; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002276 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002276
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1664)
Genome locationchr4:41191153..41198181
RNA-Seq ExpressionLag0002276
SyntenyLag0002276
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR012458 - Domain of unknown function DUF1664


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592957.1 hypothetical protein SDJN03_12433, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-15887.19Show/hide
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XP_022954360.1 uncharacterized protein LOC111456627 isoform X3 [Cucurbita moschata]3.5e-15283.7Show/hide
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XP_022960503.1 uncharacterized protein LOC111461218 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.0e-15986.74Show/hide
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XP_023004218.1 uncharacterized protein LOC111497617 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.1e-15886.46Show/hide
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XP_023540888.1 uncharacterized protein LOC111801131 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-15283.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GQP9 uncharacterized protein LOC111456627 isoform X41.6e-15083.43Show/hide
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A0A6J1GQW5 uncharacterized protein LOC111456627 isoform X15.4e-15183.24Show/hide
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A0A6J1GS76 uncharacterized protein LOC111456627 isoform X31.7e-15283.7Show/hide
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A0A6J1H958 uncharacterized protein LOC111461218 isoform X12.4e-15986.74Show/hide
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A0A6J1KYT8 uncharacterized protein LOC111497617 isoform X15.4e-15986.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24265.1 Protein of unknown function (DUF1664)8.5e-6443.84Show/hide
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        G G++GS  +KEG LP VS+ VSGAFK+  ++L +D+ S S SKP +D L+AQV SL+ E+Q+L SNRP+TIV+  G GGR YG+II+V V+GYG+VW K
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          +SSS  NT SNG     G   S S+    G   +  + RTR+ ++ V
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AT1G24265.2 Protein of unknown function (DUF1664)8.5e-6443.84Show/hide
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        G G++GS  +KEG LP VS+ VSGAFK+  ++L +D+ S S SKP +D L+AQV SL+ E+Q+L SNRP+TIV+  G GGR YG+II+V V+GYG+VW K
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Query:  ELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQLEGTTDS
        ++T  GV  L  +A   EN+R  E  +A+PS+S  PALE  P  PS K   L P   SP+   SPS    + N  Q  R  LQ+T S  GL  +      
Subjt:  ELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQLEGTTDS

Query:  NVQSSSILNTMSNGNGISTGISTSDSTRSETGNSGLGFLTRTRSAMSAV
          +SSS  NT SNG     G   S S+    G   +  + RTR+ ++ V
Subjt:  NVQSSSILNTMSNGNGISTGISTSDSTRSETGNSGLGFLTRTRSAMSAV

AT1G24265.3 Protein of unknown function (DUF1664)1.2e-6243.64Show/hide
Query:  IVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMKGWK
        ++GS  +KEG LP VS+ VSGAFK+  ++L +D+ S S SKP +D L+AQV SL+ E+Q+L SNRP+TIV+  G GGR YG+II+V V+GYG+VW KGWK
Subjt:  IVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMKGWK

Query:  LPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLCSFEEKQELT
        LPD MFAT+RSLSDAC++V  Q++  YSS+  TKR LSS++D + + LD + ++  +T + V++L+  +     D+K+V  A + L +K+C  E  Q++T
Subjt:  LPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLCSFEEKQELT

Query:  NEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQLEGTTDSNVQ
          GV  L  +A   EN+R  E  +A+PS+S  PALE  P  PS K   L P   SP+   SPS    + N  Q  R  LQ+T S  GL  +        +
Subjt:  NEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQLEGTTDSNVQ

Query:  SSSILNTMSNGNGISTGISTSDSTRSETGNSGLGFLTRTRSAMSAV
        SSS  NT SNG     G   S S+    G   +  + RTR+ ++ V
Subjt:  SSSILNTMSNGNGISTGISTSDSTRSETGNSGLGFLTRTRSAMSAV

AT1G24267.1 Protein of unknown function (DUF1664)2.0e-6849.03Show/hide
Query:  GIGIVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMK
        G G+VGSVLAKEG LP VS FVSGA K+  ++L +++ + S SKPRND+LMAQV SL+ EL +L+SNRP+TIVTT G GG+KYG II++ V+GYG+VW K
Subjt:  GIGIVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMK

Query:  GWKLPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLCSFEEKQ
        GWKLPD+MFAT+RSLSDAC+SV  Q++  Y+S++ TK+ LSSK+D + +SLD + ++  DT   V EL+  ++    D+K V  AV+ L +K+   E  Q
Subjt:  GWKLPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLCSFEEKQ

Query:  ELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQL------
        ++T +GV  L  +A   EN+R  E  +A+PS+S  PALE  P TPS +   L P   SP    SPS SNG+    Q  R  LQ+T S  GL ++      
Subjt:  ELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQL------

Query:  EGTTDSNVQS
         G T  N  S
Subjt:  EGTTDSNVQS

AT1G24267.2 Protein of unknown function (DUF1664)2.8e-6749.2Show/hide
Query:  GIGIVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMK
        G G+VGSVLAKEG LP VS FVSGA K+  ++L +++ + S SKPRND+LMAQV SL+ EL +L+SNRP+TIVTT G GG+KYG II++ V+GYG+VW K
Subjt:  GIGIVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYGIIILVVVVGYGFVWMK

Query:  GWKLPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLC-SFEEK
        GWKLPD+MFAT+RSLSDAC+SV  Q++  Y+S++ TK+ LSSK+D + +SLD + ++  DT   V EL+  ++    D+K V  AV+ L  KL    E  
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Query:  QELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQL-----
        Q++T +GV  L  +A   EN+R  E  +A+PS+S  PALE  P TPS +   L P   SP    SPS SNG+    Q  R  LQ+T S  GL ++     
Subjt:  QELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQL-----

Query:  -EGTTDSNVQS
          G T  N  S
Subjt:  -EGTTDSNVQS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCGGCGTATGTTATTTCGATAGCGGGAAGGTTTTTCCCCCTAATATGAGTGGAAGCTATCGTCTGTTTGAGTCTGGCATCGGTATTGTTGGCTCTGTTCTGGCAAA
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ACTCTTTAATGGCCCAGGTAAAAAGCTTACAGCAGGAACTGCAAATGTTAGCATCAAATCGTCCAATGACAATTGTAACTACTGGCGGGAAAGGGGGCAGGAAATATGGC
ATAATCATTCTTGTAGTTGTAGTAGGATATGGGTTCGTTTGGATGAAGGGATGGAAACTTCCTGATATGATGTTTGCTACAAAGCGTAGTCTATCTGATGCTTGCAGTTC
CGTTGCTAGACAGCTTGAGAATGTTTACTCATCCATCGCGGCTACAAAACGGAACTTATCTTCAAAAATGGACCATGTTGACAAAAGTTTGGATGAATCTTTGGATCTCA
CTGCTGATACACAAGAAAATGTTTCAGAACTACGAGGTAGATCAGATACTTTTGGCAGGGATATTAAATCCGTTCATCATGCAGTCCAGACTTTGGAAAATAAACTATGT
AGTTTTGAAGAAAAGCAGGAACTAACAAATGAAGGTGTTAGGAGATTGTGTAATTATGCTTGGAACCTGGAGAATCGAAGGACCACAGAACGTGTTCAGGCAATTCCTTC
TAGTTCCCCAAGGCCGGCTCTTGAACTCCCTCCAACAACACCTTCACCAAAGCAAAATCGGTTGTTTCCAATTGGTTTTTCACCAGAAGCGCTGTCGTCTCCCTCCGAGT
CTAATGGTTCTTCTAACCAGGTTCAAGTTCAACGGCGATCCCTCCAAAATACTGTCTCGGACCCCGGCTTGATGCAGTTAGAAGGAACTACAGATTCAAATGTGCAATCG
AGCAGCATCCTCAATACAATGTCCAATGGGAATGGTATATCTACTGGGATCAGTACATCGGATTCGACCAGAAGTGAGACTGGGAATTCTGGTCTTGGATTTCTTACCAG
AACAAGGAGTGCAATGAGTGCAGTATTCCGGCAGACTCGCCCAAGTGTTCAATCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIGVCYFDSGKVFPPNMSGSYRLFESGIGIVGSVLAKEGRLPYVSDFVSGAFKIALKRLSRDDSSTSKSKPRNDSLMAQVKSLQQELQMLASNRPMTIVTTGGKGGRKYG
IIILVVVVGYGFVWMKGWKLPDMMFATKRSLSDACSSVARQLENVYSSIAATKRNLSSKMDHVDKSLDESLDLTADTQENVSELRGRSDTFGRDIKSVHHAVQTLENKLC
SFEEKQELTNEGVRRLCNYAWNLENRRTTERVQAIPSSSPRPALELPPTTPSPKQNRLFPIGFSPEALSSPSESNGSSNQVQVQRRSLQNTVSDPGLMQLEGTTDSNVQS
SSILNTMSNGNGISTGISTSDSTRSETGNSGLGFLTRTRSAMSAVFRQTRPSVQS