; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002239 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002239
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationchr4:40805983..40807182
RNA-Seq ExpressionLag0002239
SyntenyLag0002239
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-8282.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein1.8e-8181.46Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988821.1e-8082.41Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein2.7e-8282.35Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557808.7e-8181.68Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883501.1e-8081.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.7e-2844Show/hide
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        RVKEDPR +   G   Y++     S G             SEES S SS   SR+ +  E +EDVLVVAGCK C MYFMVPK  +DCPKC +++L+HFD+
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)2.1e-3448.77Show/hide
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        RVKEDPR    A+    D Y    SE+D S  D  SEES S SS             ++   E EEDVLVVAGCK CFMYFMVPK VEDCPKC +++L+H
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        FDR
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AT2G33510.2 unknown protein2.2e-3145.41Show/hide
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        M  IT+SLE+S  + SLN R                 G  RSSS+             H     D TLELNSH+SLP  WEQCLDLK             
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCGATTACCGATTCACTCGAGCAGTCTTTCCGTAGCTTCTCCCTCAATCACCGTCTCGCCTCGCCTGCCTCTGCGGCCGCGTCTTCGGCGGCGCCGCCTTCCCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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