; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001289 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001289
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionexpansin-like A1
Genome locationchr4:28590697..28591908
RNA-Seq ExpressionLag0001289
SyntenyLag0001289
Gene Ontology termsGO:0019953 - sexual reproduction (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR007112 - Expansin/pollen allergen, DPBB domain
IPR007117 - Expansin, cellulose-binding-like domain
IPR007118 - Expansin/Lol pI
IPR009009 - RlpA-like protein, double-psi beta-barrel domain
IPR036749 - Expansin, cellulose-binding-like domain superfamily
IPR036908 - RlpA-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8645684.1 hypothetical protein Csa_020448 [Cucumis sativus]3.8e-13789.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BJ37 Expansin A2-like protein2.0e-10770.52Show/hide
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        D+  + N+TD+VLS  A++AMA  G   QL     VDVEYKR+PCEY   +NL ++V E S  P  L+I+FLYQGGQTDI AV++A VG   W+ M R+Y
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Q9LZT4 Expansin-like A11.2e-7252.51Show/hide
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        FL  ++FL  SS  A    C+RC+ +SKAA++   S +S  GAC YG++A     G+ AAA  S+Y+ G GCGAC+QVRCK+ +LC+T GT +++TD N 
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Q9LZT5 Expansin-like A32.3e-6850Show/hide
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        A+W  + VP GALQ R VVT+ YD GK +W+  VLP +W+ G+ YD GVQI DIA E C P  C D  W
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45960.1 expansin-like A36.1e-6152.34Show/hide
Query:  LALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTDQNNDNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKN
        +A     G+ AAA  S+Y+ G GCGAC+QVRCK+ +LCN+ GT +++TD N  N+TD+VLS +AF AMA  + G  + LL  G+VDVEY+R+PC Y  +N
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Query:  LLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYGAIWDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQI
        L V+V E S KP YLAIK LYQGGQT++  ++IA VG  +W  M R++GA+W  + VP GALQ +  VT  YD GK +W+  VLP +W  G IYD GVQI
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Query:  NDIALEYCSPGQCG
         DIA E C    CG
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AT3G45960.2 expansin-like A31.6e-6950Show/hide
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        +L  ++FL  SS  A    C+RC+ +SKA+++   S +S  GAC YG +A     G+ AAA  S+Y+ G GCGAC+QVRCK+ +LCN+ GT +++TD N 
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Query:  DNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYGAIW
         N+TD+VLS +AF AMA  + G  + LL  G+VDVEY+R+PC Y  +NL V+V E S KP YLAIK LYQGGQT++  ++IA VG  +W  M R++GA+W
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Query:  DINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSPGQCG
          + VP GALQ +  VT  YD GK +W+  VLP +W  G IYD GVQI DIA E C    CG
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AT3G45970.1 expansin-like A18.2e-7452.51Show/hide
Query:  FLTFLLFLLVSSTTASFPPCNRCVRQSKAAHYYEDSPISYGGACGYGNLALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTDQNN
        FL  ++FL  SS  A    C+RC+ +SKAA++   S +S  GAC YG++A     G+ AAA  S+Y+ G GCGAC+QVRCK+ +LC+T GT +++TD N 
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Query:  DNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVG-FPKWRPMKRNYGAI
         N+TD+VLS +AF AMA  + G  + LL  G+VD+EY+R+PC+Y NKN+ V+V E S KP YL IK LYQGGQT++ +++IAQVG  P W  M R++GA+
Subjt:  DNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVG-FPKWRPMKRNYGAI

Query:  WDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSP
        W  + VP GA+Q R VVT  YD GK IW+ SVLP++W+ G+IYD GVQI DIA E C P
Subjt:  WDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSP

AT4G17030.1 expansin-like B13.1e-4440.72Show/hide
Query:  SKAAHY-YEDSPISYGGACGYGNLALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTDQNNDNKTDIVLSKKAFSAMALKGKGQQL
        S+A +Y   D   +  G CGYG    +I+ G  +  +  L+  G GCGACYQVRCK    C+  G  +V TD    + TD +LS KA+  MA  G   QL
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Query:  LNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYGAIWDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNG--KW
         + G+V+VEY+RIPC Y   NL+ ++ E S+ P+YLAI  LY GG  DI AV + Q    +WR M+R +GA+ D+ + P G L LR +V   Y +    W
Subjt:  LNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYGAIWDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNG--KW

Query:  IWAGSVLPTDWKIGEIYDTGV
        I + + +P DW  G  YD+ +
Subjt:  IWAGSVLPTDWKIGEIYDTGV

AT4G38400.1 expansin-like A22.0e-7250.19Show/hide
Query:  MSGFLTFLLFLLVSSTTASFPPCNRCVRQSKAAHYYEDSPISYGGACGYGNLALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTD
        + GFL  L  +L+ S++A+   C+RC+  SKAA++   S +S  GAC YG++A     G+ AAA  S+Y+ G GCGAC+QVRCK+  LC++ GT +++TD
Subjt:  MSGFLTFLLFLLVSSTTASFPPCNRCVRQSKAAHYYEDSPISYGGACGYGNLALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTD

Query:  QNNDNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYG
         N  N+TD+VLS +AF AMA  + G  + LL  G+VD+EY+R+PC+Y NK + V+V E S  P YLAIK LYQGGQT++ A+ IAQVG   W  M R++G
Subjt:  QNNDNKTDIVLSKKAFSAMA--LKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYG

Query:  AIWDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSPGQCGDGQW
        A+W  + VP GALQ R VVT+ YD GK +W+  VLP +W+ G+ YD GVQI DIA E C P  C D  W
Subjt:  AIWDINSVPEGALQLRMVVTSRYDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSPGQCGDGQW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGGTTTCTCACCTTTCTCCTCTTCTTACTTGTCTCTTCAACCACTGCTTCGTTTCCTCCGTGTAATCGTTGTGTTCGTCAATCCAAAGCTGCTCATTACTACGA
AGATTCACCGATTTCATATGGTGGTGCTTGTGGTTATGGAAATTTGGCATTGGAAATATCCCAAGGGTACTTTGCAGCTGCTACATCTTCCCTTTATAGAGGAGGAGTAG
GTTGTGGTGCTTGCTATCAGGTAAGATGCAAGGACAAACGTCTGTGCAATACAGCAGGGACTAAAATAGTTTTGACAGATCAAAATAATGATAATAAAACAGATATTGTT
CTTAGTAAGAAAGCTTTCTCTGCGATGGCTTTAAAAGGAAAAGGCCAACAACTTCTAAATATCGGACTTGTTGACGTAGAATACAAGAGGATACCTTGTGAATACAAAAA
TAAAAATCTGTTGGTGCAAGTGGTAGAATGGAGCCACAAACCATACTATTTGGCCATCAAATTCCTATACCAAGGAGGTCAAACCGATATACAAGCAGTTAACATAGCTC
AGGTTGGTTTTCCAAAATGGCGTCCCATGAAAAGAAATTATGGAGCTATATGGGATATCAATTCTGTGCCTGAAGGAGCTTTACAATTGAGAATGGTAGTAACTTCAAGA
TATGATAATGGAAAATGGATTTGGGCAGGTTCTGTGCTCCCTACTGATTGGAAAATTGGAGAAATTTACGATACTGGAGTTCAAATCAACGATATTGCTCTAGAGTATTG
CTCTCCTGGGCAATGCGGTGATGGACAATGGAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGATTCACCGATTTCATATGGTGGTGCTTGTGGTTATGGAAATTTGGCATTGGAAATATCCCAAGGGTACTTTGCAGCTGCTACATCTTCCCTTTATAGAGGAGGAGTAG
GTTGTGGTGCTTGCTATCAGGTAAGATGCAAGGACAAACGTCTGTGCAATACAGCAGGGACTAAAATAGTTTTGACAGATCAAAATAATGATAATAAAACAGATATTGTT
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TATGATAATGGAAAATGGATTTGGGCAGGTTCTGTGCTCCCTACTGATTGGAAAATTGGAGAAATTTACGATACTGGAGTTCAAATCAACGATATTGCTCTAGAGTATTG
CTCTCCTGGGCAATGCGGTGATGGACAATGGAAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFLTFLLFLLVSSTTASFPPCNRCVRQSKAAHYYEDSPISYGGACGYGNLALEISQGYFAAATSSLYRGGVGCGACYQVRCKDKRLCNTAGTKIVLTDQNNDNKTDIV
LSKKAFSAMALKGKGQQLLNIGLVDVEYKRIPCEYKNKNLLVQVVEWSHKPYYLAIKFLYQGGQTDIQAVNIAQVGFPKWRPMKRNYGAIWDINSVPEGALQLRMVVTSR
YDNGKWIWAGSVLPTDWKIGEIYDTGVQINDIALEYCSPGQCGDGQWK