; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002068 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002068
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionNAC domain-containing protein
Genome locationchr4:38967266..38968087
RNA-Seq ExpressionLag0002068
SyntenyLag0002068
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003441 - NAC domain
IPR036093 - NAC domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576006.1 NAC domain-containing protein 21/22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-7072.49Show/hide
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KAG7014527.1 NAC domain-containing protein 21/22, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-7072.49Show/hide
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         DEITT  T+INQ FDM A    SSS Y  +S VQ P+A D N + W NIN  ++A G               FEIEDSIQNGFFP+EY
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XP_022155089.1 NAC domain-containing protein 21/22-like [Momordica charantia]1.1e-7475Show/hide
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        KRDEITT   T I +     A T A SSFYS  S+VQFP A D N LP+NN+N+  E EAGGL SNGVDDST QQ KFE ED IQNGFF F+YF A
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XP_023548957.1 NAC domain-containing protein 21/22-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-7273.82Show/hide
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XP_038897326.1 NAC domain-containing protein 21/22-like [Benincasa hispida]2.4e-7776.02Show/hide
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        KRDEIT +IT IN+ FD +   SASS   SP SY+QFP A D N+LPWNNIN   E A G+R N VD   STIQQMKFEIEDSIQN FFPFEYF A
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6U0 NAC domain-containing protein3.4e-6969.31Show/hide
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        VAK+NGKEWYFFSFRDRKY  GERANRATI GYWKATGKDR+V+NP    +++GMRKTLVFY  RAP GIKT WIMHEFRIQ P  PPKEDWVLC+VF+K
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        S+  +E T DIT+IN+V   V   SASSS  SPSSY+QF  A D N+LPW NNI   N+EE  GG + NGVD    STIQQMKFEIEDSIQN F PF+YF
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         A
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A0A6J1DP70 NAC domain-containing protein 21/22-like5.4e-7575Show/hide
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        KRDEITT   T I +     A T A SSFYS  S+VQFP A D N LP+NN+N+  E EAGGL SNGVDDST QQ KFE ED IQNGFF F+YF A
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A0A6J1DVN6 NAC domain-containing protein 21/22-like5.8e-6166.33Show/hide
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        VAKLNG EWYFFSFRDRKY+TG R NRAT  GYWKATGKDRMVM+P   +++GMRKTLVFY  RAPNGIKTGWIMHEFRI+TPHMPPKEDWVLCRVF+KS
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        K D+  T+ T   Q F   A  + SSSF SP +++ QF    DA   LPW+  NMEE A   R NGV  DS +Q+MKFEI D++QNG FPF YF A
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A0A6J1GPI1 NAC domain-containing protein 21/22-like1.1e-7072.49Show/hide
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         DEITT  T INQ+FDM A    SSS Y  +S VQ P+A D N + W NIN  ++A G               FEIEDSIQNGFFP+EY
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A0A6J1JWJ8 NAC domain-containing protein 21/22-like2.4e-7071.43Show/hide
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        KLNG EWYFF+FRDRKYATG+RANRAT+ GYWKATGKDR VMNPKT ++IGMRKTLVFY KRAPNGIKTGWIMHEFRIQTPHMPPKEDWVLCRVFYKSK 
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        DEITT  T+INQ FDM A    SSS Y  +  VQ P+  D+NR+ W NIN  +EA G               FEIEDSIQNGFFP+EYF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04017 Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 22.2e-2855.24Show/hide
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        AK+  KEWYFFS RDRKY TG R NRAT  GYWKATGKDR + + KT  ++GM+KTLVFY  RAP G K+ W+MHE+R++            K++WV+ R
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        VF K+
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Q5CD17 NAC domain-containing protein 771.7e-2844.59Show/hide
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        AK+  KEWYFFS +D KY TG R NRAT  GYWKATGKDR +               + K +Q++GM+KTLVFY  RAP G KT W+MHEFR+      H
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         P     PK++WV+C+VF+K + DE   +  Q  Q   +  +++ + +  S SS VQ
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Q84TE6 NAC domain-containing protein 21/223.8e-3350Show/hide
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        +A + GK+WYF+S RDRKYATG R NRAT  GYWKATGKDR ++  +  +++GMRKTLVFY  RAP G KT W+MHEFR+Q  H P       PKEDWVL
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        CRVF+K+    I  D   +   FD  A  S          Y+ F   P +
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Q9S851 Protein CUP-SHAPED COTYLEDON 31.8e-3057.28Show/hide
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        +AK+  +EWYF+S RDRKY TG R NRAT  GYWKATGKD+ V +    Q++GM+KTLVFY  RAP G+KT W+MHE+R++  H      KE+WV+CRVF
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Query:  YKS
         K+
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Q9SQQ6 NAC domain-containing protein 462.8e-2848.15Show/hide
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        +AK+  KE+YFF  RDRKY TG R NRAT+ GYWKATGKD+ +   K   ++GM+KTLVFYT RAP G KT W+MHE+R+    + H  PK   ++WV+C
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Query:  RVFYKSKRDEITTDITQINQV--FDMVAHTSASSS
        RVF+K+      T   Q++++   D + H    SS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56010.1 NAC domain containing protein 12.7e-3450Show/hide
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        +A + GK+WYF+S RDRKYATG R NRAT  GYWKATGKDR ++  +  +++GMRKTLVFY  RAP G KT W+MHEFR+Q  H P       PKEDWVL
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        CRVF+K+    I  D   +   FD  A  S          Y+ F   P +
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AT1G56010.2 NAC domain containing protein 12.7e-3450Show/hide
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        +A + GK+WYF+S RDRKYATG R NRAT  GYWKATGKDR ++  +  +++GMRKTLVFY  RAP G KT W+MHEFR+Q  H P       PKEDWVL
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        CRVF+K+    I  D   +   FD  A  S          Y+ F   P +
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AT1G76420.1 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein1.3e-3157.28Show/hide
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        +AK+  +EWYF+S RDRKY TG R NRAT  GYWKATGKD+ V +    Q++GM+KTLVFY  RAP G+KT W+MHE+R++  H      KE+WV+CRVF
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Query:  YKS
         K+
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AT3G12977.1 NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein1.3e-3156.52Show/hide
Query:  AKLNGKEWYFFSFRDRKYATGERANRATIGGYWKATGKDRMVMNPKTRQIIGMRKTLVFYTKRAPNGIKTGWIMHEFRIQ---TPHMPP--KEDWVLCRV
        A++ GKEWYF+S +DRKYATG R NRAT  GYWKATGKDR +   +   ++GMRKTLVFY  R+P G KT W+MHEFR+Q     H P   +E+WVLCRV
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Query:  FYKSKRDEITTDITQ
        F+K+       DIT+
Subjt:  FYKSKRDEITTDITQ

AT4G28530.1 NAC domain containing protein 741.4e-4679.21Show/hide
Query:  VAKLNGKEWYFFSFRDRKYATGERANRATIGGYWKATGKDRMVMNPKTRQIIGMRKTLVFYTKRAPNGIKTGWIMHEFRIQTPHMPPKEDWVLCRVFYKS
        VAKLN KEWYFFSFRDRKYATG R NRAT+ GYWKATGKDR VM+P+TRQ++GMRKTLVFY  RAPNGIKT WIMHEFR++ P++PPKEDWVLCRVF K 
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Query:  K
        +
Subjt:  K


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTGGCAAAGCTAAATGGAAAAGAATGGTATTTCTTCAGCTTTAGAGATAGAAAATATGCAACAGGAGAGAGGGCAAACCGTGCAACAATAGGAGGATACTGGAAAGCAAC
TGGAAAAGATCGAATGGTGATGAATCCAAAAACTCGTCAGATCATTGGAATGAGAAAAACTTTGGTATTTTACACAAAAAGAGCTCCAAATGGCATCAAAACTGGTTGGA
TTATGCATGAATTTCGGATTCAGACCCCACACATGCCCCCAAAGGAGGACTGGGTTTTGTGCAGAGTCTTTTACAAGAGCAAGCGAGACGAGATCACCACAGACATAACA
CAGATCAATCAGGTGTTTGACATGGTGGCGCACACCTCCGCTTCGTCGTCGTTCTATTCGCCGTCGAGCTACGTCCAGTTTCCGACTGCACCGGACGCCAATAGGCTGCC
ATGGAACAACATCAATATGGAAGAAGAAGCTGGAGGCTTAAGGTCAAATGGAGTTGATGATTCAACCATACAGCAAATGAAGTTTGAGATTGAAGATAGCATCCAAAATG
GCTTCTTCCCTTTTGAGTATTTTGATGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGGCAAAGCTAAATGGAAAAGAATGGTATTTCTTCAGCTTTAGAGATAGAAAATATGCAACAGGAGAGAGGGCAAACCGTGCAACAATAGGAGGATACTGGAAAGCAAC
TGGAAAAGATCGAATGGTGATGAATCCAAAAACTCGTCAGATCATTGGAATGAGAAAAACTTTGGTATTTTACACAAAAAGAGCTCCAAATGGCATCAAAACTGGTTGGA
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CAGATCAATCAGGTGTTTGACATGGTGGCGCACACCTCCGCTTCGTCGTCGTTCTATTCGCCGTCGAGCTACGTCCAGTTTCCGACTGCACCGGACGCCAATAGGCTGCC
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GCTTCTTCCCTTTTGAGTATTTTGATGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VAKLNGKEWYFFSFRDRKYATGERANRATIGGYWKATGKDRMVMNPKTRQIIGMRKTLVFYTKRAPNGIKTGWIMHEFRIQTPHMPPKEDWVLCRVFYKSKRDEITTDIT
QINQVFDMVAHTSASSSFYSPSSYVQFPTAPDANRLPWNNINMEEEAGGLRSNGVDDSTIQQMKFEIEDSIQNGFFPFEYFDA