; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001679 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001679
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationchr4:34238796..34241871
RNA-Seq ExpressionLag0001679
SyntenyLag0001679
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-10492.54Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-10297.81Show/hide
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XP_031744189.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 isoform X1 [Cucumis sativus]7.0e-10487.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.9e-10197.27Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.1e-10296.26Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.1e-10298.36Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.4e-10398.36Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.4e-10398.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc128.6e-6562.84Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc125.1e-6562.84Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc125.1e-6562.84Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.9e-8884.24Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.4e-8581.62Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein3.1e-8681.62Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.6e-2438.52Show/hide
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.6e-2438.52Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 11.4e-8984.24Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 11.4e-8984.24Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTGCAGGAAGGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGA
CTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGACGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGG
ATATTATCTAGGTGGTACCTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACT
TGGAAGGAAATGTTTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCTGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTGTTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAA
GACCCCCTCAACCACGACGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCAAAGATGTTCGAATCCAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTGGGGCATACTTTCTTCAC
ACGTTGCATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTGCAGGAAGGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGTTAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGA
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ACGTTGCATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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