| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.8e-112 | 87.98 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAE A Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 8.1e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 8.1e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 6.2e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.5e-111 | 87.6 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLI S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVST+TLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3CEQ4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 5.8e-109 | 87.11 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
MASISSIL+PTNLIH S K E Q LSSQFLRPISFH H LLR+SP A + P RLFAVAEAATQ SSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV+E
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
Query: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNT VDLS LQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
Subjt: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
Query: SEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
SEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: SEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 5.8e-109 | 87.11 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
MASISSIL+PTNLIH S K E Q LSSQFLRPISFH H LLR+SP A + P RLFAVAEAATQ SSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV+E
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEE
Query: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNT VDLS LQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
Subjt: HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFF
Query: SEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
SEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: SEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 3.9e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 3.9e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 3.0e-113 | 88.37 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NLIH S K E PQ LS+QFLRPISFH R+TLLR+SPGLQ+SA KR RLFAVAEAA Q+PSSVA RKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLIHCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAA--TQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT VD+S LQA+ESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Subjt: EEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKN
Query: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
FFSEK KVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTF SEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
Subjt: FFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 8.0e-31 | 38.59 | Show/hide |
Query: SVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSF-LQAEE
SV +LY+GN+P ++ + +L+ I E G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + ++VGGRT+KVN E P +S +++
Subjt: SVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSF-LQAEE
Query: SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
F+DSP+K+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + +S G+GF+TF S E + +A+ + N LEG+P+R+N A
Subjt: SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.9e-72 | 58.02 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLI-HCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVAT-----RKLYIGNIPRNVDNEEL
MA+ISSIL L+ HCS+ S + K SSQ L + L+L + ++ R E ++ + +S ++ R+LY+GNIPRN++N+EL
Subjt: MASISSILSPTNLI-HCSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVAT-----RKLYIGNIPRNVDNEEL
Query: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTE
IVEEHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLN+TE+GGR IKVNITEKPL +D++ QAE+SQF++SPYKVY+GN++ TV+ E
Subjt: TRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTE
Query: TLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
LK+FFSEK KVL AKV R PGTSKS+G+GFV+F SEEEVEAAI + NN++LEGQ IRVNKA
Subjt: TLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 8.0e-31 | 36.08 | Show/hide |
Query: VAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL-VNTA
V E +S +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P
Subjt: VAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL-VNTA
Query: VDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V + ++ ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: VDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 9.7e-69 | 68.84 | Show/hide |
Query: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
+AV E A +PSS A R++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP
Subjt: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
Query: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ ++ DLS LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTF SEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| Q9ZUU4 RNA-binding protein CP29B, chloroplastic | 3.2e-27 | 38.24 | Show/hide |
Query: AATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLS
A + S A KL++GN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N E+ GR ++VN P +
Subjt: AATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLS
Query: FLQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIR
F + S F S +VYVGN+S V L++ FSE+ KV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IR
Subjt: FLQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIR
Query: VNKA
V++A
Subjt: VNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.8e-31 | 34.6 | Show/hide |
Query: MASISSILS------PTNLIH-CSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEE
MA+ S +LS NL+H C+ S +T + + +P+ R R ++ K +A +P + KLY GN+P NVD+
Subjt: MASISSILS------PTNLIH-CSTKSIETPQKLSSQFLRPISFHRRHTLLRLSPGLQSSATKRPARLFAVAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEE
Query: LTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVST
L +I+++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V+D N I+ L+ TE GR +KVN +KP N +E + ++ +K++VGN+S TV++
Subjt: LTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVST
Query: ETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
E+L F E V+ A+V T +S GYGFV + S+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: ETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-28 | 38.24 | Show/hide |
Query: AATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLS
A + S A KL++GN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N E+ GR ++VN P +
Subjt: AATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTAVDLS
Query: FLQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIR
F + S F S +VYVGN+S V L++ FSE+ KV+ A+V + +S G+GFVT+ S +EV+ AI S + A L+G+ IR
Subjt: FLQAEESQF--------------IDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIR
Query: VNKA
V++A
Subjt: VNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.9e-70 | 68.84 | Show/hide |
Query: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
+AV E A +PSS A R++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP
Subjt: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
Query: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ ++ DLS LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTF SEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.9e-70 | 68.84 | Show/hide |
Query: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
+AV E A +PSS A R++YIGNIPR V NE+LT++VEEHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP
Subjt: FAVAEA----ATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKP
Query: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
+ ++ DLS LQ+E+S F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTF SEE+VEAAI + NN+LLEGQ IRVNKA
Subjt: LVNTAVDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 5.7e-32 | 36.08 | Show/hide |
Query: VAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL-VNTA
V E +S +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P
Subjt: VAEAATQNPSSVATRKLYIGNIPRNVDNEELTRIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL-VNTA
Query: VDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
V + ++ ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N +EG+ +R+N A
Subjt: VDLSFLQAEESQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKVKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFPSEEEVEAAISSFNNALLEGQPIRVNKA
|
|
