; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0004703 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0004703
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix protein 2
Genome locationchr6:6234627..6236046
RNA-Seq ExpressionLag0004703
SyntenyLag0004703
Gene Ontology termsGO:0043622 - cortical microtubule organization (biological process)
GO:0051211 - anisotropic cell growth (biological process)
GO:0055028 - cortical microtubule (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061022.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]6.3e-13093.09Show/hide
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KAG7029244.1 hypothetical protein SDJN02_07582 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-12890.91Show/hide
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XP_022961987.1 flocculation protein FLO11 [Cucurbita moschata]1.2e-12890.91Show/hide
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XP_031737323.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform X1 [Cucumis sativus]4.6e-13394.18Show/hide
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XP_031737324.1 serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus]4.6e-13394.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKP5 Uncharacterized protein2.3e-13394.18Show/hide
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A0A5A7UYP7 Serine/arginine repetitive matrix protein 23.0e-13093.09Show/hide
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A0A6J1BQQ5 uncharacterized protein LOC111004588 isoform X13.7e-12890.91Show/hide
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A0A6J1BT22 uncharacterized protein LOC111004588 isoform X23.7e-12890.91Show/hide
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A0A6J1HBJ8 flocculation protein FLO115.7e-12990.91Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27850.1 unknown protein1.6e-7862.55Show/hide
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        MPPSPALR SPGREL G  H+RGHS E G+  R+KDDDLALF+E+Q +ER+ FLLQS++DLED FSTKL+HFS+     ++P +GE+S LL   EG+KND
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         DWLLTPPDTPLFPSLDD+PP  ++  RGRP+SQ IS+SRSSTMEKS RS  S+GS SPNRLS SPR A+++ Q+RGR  SA H SP          RRS
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         TP RR SP P  PS  V RS TPT RR+STGS+ T  +   RG SP+ S RGNS SPKI+ WQ+NIPGFS DAP
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AT2G40070.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proline-rich family protein (TAIR:AT3G09000.1)1.9e-1235.98Show/hide
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        EKD++L+LF E++ RE+E    LL +     D F T L  +H +     IS    P+R    D   N EG+KND +WLLTPP TPLFPSL+ E     ++
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Query:  SRGRPRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRS-SPPPSTPSTSVPRSSTPT
          G  +S+P ++  +S +  S   S +R   +  + + SP  ++S    R      P SS  P  R ATP+ RS+T T  S S  PSTP++    SS   
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Query:  PRRLSTGSSRTAVT
        P   ++ S+ +A T
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AT2G40070.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown7.7e-0933.33Show/hide
Query:  VRIREKDDDLALFNELQTREREGFLLQSAEDLEDSFSTKL--RHFSDLKLGIS---VPARGENSDLLNNVEGEKNDCDWLLTPPDTPLFPSLDDEPPPVT
        +R REK+ D  L N                +  D F T L  +H +     IS    P+R    D   N EG+KND +WLLTPP TPLFPSL+ E     
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Query:  IASRGRPRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRS-SPPPSTPSTSVPRSST
        ++  G  +S+P ++  +S +  S   S +R   +  + + SP  ++S    R      P SS  P  R ATP+ RS+T T  S S  PSTP++    SS 
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Query:  PTPRRLSTGSSRTAVT
          P   ++ S+ +A T
Subjt:  PTPRRLSTGSSRTAVT

AT3G08670.1 unknown protein5.3e-1030.77Show/hide
Query:  RGSNHKRGHSFESGVRIREKDDDLALFNELQTREREGFLLQSAEDLEDSFSTKLRHFSDLKLGISVPARGENSDLLNNVEGEKNDCDWLLTPPDTPLFPS
        RG+N+   +  ++G   R+ D++L LF+++    R  F L S+++L D  S KL     L +G  +  +G++ DLL++ EG KND DWLLTPP TPL   
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Query:  LDDEPPPVTIASRGR----PRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRSSPPP
                 IAS  R     ++  +S+S+S +   S R + S     P+ +S S  S+ +  +     L+   +S +  +R ++PS RS+     SS  P
Subjt:  LDDEPPPVTIASRGR----PRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRSSPPP

Query:  STPSTSVPRSSTPTPRRLSTGSSRTAV-----TSGARGASPIKSVRGNSASPKIRAWQTN
        STP+ +   S + TP R+  GSS +++     +  +R ++P    + +++SP I A + N
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AT3G09000.1 proline-rich family protein3.2e-0732.11Show/hide
Query:  EKDDDLALFNELQTRERE---GFLLQSAED------LEDSFSTKLRHFSDLKLGISVPARGENSDLLNNVEGEKNDCDWLLTPPDTPLFPSLDDEPPPVT
        ++D++L+LF E++ RE+E     LL  +++      L  + +  L   S+       P R   ++     E EK+D DWLLTPP TP F   + E     
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Query:  IASRGRPRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRSSPPPSTPSTSVPRSSTP
        +     P S+P       T+ KS   +      S N   P   S++    + G +  +   S   + R ATP+RRSTTPT  +S P +T +++  RSSTP
Subjt:  IASRGRPRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRSSPPPSTPSTSVPRSSTP

Query:  TPR--------RLSTGSSRTAVTS--GARGASPIKS-VRGNSASPK
        T R          ST + RT  TS   AR A+P +S  R +SAS K
Subjt:  TPR--------RLSTGSSRTAVTS--GARGASPIKS-VRGNSASPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTCCTTCTCCAGCATTGAGAAGCTCTCCTGGTAGAGAGCTCAGAGGCAGCAATCATAAGAGAGGCCACAGCTTTGAGAGTGGTGTGCGCATAAGAGAGAAAGATGA
CGATCTTGCTTTGTTTAATGAGCTGCAGACTCGAGAGAGAGAGGGTTTCCTGCTTCAGTCGGCAGAGGACTTGGAGGACTCATTTTCTACAAAGTTGAGGCACTTTTCAG
ATTTGAAGCTTGGTATCTCCGTTCCTGCTCGTGGAGAGAATAGTGACTTGCTTAATAATGTAGAAGGGGAGAAAAACGACTGTGACTGGTTGTTAACACCTCCCGACACC
CCTCTTTTCCCTTCATTGGACGATGAGCCGCCTCCAGTTACTATTGCAAGCAGGGGGCGACCTCGTAGTCAACCCATTTCCATATCAAGGTCATCCACGATGGAAAAAAG
TCACAGAAGCAGTACGAGTAGGGGTAGTCCAAGTCCTAATCGTTTAAGCCCATCTCCTAGGTCAGCAAACAGTGTGCCTCAAATGCGGGGAAGGCAACTGTCAGCCCCAC
ATTCCAGCCCAACTCCAAGTCTTCGACATGCTACACCTTCCAGAAGATCAACTACCCCAACAAGAAGATCTTCACCTCCTCCAAGTACGCCATCAACATCTGTGCCAAGG
TCTTCAACCCCAACTCCCAGGAGGTTGAGCACGGGGTCCAGTCGAACTGCTGTTACATCTGGGGCAAGGGGAGCTTCACCCATAAAGTCAGTCAGAGGAAATTCTGCCTC
ACCTAAAATCAGAGCATGGCAAACTAATATTCCTGGTTTCTCTTCTGATGCTCCCCTAACCTCCGGACATCTCTGGCTGACCGGCCAGCATCATATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGATCTTGCTTTGTTTAATGAGCTGCAGACTCGAGAGAGAGAGGGTTTCCTGCTTCAGTCGGCAGAGGACTTGGAGGACTCATTTTCTACAAAGTTGAGGCACTTTTCAG
ATTTGAAGCTTGGTATCTCCGTTCCTGCTCGTGGAGAGAATAGTGACTTGCTTAATAATGTAGAAGGGGAGAAAAACGACTGTGACTGGTTGTTAACACCTCCCGACACC
CCTCTTTTCCCTTCATTGGACGATGAGCCGCCTCCAGTTACTATTGCAAGCAGGGGGCGACCTCGTAGTCAACCCATTTCCATATCAAGGTCATCCACGATGGAAAAAAG
TCACAGAAGCAGTACGAGTAGGGGTAGTCCAAGTCCTAATCGTTTAAGCCCATCTCCTAGGTCAGCAAACAGTGTGCCTCAAATGCGGGGAAGGCAACTGTCAGCCCCAC
ATTCCAGCCCAACTCCAAGTCTTCGACATGCTACACCTTCCAGAAGATCAACTACCCCAACAAGAAGATCTTCACCTCCTCCAAGTACGCCATCAACATCTGTGCCAAGG
TCTTCAACCCCAACTCCCAGGAGGTTGAGCACGGGGTCCAGTCGAACTGCTGTTACATCTGGGGCAAGGGGAGCTTCACCCATAAAGTCAGTCAGAGGAAATTCTGCCTC
ACCTAAAATCAGAGCATGGCAAACTAATATTCCTGGTTTCTCTTCTGATGCTCCCCTAACCTCCGGACATCTCTGGCTGACCGGCCAGCATCATATGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PLFPSLDDEPPPVTIASRGRPRSQPISISRSSTMEKSHRSSTSRGSPSPNRLSPSPRSANSVPQMRGRQLSAPHSSPTPSLRHATPSRRSTTPTRRSSPPPSTPSTSVPR
SSTPTPRRLSTGSSRTAVTSGARGASPIKSVRGNSASPKIRAWQTNIPGFSSDAPLTSGHLWLTGQHHM