; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0002819 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0002819
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationchr4:45967531..45968505
RNA-Seq ExpressionLag0002819
SyntenyLag0002819
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014205.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.1e-15492.95Show/hide
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XP_022991911.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita maxima]1.2e-15691.41Show/hide
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XP_023549060.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-15791.74Show/hide
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XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]8.3e-15590.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase5.8e-14688.16Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase1.8e-14788.79Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase5.6e-15791.44Show/hide
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase5.6e-15791.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A6.4e-1742.57Show/hide
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        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
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P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING11.4e-1633.18Show/hide
Query:  LVSPSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDS-DPSSFV----------------VVDPLP-------PASDDNYLL
        L+ PSSSS+++SSS+S                  I  ++ S+S    S    P + DP +F+                V+   P       PA+  +Y +
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Query:  SSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTP--IKASVMAIPTIKVSSSMLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCR
          P   +L QQLA++  + +         TP   K+++ A+P + ++ S L  +    CA+C D F    EAKQ+PC HLYH DC+LPWL  H+SCP+CR
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Query:  FKLPSDDPSDHVRCRGA
         +LP+DDP    R RGA
Subjt:  FKLPSDDPSDHVRCRGA

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like6.4e-1730.07Show/hide
Query:  MSSASAATAAATTAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-----V
        MSS   +T +A  A E    ++C++C+ +VT+         S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +P SS S  P +DP S ++      
Subjt:  MSSASAATAAATTAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-----V

Query:  DPLPPASDDNYLLSSPQ---------------------FLRLFQQLADSSDSDFA------PSVPFNPF-----------------------------TP
            P+  D   L  P                      FL+   Q   SS + F       PS P N                               TP
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Query:  --IKASVMAIPTIKVSSSMLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
           K+++ A+PT+KV+  ML+ + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R +G+
Subjt:  --IKASVMAIPTIKVSSSMLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF11.7e-1743.56Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSSMLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  S
        S
Subjt:  S

Q9SPL2 E3 ubiquitin-protein ligase CIP87.1e-1649.32Show/hide
Query:  KASVMAIPTIKVSSSMLEEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD
        K+++ A+ T +VSSS  E + V++CA+CKD  ++    K+LPC H YH DCI+PWL   +SCP+CRF+L +DD
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-1836.02Show/hide
Query:  LEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPPASDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSSML--
        LE  D+T P  +  +    + S+SPP             P  +  +Y  SS  F        D  +S F          P++    ++PTIK+SSSML  
Subjt:  LEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPPASDDNYLLSSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSSML--

Query:  --EEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSD
           +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP     D
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AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-1843.56Show/hide
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        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK++   L+      C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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        S
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AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein1.2e-1843.56Show/hide
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AT3G56580.3 RING/U-box superfamily protein1.2e-1843.56Show/hide
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AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein5.7e-4541.76Show/hide
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        MSS++  T       ER TYWCHECDMS++L+    SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D  I      D       D   +  VD
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        P    SDDN+LL SP   RL + LA  +    + S   +  + +K+S + +IPTI++SSS+L      + D VL+CA+CK+ F++   A++LPCSH+YH 
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        DCI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+            +R R + +A + A     ++D  G+R  LR +ARRH  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTCTCCTTTGTCCCCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCACCATCCCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCCG
ACCACCCCATTTCCTCTTCTTCCCCTCCAGATTCCGATCCCTCTTCCTTCGTCGTCGTCGACCCTCTTCCTCCGGCCTCCGATGACAATTACCTCCTCAGTAGCCCCCAA
TTCCTCCGCCTCTTCCAGCAGCTCGCCGATTCATCCGATTCCGATTTCGCCCCATCTGTGCCCTTCAACCCCTTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCAC
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TTTACCATCCGGATTGTATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGCTTTAAGCTTCCTTCTGATGACCCTTCTGATCATGTCAGATGTAGAGGG
GCGACTATGGCCTTGTTGAGGGCTAGGGATTTGATGCATCAGGAGGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTCTGCGGCATATTGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTTTAGTGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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