; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002015 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002015
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionacidic repeat-containing protein
Genome locationchr4:38265569..38265904
RNA-Seq ExpressionLag0002015
SyntenyLag0002015
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648245.1 hypothetical protein Csa_018446, partial [Cucumis sativus]6.3e-3070Show/hide
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XP_008467303.1 PREDICTED: probable beta-tubulin polyglutamylase [Cucumis melo]6.3e-3073.33Show/hide
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        +E+DD
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XP_011654865.2 probable serine/threonine-protein kinase kinX isoform X2 [Cucumis sativus]4.4e-3170Show/hide
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        +E+DD  + +
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XP_031740824.1 midasin-like [Cucumis sativus]6.3e-3070Show/hide
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        +E+DD  + +
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XP_031742149.1 probable serine/threonine-protein kinase kinX isoform X1 [Cucumis sativus]3.7e-3067.54Show/hide
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        PAVPKSQKR+  A T +RTET+++GA  QRVYSTRRSVRLLEKNMES+SLG D KMEPITVHMSFD+MPN + +    +KE+M+LE +SKKTDESVSKL+
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        EDL +E+DD  + +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJF8 Uncharacterized protein1.3e-2867.27Show/hide
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        PAVPKSQKR+  A T +RTET+++GA  QRVYSTRRSVRLLEKNMESLSL  D KMEPITVHM FD+MP  +  MKE+M+LE +SKKTDES SKL+E+L 
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        +E+DD  + +
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A0A1S3CT90 probable beta-tubulin polyglutamylase3.1e-3073.33Show/hide
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A0A5A7UN97 Putative beta-tubulin polyglutamylase1.5e-2972.38Show/hide
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        +E+DD
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A0A6J1ELB4 uncharacterized protein LOC111435613 isoform X27.5e-2966.36Show/hide
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        PAVPKSQKR+  A T +RT+TRNNGA+  RVYSTRRSVRLLE+ MESLSL ED KMEP TVHMSFDEMPNS+G +KE+  LE++SK TD+S SKL+EDL 
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        L+ ++  + +
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A0A6J1HZT2 uncharacterized protein LOC111469129 isoform X21.3e-2864.55Show/hide
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        PA PKSQ+ +    T +RT+TRNNG + QRVYSTRRSVRLLE+ MESLSL ED KM+PITVHMSFDE+PNS+G +KE+  LE++SKKTDES SKL+EDL 
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Query:  LEIDDPRRRK
        LE ++  + +
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTGCTGTACCTAAAAGCCAGAAGAGAATTGTGGTGGCTTTGACATGTAGAAGAACTGAGACTCGGAATAATGGAGCTATAGTGCAACGAGTGTATAGTACAAGAAG
GTCTGTTAGATTGTTGGAGAAGAACATGGAGAGCTTGAGTTTAGGGGAAGATGGGAAAATGGAGCCAATTACTGTCCATATGTCGTTCGATGAAATGCCCAACAGTACAG
GACTCATGAAGGAGGACATGGACTTAGAAATTAAGTCAAAGAAAACCGATGAATCAGTAAGCAAATTAGAGGAGGATTTGGATTTGGAAATTGATGATCCACGCCGAAGA
AAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTGCTGTACCTAAAAGCCAGAAGAGAATTGTGGTGGCTTTGACATGTAGAAGAACTGAGACTCGGAATAATGGAGCTATAGTGCAACGAGTGTATAGTACAAGAAG
GTCTGTTAGATTGTTGGAGAAGAACATGGAGAGCTTGAGTTTAGGGGAAGATGGGAAAATGGAGCCAATTACTGTCCATATGTCGTTCGATGAAATGCCCAACAGTACAG
GACTCATGAAGGAGGACATGGACTTAGAAATTAAGTCAAAGAAAACCGATGAATCAGTAAGCAAATTAGAGGAGGATTTGGATTTGGAAATTGATGATCCACGCCGAAGA
AAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPAVPKSQKRIVVALTCRRTETRNNGAIVQRVYSTRRSVRLLEKNMESLSLGEDGKMEPITVHMSFDEMPNSTGLMKEDMDLEIKSKKTDESVSKLEEDLDLEIDDPRRR
K