; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002257 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002257
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationchr4:40971072..40972459
RNA-Seq ExpressionLag0002257
SyntenyLag0002257
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-18085.5Show/hide
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KAG7014636.1 hypothetical protein SDJN02_24815 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.7e-17480.62Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]1.1e-18084.73Show/hide
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]1.2e-17985.25Show/hide
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]9.7e-18286.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein5.2e-18184.73Show/hide
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A0A1S3CB81 extensin5.8e-18085.25Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.2e-18085.5Show/hide
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A0A6J1GPH0 formin-2-like2.3e-17380.38Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like3.2e-17079.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.1e-3745.09Show/hide
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        SL +FLF    F      S   ++P P     IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E +TFS NRTT+++G+Y++ I S+D
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           C D  ++ S CQASLIG    S   CN+PG RTTT+++  KS+Q N C++  NAL++RP K++ +LCG K
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AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein9.2e-0537.2Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLP----------PFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPL
        LS  P+   +  CG   +  P  +T         PP S P P PP P          P P  P PP+   PP PP PP  Y P P  P PP  P   PP 
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLP----------PFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPL

Query:  PPLFPSPP----SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFTPPPPPP--SAPPPFSLSDPRTWIPHRPQNMDSQYSSLFSFSPPPFDPRDPRTWIPNIP
        PP  P PP    SPPPPS PPPPPP     P    P   P   PPPPP  S+PPP     P      RP           S  PP F P  P  +  + P
Subjt:  PPLFPSPP----SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFTPPPPPP--SAPPPFSLSDPRTWIPHRPQNMDSQYSSLFSFSPPPFDPRDPRTWIPNIP

Query:  PFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPP
        P   S PPP  P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  PFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.7e-4944.44Show/hide
Query:  ISLLLFLFTAS-FFHDSFGLTAPTPA------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL  LF AS   H + G     P+        +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLFLFTAS-FFHDSFGLTAPTPA------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTTEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH-------KKAKNPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T T E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+       K  K       SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTTEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH-------KKAKNPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFTP
        +  PY FP+              P P LPPLP LPPFP FP       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+  F P
Subjt:  FFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFTP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.2e-3847.02Show/hide
Query:  ISLLLFLFTASFFHDSFGLTAPTPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN
        I LLL L   S   +S  L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E +TFS NRTT++ G+Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLFLFTASFFHDSFGLTAPTPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGIN

Query:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTTEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG
        C       ++ + CQASLIG S   CNVPG RTTTE++  KSK  NLC++   AL++RPL+KN  LCG
Subjt:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTTEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCAACCATTTCTCTCCTTCTCTTCCTTTTTACTGCATCTTTCTTTCATGACTCGTTTGGTCTAACGGCTCCAACCCCTGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
CGGCGCGGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAATGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCA
AAATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGTGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACA
ATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACAACGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACCGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGTTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCATTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCA
TTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCC
TCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTACTCCACCACCACCTCCGCCATCTGCACCACCTC
CATTTAGTCTCAGTGATCCAAGAACCTGGATACCCCATAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCCTTTTCTCCTTCTCCCCTCCTCCATTTGATCCTAGAGAC
CCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCCTTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCC
CCCACCTCCTACATTTGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGGCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCAACCATTTCTCTCCTTCTCTTCCTTTTTACTGCATCTTTCTTTCATGACTCGTTTGGTCTAACGGCTCCAACCCCTGCTTCGGTCACTCGAATCACGGTAGT
CGGCGCGGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTGTCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTTCATTTACAATGCAAATTCAGAGCAGTTGCTCCCA
AAATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGTGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACA
ATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACAACGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACCGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGTTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCATTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCA
TTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCC
TCCATCTGCACCACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTACTCCACCACCACCTCCGCCATCTGCACCACCTC
CATTTAGTCTCAGTGATCCAAGAACCTGGATACCCCATAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCCTTTTCTCCTTCTCCCCTCCTCCATTTGATCCTAGAGAC
CCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCCTTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCC
CCCACCTCCTACATTTGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGGCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSTISLLLFLFTASFFHDSFGLTAPTPASVTRITVVGAVYCDTCLSNSVSKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMT
MQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTTEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPP
LPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFTPPPPPPSAPPPFSLSDPRTWIPHRPQNMDSQYSSLFSFSPPPFDPRD
PRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGTQNQKP