; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0001770 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0001770
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionParalemmin-3-like
Genome locationchr4:35218798..35219942
RNA-Seq ExpressionLag0001770
SyntenyLag0001770
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
MBL8272510.1 hypothetical protein [Xanthomonadales bacterium]4.3e-0830.13Show/hide
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        T  E  EGE E  ++E  EGE +  ++E  EG  E +++    G + E        +S E      E E      +E  EG  + ++ +  EG AE  ++
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        ++ EG AE  ++   EG A   ++E  EG AE  ++E  EG AE  ++E  E + E
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MBY0356869.1 hypothetical protein [Candidatus Obscuribacterales bacterium]2.4e-1132.74Show/hide
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        GQG TF+ G G   R+ FE G G   + TF+ G G   R  F +  G  G+ +F++ +G+ G              + FE G G   + TF+ G+G   R
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          F+ G G   ++ F+ G+G   R  FE G G   + T++ G+G   R  FE G G   ++T++ GKG
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MQY29003.1 hypothetical protein [Nocardia sp. RB56]3.2e-1136.88Show/hide
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        GE    R  F+ G G VER+  + GE    R  F T   RS            GE H +           F+ G G VERS    G   A R AF+ G  
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         A+RS  + G   A R  F+ G G AER+  + GEG A R  FE G G VERS  + G+G
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XP_041723493.1 paralemmin-3 isoform X1 [Coregonus clupeaformis]2.5e-0835.48Show/hide
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        T +LGEG+++  T +LGEG+++  T +LGEG ++  T     G  GE    T  G                    +LGEG ++  T  LGEG  +     
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        LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG +E
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XP_041723494.1 paralemmin-3 isoform X2 [Coregonus clupeaformis]2.5e-0835.48Show/hide
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        T +LGEG+++  T +LGEG+++  T +LGEG ++  T     G  GE    T  G                    +LGEG ++  T  LGEG  +     
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        LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG +E
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6A0H0F1 Uncharacterized protein5.6e-0641.41Show/hide
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        G GA+ER     G GA ER A + G GA ER     G GA ER     G GA ER     G GA ER     G  A+ER     G GA   QT    +G
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A0A6F9C7M5 Uncharacterized protein (Fragment)6.7e-0732.26Show/hide
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        T +LGEG+++  T +LGEG+++  T +LGEG ++  T                                      +LGEG ++  T  LGEG  +     
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        LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG  +  T +LGEG +E
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A0A7K0DTB0 Uncharacterized protein1.5e-1136.88Show/hide
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        GE    R  F+ G G VER+  + GE    R  F T   RS            GE H +           F+ G G VERS    G   A R AF+ G  
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Query:  AAERSTFELGEGAAERSTFELGEGAAERNTFELGEGAAERNTFELGEGAVERSTFELGKG
         A+RS  + G   A R  F+ G G AER+  + GEG A R  FE G G VERS  + G+G
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A0A7R9YR70 Hypothetical protein3.3e-0635.8Show/hide
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        M+RL +       +  + T   +GE   ER    +GE   E+    +GE A ER+  R      GE+   T     GE H +    E+       +GE A
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Query:  VERSTFKLGEGAAERSAFKLGEGAAERSTFELGEGAAERSTFELGEGAAERNTFELGEGAAERNTFELGEGAVERS
         ER+  ++GE A ER+A    E AAER+   +GE AAE +   +GE AAER    +GE AAER    +GE AVER+
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A0A7R9YSL2 Hypothetical protein3.3e-0635.8Show/hide
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        M+RL +       +  + T   +GE   ER    +GE   E+    +GE A ER+  R      GE+   T     GE H +    E+       +GE A
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         ER+  ++GE A ER+A    E AAER+   +GE AAE +   +GE AAER    +GE AAER    +GE AVER+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTCAATCGCCGTCAACTATGAAGATGAAATGACGCCGTCAACTGCAGCCGACTTTGAAGATGAAGCGACGCCGTCAACCGTCGCCAACTTTAAAGATGAAGCGGG
GCCGTCAACCACTTCCAAGTTTGAAGATGAAGCAAGGCCAACTTTGAAGATGAAGCGACGCCGTCAATCGCCACCAACTTTGAAGATGAAGAGGGATCATTCAACTGCCG
CCAACTTTGAAGATGAAGGGACATCGTCAACCGCCGCCAACTTTGAAAATGAAGCGAGGCAAACTTTGAAGATGAAGCGACGCCGTCAAGTGACACCAACTTTGACGATG
AAGCGACTCTGTCAACCGCTGCCAACTTTTAAAATGAAGAGGGGTCAGGGAACTACCTTCGAACTTGGAGAAGGAGAAGTGGAGAGAAACACTTTCGAACTTGGAGAGGG
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AGCGGAGAGAAACACTTTCGAACTTGGAGAGGGAGCAGCGGAGAGAAACACTTTCGAACTTGGAGAGGGAGCAGTGGAGAGAAGCACCTTCGAACTTGGAAAAGGAGCAA
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TTGGAGGATCCTTCAAACTTGGAGGAAGGAAACTACAGTGAAGCATCGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSIAVNYEDEMTPSTAADFEDEATPSTVANFKDEAGPSTTSKFEDEARPTLKMKRRRQSPPTLKMKRDHSTAANFEDEGTSSTAANFENEARQTLKMKRRRQVTPTLTM
KRLCQPLPTFKMKRGQGTTFELGEGEVERNTFELGEGEVERNTFELGEGAVERSTFRTWRGRSGEKHFRTWRGSSGEKHLSNLEREQWREAPFELGEGAVERSTFKLGEG
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LEDPSNLEEGNYSEAS