CuGenDBv2

Gene ID	Lag0003988
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Reticulon family protein
Genome location	chr6:212028..212949
RNA-Seq Expression	Lag0003988
Synteny	Lag0003988
Gene Ontology terms	GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR044177 - Reticulon-like protein B22/B23

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7020756.1 Reticulon-like protein B22 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.7e-57

92.25

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK +L
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYL

XP_011655303.1 reticulon-like protein B22 [Cucumis sativus]

4.2e-56

87.12

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IG R EGL+DT+MA+R+INCKTEVGKP VALICGSLVYYHCA+RNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQ+SQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK  + L+
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH

XP_022952032.1 reticulon-like protein B22 isoform X1 [Cucurbita moschata]

1.0e-57

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

XP_022952033.1 reticulon-like protein B23 isoform X2 [Cucurbita moschata]

1.0e-57

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

XP_038889154.1 reticulon-like protein B22 [Benincasa hispida]

1.6e-58

89.39

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IGRR+EGL++TEMANRTINCKTEVGKP VALICGSL+YYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSM+AW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK  + L+
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KQM7 Reticulon domain-containing protein

2.0e-56

87.12

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IG R EGL+DT+MA+R+INCKTEVGKP VALICGSLVYYHCA+RNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQ+SQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK  + L+
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLH

A0A6J1GJ96 reticulon-like protein B22 isoform X1

4.9e-58

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

A0A6J1GJC4 reticulon-like protein B23 isoform X2

4.9e-58

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

A0A6J1I734 reticulon-like protein B22 isoform X1

4.9e-58

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

A0A6J1ICJ8 reticulon-like protein B23 isoform X2

4.9e-58

82.78

Show/hide

Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK             +SLY    LGRL
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRL

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P0C941 Reticulon-like protein B23

1.3e-36

74.77

Show/hide

Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVY+HCA RN++LLSL++DV IVLL SLAILGLLFRH+NVSVPVDPLEWQISQDTA +++A LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  KEYLKLH
        K  + L+
Subjt:  KEYLKLH

Q8GWH5 Reticulon-like protein B22

1.1e-38

76.64

Show/hide

Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVYYHCAYRN++LLSL +DVFIVLLCSLAILGLLFR +NVSVPVDPLEWQISQDTA++++A LANT+GAAE VLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  KEYLKLH
        K  + L+
Subjt:  KEYLKLH

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G16825.1 Reticulon family protein

9.5e-38

74.77

Show/hide

Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVY+HCA RN++LLSL++DV IVLL SLAILGLLFRH+NVSVPVDPLEWQISQDTA +++A LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  KEYLKLH
        K  + L+
Subjt:  KEYLKLH

AT1G78895.1 Reticulon family protein

7.7e-40

76.64

Show/hide

Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVYYHCAYRN++LLSL +DVFIVLLCSLAILGLLFR +NVSVPVDPLEWQISQDTA++++A LANT+GAAE VLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  KEYLKLH
        K  + L+
Subjt:  KEYLKLH

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAACCTAATTGGGCGGAGGAGCGAGGGCTTGAAAGACACAGAGATGGCGAATCGTACGATTAACTGCAAGACAGAAGTAGGGAAACCCCTTGTAGCTCTGATTTGCGG
TTCATTGGTCTATTACCATTGCGCCTATCGAAATTCCAGTCTCCTCTCCCTCGTTGCTGACGTTTTCATCGTTCTCCTTTGCTCTCTCGCCATTCTCGGCCTTCTCTTCC
GCCATATGAATGTCTCGGTACCGGTGGACCCTCTTGAGTGGCAAATATCGCAGGATACTGCTAATAGTATGATTGCTTGGTTAGCCAATACCTTAGGTGCGGCTGAGTCT
GTTCTGAGGGTAGCAGCAACGGGGCATGACAAGAGGCTTTTTGTTAAGGAGTATTTGAAATTGCATACTAGCAAGAAGTACACGTTCATTTCTTTGTACAATCCAATTTG
CCTGGGACGTTTGAAGGCGAAGGCCTTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAES
VLRVAATGHDKRLFVKEYLKLHTSKKYTFISLYNPICLGRLKAKAF

Lag0003988 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome