| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA8542646.1 hypothetical protein F0562_023855 [Nyssa sinensis] | 2.5e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAA8547639.1 hypothetical protein F0562_004068 [Nyssa sinensis] | 2.5e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAB1227682.1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 [Morella rubra] | 2.5e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 2.5e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_028094514.1 uncharacterized protein LOC114294600 [Camellia sinensis] | 1.5e-39 | 86.14 | Show/hide |
Query: PSQRIALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVI
PS + + L + ETIS+ITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELD+NLDLSKLRAHPLKPVI
Subjt: PSQRIALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVI
Query: H
H
Subjt: H
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A4D9BUR0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 7.1e-40 | 93.48 | Show/hide |
Query: FLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+L V+KETISVITNDGRNIVG+LKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELD++LDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: FLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6A1WQX6 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-39 | 96.63 | Show/hide |
Query: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+V +TISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-28 | 63.64 | Show/hide |
Query: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-28 | 63.64 | Show/hide |
Query: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-28 | 63.64 | Show/hide |
Query: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.2e-28 | 63.64 | Show/hide |
Query: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ T++VIT+DGR IVG LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: VKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 4.9e-38 | 81.25 | Show/hide |
Query: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
A T +V + ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 5.8e-10 | 40.54 | Show/hide |
Query: TFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
T + + + V+ DGR ++G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: TFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.5e-39 | 81.25 | Show/hide |
Query: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
A T +V + ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.5e-39 | 81.25 | Show/hide |
Query: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
A T +V + ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 6.4e-33 | 56.12 | Show/hide |
Query: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVL
A T +V + ISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ VL
Subjt: ALTFFLVVVKETISVITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVL
Query: GLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
GLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: GLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.8e-09 | 45.16 | Show/hide |
Query: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
V+ DGR ++G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: VITNDGRNIVGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
