CuGenDBv2

Gene ID	Lag0002478
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Auxin response factor
Genome location	chr4:43223068..43224653
RNA-Seq Expression	Lag0002478
Synteny	Lag0002478
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022150155.1 uncharacterized protein LOC111018405 [Momordica charantia]

2.8e-83

86.26

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILIPA+R+VS++NSS FCSDF VPFT+ KR I+FRAS PQ L  NG+RH+QTTP SY RYGPPYGEEDDDPE+QVESLRVPDDWSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEIS+VAANSYYNSLLEKRTDLGDILL MARELESISYKESFHGAF SANAAVNLIAQ+IE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

XP_022959936.1 uncharacterized protein LOC111460840 [Cucurbita moschata]

6.0e-78

83.52

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P++R+VSITNSS F SDF V FTSRKR ++FRAS PQ LPCN +   + TP SYIRYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLLEKRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

XP_023004672.1 uncharacterized protein LOC111497897 [Cucurbita maxima]

4.6e-78

84.07

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P++R+VSITNSS F SDFSV FTSRKR ++FRAS PQ LPCN +   + TP SYIRYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLLEKRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

XP_023515033.1 uncharacterized protein LOC111779179 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.1e-78

84.07

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P++R+VSITNSS F SDFSV FTSRKR ++FRAS PQ LPCN +   + TP SYIRYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLLEKRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

XP_038896861.1 uncharacterized protein LOC120085084 [Benincasa hispida]

1.6e-83

87.36

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILIPA+++V ITNSS FCS FS+PFTSRKR I+F+   PQ L CNGLRH+Q TP SYI  GPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LR TLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLL+KRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BS97 uncharacterized protein LOC103492727

1.0e-75

82.42

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILIP +++VSITNSS F   FS  F+SRKR I+F    PQ L  NG  H+QTT  SYIR GPPYGEEDDDPEL+VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLL+K TDLG+ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

A0A5D3D403 Uncharacterized protein

1.0e-75

82.42

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILIP +++VSITNSS F   FS  F+SRKR I+F    PQ L  NG  H+QTT  SYIR GPPYGEEDDDPEL+VESLRVPD+WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLL+K TDLG+ILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

A0A6J1D9Y8 uncharacterized protein LOC111018405

1.3e-83

86.26

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLILIPA+R+VS++NSS FCSDF VPFT+ KR I+FRAS PQ L  NG+RH+QTTP SY RYGPPYGEEDDDPE+QVESLRVPDDWSVP+KALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEIS+VAANSYYNSLLEKRTDLGDILL MARELESISYKESFHGAF SANAAVNLIAQ+IE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

A0A6J1H695 uncharacterized protein LOC111460840

2.9e-78

83.52

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P++R+VSITNSS F SDF V FTSRKR ++FRAS PQ LPCN +   + TP SYIRYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLLEKRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

A0A6J1KR31 uncharacterized protein LOC111497897

2.2e-78

84.07

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW
        MESLIL+P++R+VSITNSS F SDFSV FTSRKR ++FRAS PQ LPCN +   + TP SYIRYGPPYG++DDDPE QVESLRVPD WSVPSKALEESEW
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEW

Query:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS
        LRVTLHKWLD+EYCPEETNVEISKVAA SYYNSLLEKRT+L DILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE S
Subjt:  LRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G03150.1 unknown protein

9.3e-45

50.52

Show/hide

Query:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRA------------SRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDW
        M S +    TRNV  ++          P T R+R++ F A            S P+F P   L+ SQ++            E ++D E  V++L +P++W
Subjt:  MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRA------------SRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDW

Query:  SVPSKALEESEWLRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE
         +PS+A+EESEWLRVTLHKWLDDEYCPE TNVEIS+VAA SYY+SLLEK +D+G+ILL MA++L SISY+ESFHGAF+SANAA+NLI  RIE
Subjt:  SVPSKALEESEWLRVTLHKWLDDEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIE

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGTCTCTGATCTTGATTCCAGCAACCAGAAACGTTTCAATCACAAATTCTTCTCCATTTTGCTCCGATTTCTCCGTTCCATTCACGTCTAGAAAGCGCACCATCGA
CTTCCGAGCATCCCGTCCGCAGTTTCTCCCTTGCAATGGCCTTCGACATTCACAAACAACTCCGATGTCTTATATTCGATACGGTCCGCCGTATGGTGAGGAAGATGATG
ATCCTGAATTGCAGGTTGAAAGCCTGAGGGTTCCGGATGATTGGTCGGTCCCTTCCAAGGCATTGGAGGAATCAGAATGGCTTAGGGTTACCCTGCACAAATGGTTAGAT
GATGAGTACTGTCCAGAGGAAACTAATGTAGAGATAAGCAAGGTTGCTGCAAATTCATACTACAATTCTTTGTTAGAGAAGAGGACAGACCTAGGCGATATTTTGTTGAA
CATGGCAAGAGAATTGGAATCTATTTCCTATAAGGAAAGTTTTCACGGTGCATTCTCTTCTGCCAATGCAGCAGTGAACTTAATTGCTCAAAGAATAGAGCCGTCTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MESLILIPATRNVSITNSSPFCSDFSVPFTSRKRTIDFRASRPQFLPCNGLRHSQTTPMSYIRYGPPYGEEDDDPELQVESLRVPDDWSVPSKALEESEWLRVTLHKWLD
DEYCPEETNVEISKVAANSYYNSLLEKRTDLGDILLNMARELESISYKESFHGAFSSANAAVNLIAQRIEPS

Lag0002478 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome