; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002534 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002534
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationchr4:43653558..43653914
RNA-Seq ExpressionLag0002534
SyntenyLag0002534
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.4e-4983.9Show/hide
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XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]1.6e-4479.66Show/hide
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XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]2.2e-4985.59Show/hide
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XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]1.4e-4883.9Show/hide
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XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.4e-5086.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein8.0e-4579.66Show/hide
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A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like3.0e-4479.66Show/hide
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A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like3.0e-4479.66Show/hide
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A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 331.1e-4985.59Show/hide
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A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like7.0e-4983.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.5e-2758.18Show/hide
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        P   I+AILTV       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEMDSEINRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+
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Q945T0 Rapid alkalinization factor6.1e-2654.05Show/hide
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        L  C ++    +S  A  A  + +  WV+   +   C GS+ +C+ ++ EFE+DSE NRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+PGA+ANPY+
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        RGC+AI RCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.4e-2250.82Show/hide
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        I+ IL V + +V A S++S  +  D     T C G++A+C +        D+         EFEMDSEINRRILA  +YISY AL+ N +PCSRRGASYY
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        NC+ GA+ANPY+RGC+AI RCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.4e-2453.21Show/hide
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        ++AIL +  +AV +T    +S  +V  G+    + C GS+A+C+ ++ E E DS+I+RRILA  KYISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+R
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Query:  GCNAIARCR
        GC+ I RCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.8e-2557.8Show/hide
Query:  IVAILTVSSTAV---LATSTESPSWVLDGAR-TRCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I+ +  +SS  V    A      +W   G   + CHGS+A+C+  + E EMDSEINRRILA  KYISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RG
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        C+ IARCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.3e-2657.8Show/hide
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        I+ +  +SS  V    A      +W   G   + CHGS+A+C+  + E EMDSEINRRILA  KYISY +LK N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+RG
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Query:  CNAIARCRS
        C+ IARCRS
Subjt:  CNAIARCRS

AT2G33775.1 ralf-like 192.9e-1545.28Show/hide
Query:  IVAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARTRCHGSMAKCMMDD--IEFEMDSEINRRILADLK-YISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGC
        I+ IL + + AV+A S  + +W L  +     G    C+ +D  +++ MDSE NRR LA  + YISY AL+ N VPCSRRG SYY+C+    ANPY RGC
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Query:  NAIARC
        + I  C
Subjt:  NAIARC

AT3G05490.1 ralf-like 222.4e-2553.21Show/hide
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        ++AIL +  +AV +T    +S  +V  G+    + C GS+A+C+ ++ E E DS+I+RRILA  KYISY A++ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY+R
Subjt:  IVAILTVSSTAVLATST--ESPSWVLDGAR---TRCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNR

Query:  GCNAIARCR
        GC+ I RCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.0e-2350.82Show/hide
Query:  IVAILTVSSTAVLATSTESPSWVLD--GARTRCHGSMAKCMMD-------DI---------EFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYY
        I+ IL V + +V A S++S  +  D     T C G++A+C +        D+         EFEMDSEINRRILA  +YISY AL+ N +PCSRRGASYY
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Query:  NCQPGAEANPYNRGCNAIARCR
        NC+ GA+ANPY+RGC+AI RCR
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AT4G15800.1 ralf-like 333.9e-2858.18Show/hide
Query:  PFCFIVAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARTRCHGSMAKCMMD--DIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYN
        P   I+AILTV       TS  S  +V     ++C+G++A+C +   + EFEMDSEINRRILA  KYISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY+
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Query:  RGCNAIARCR
        RGC+AI RCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCCATTTTGCTTCATCGTTGCAATCCTTACCGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACAAGCACCGAGAGTCCGAGCTGGGTCCT
GGATGGAGCTCGAACTCGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATGGACGACATTGAATTCGAGATGGACTCAGAAATCAATAGGCGCATATTGGCAGATCTAAAGT
ACATAAGCTACGACGCACTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACAACCGTGGCTGC
AATGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCAAGGTTTCTTTTCTCCTTCCATTTTGCTTCATCGTTGCAATCCTTACCGTCTCCTCCACTGCAGTATTGGCCACAAGCACCGAGAGTCCGAGCTGGGTCCT
GGATGGAGCTCGAACTCGCTGTCACGGCTCCATGGCAAAGTGCATGATGGACGACATTGAATTCGAGATGGACTCAGAAATCAATAGGCGCATATTGGCAGATCTAAAGT
ACATAAGCTACGACGCACTCAAGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACAACCGTGGCTGC
AATGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKVSFLLPFCFIVAILTVSSTAVLATSTESPSWVLDGARTRCHGSMAKCMMDDIEFEMDSEINRRILADLKYISYDALKANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYNRGC
NAIARCRS