  S K +LS  PS S K +LST PS S K +LS  PS     
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Query:  FSPLLL----LQVRALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKTLLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLS
           +LL    + ++ +LST P+ S K +LST PS S K +LST PS   K +LST PS S K +LST PS   K +LS
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A0A507CAM6 Uncharacterized protein4.2e-0632.66Show/hide
Query:  SPSSKALLSTAPSP-SSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSATPSQVRRRFSPLLLLQVRALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSS
        SP +  + S APSP +S    S APSP +  L S APSP +  L SA PS V              L S APSP +  L S APSP +  L S APSP +
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         TL S APSP +  L S AP SP+   +LS+     +P     S    SP+   K        V           V    +S   CG  TA+      C 
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           + D PC         GT   G + C+  +S        ++P   A
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A0A7C8H5H8 Chitinase1.5e-0840.55Show/hide
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        SS    S +   S  S +S V+T   T P+    GS +       SS   S S++A  S    +++  A S +    + + + S S+ +    A+   VR
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Query:  RFSHALLQFLPPSLKVPSRASLAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSATPSQVRRRFSPLLLLQVRALLSTAPSPSSK
          + +      PS   P+  S   SPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++S TPS               A++ST PSPSS 
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        A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
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V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)2.1e-0535.21Show/hide
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        LQ L PS + L      P S    P  +  GS   H LC SS  T        L  L  P+ + S V     LPPS +                 K  G 
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Query:  HTLRCSFFSLTSKVLTRFATVPSSKFEGSHALRCYLPPSSKVLSRSAAAP-----SSKFEGSLT----RFARSFSKFEGTFSTAPSPSSKALLSVATFL-
           R +  +L+ +  TR  +  S  F  S +L    P +    S S+A       S++    LT    RF RSFS  E    ++ S   KA   ++ FL 
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             + +  +   P+    + +S A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   S      SP         LS A SP
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        SS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTATGACTGCTACGTTGTTCCTCCTCCAAGTGCGAAGGATCTTATGTGGTGCGTTGTTGCATTGTTCCCTCTTCTCTCAAGTTCGATGGTTCTCACGCAGCTTTGCTGGA
GTTTCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTCCGTTGCAGTTCCTTCTTTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACTCGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAA
GGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCCACTGTTGCAGTTCAT
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TCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCT
GCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGCTCATTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTC
TCTCCGTTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTACTCCTTCCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCAC
TGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGACGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCC
CTCTTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGTGGCGGTTGACGTCCTCGTTCTGCTTCATCTT
CAAATGTTGGTAGTTGACGGCGTCCGCTTCGCTTCATCTTCAAAAATTGACTGTGGTGAAGTCACTGCAATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGGGTCTGG
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ATCATCCAAGAGGATCAACAGCTAACAAGCCGATCCAACAGATCATCAAGCCAACAGGCCGATCCAACAGATCAACAAGCCAACCGACCGATCAAGAAGATCAACAAGTC
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TCAACAAGCTAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCAAGCCAACAGGCCGATCCAAGAGATCATCAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAGGATCAACAAACTAACAAGCCG
ATCCAAGAGATCATCAACCTAGCAGGTCGATCATCCAAGAAGCACAACAAACCAGCCCAAGAAGATCAACAAGCTAGAGACCAAAGTTTTTCAGATACTTTTCTCCTGAT
CTTGGGCTGGAAGACCTTCAGAGAACATACTTACCTAAGGTCTTTGGTAAACGTTGATGGAGCAACAGCCTCTGAGATTATGATTCGCTATGAATGTCTGCTTGAGTTGT
GGATGCGAGATCTGACTCGCTTTGGTTGTAAAGTTTTGGTGTACCGGAAATGTGTGGATGTTGTGGTTGGGCAGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TRCVAVISPQVRRFTQFAAVPSPKFEGSHALRSAIPFPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHVASLQFLPPSLKVLTRFAAVPSSKFEVPSPKFEGSHALCCSSFLTVRRFSRA
LLQFLPPKFEGSHVASLQFLPPSLKVITSLRFALRFVAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFATVPSSKFEGSHALRCYLPPSSKVLSRSAAAPSSKFEGSLTRFAR
SFSKFEGTFSTAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSLKVPSRASLAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSATPSQVRRRFS
PLLLLQVRALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKTLLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTPLFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVAVDVLVLLHL
QMLVVDGVRFASSSKIDCGEVTAIESDDDRCRRVGSGDHPCRLLRSPNKMGTGLAGVHHCRQIWSASLKANLVTTPAEEATIHSRGIQIGDRVRELRVQSILPESRVGRP
IIQEDQQLTSRSNRSSSQQADPTDQQANRPIKKINKSAGRSSKKINKPTDRTDHQANRSIQEIIKSAGRSSKRINKLTSRSKRSSSQQADPRDHQVSRPIIQEDQQTNKP
IQEIINLAGRSSKKHNKPAQEDQQARDQSFSDTFLLILGWKTFREHTYLRSLVNVDGATASEIMIRYECLLELWMRDLTRFGCKVLVYRKCVDVVVGQF