| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6598277.1 putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.4e-132 | 93.13 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EEL V LGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMR SNLKVLITSATLDGDKVSKFFF+CP+LTVPGKLYPVEILY+NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDA++LPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| XP_022132197.1 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 [Momordica charantia] | 1.7e-133 | 93.89 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVV+IGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRE+LSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGL+KRLIR+R SNLKVLITSATLDGDKVSKFF NCPVLTVPGKLYPVEILY NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHT+EPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| XP_022132198.1 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X2 [Momordica charantia] | 1.7e-133 | 93.89 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVV+IGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRE+LSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGL+KRLIR+R SNLKVLITSATLDGDKVSKFF NCPVLTVPGKLYPVEILY NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHT+EPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| XP_022996739.1 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 [Cucurbita maxima] | 3.7e-133 | 93.51 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGV LGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMR SNLKVLITSATLDGDKVSKFFF+CP+LTVPGKLYPVEILY+NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDA++LPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| XP_038884454.1 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 [Benincasa hispida] | 3.7e-133 | 93.13 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQN V+VIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERT+IKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTD LMGLMKRLIRMR SNLKVLITSATL+GDKVSKFFF+CPVLTVPGKLYPVEILY+NERPKSY+ESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDA+ILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LNH6 Uncharacterized protein | 1.5e-132 | 93.13 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQN VVVIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTD LMGLMKRLIRMR S+LKVLITSATLDGDKVSKFFF+CPVLTVPGKL+PVEILY+NERPKSY+ESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIF+TGQDDIEKLVSKLEE+VY+LEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| A0A6J1BT65 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 | 8.1e-134 | 93.89 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVV+IGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRE+LSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGL+KRLIR+R SNLKVLITSATLDGDKVSKFF NCPVLTVPGKLYPVEILY NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHT+EPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| A0A6J1BVL0 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X2 | 8.1e-134 | 93.89 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVV+IGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGVHLGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRE+LSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGL+KRLIR+R SNLKVLITSATLDGDKVSKFF NCPVLTVPGKLYPVEILY NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHT+EPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| A0A6J1HH01 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 | 1.2e-132 | 93.13 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EEL V LGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMR SNLKVLITSATLDGDKVSKFFF+CP+LTVPGKLYPVEILY+NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDA++LPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| A0A6J1K9J4 probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 isoform X1 | 1.8e-133 | 93.51 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MAQLPILQFEEKIIETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQMLHR+GYTKSG+IGVTQPRRVAAVSVARRV+EELGV LGEEVGYAIRFEDR+SERTRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMR SNLKVLITSATLDGDKVSKFFF+CP+LTVPGKLYPVEILY+NERPKSYLESC
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK A++IHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEE+VYNLEEGSCMDA++LPLHGSLPPELQ
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| F4K2E9 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH7 | 4.1e-74 | 50.57 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI +++++ + +N V+V++GETGSGK+TQL+Q LH GYT +G++G TQPRRVAA+SVA+RVSEE+ LG+++GYAIRFED + T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
VLLRE+L D +L +Y V+++DEAHERSLNTD+L G++K+++ R+ + K+++TSATL+ K S FF + P+ +PG+ +PV ILY+ + Y+E+ +K
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMD---AIILPLHGSLPPELQA
AM IH P GD+LIFMTGQD+IE L+ER+ L S + +ILP++ LP +LQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMD---AIILPLHGSLPPELQA
|
|
| Q17R09 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 | 5.3e-74 | 51.15 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI +++++ + N +V+++GETGSGK+TQL+Q LH GYT G+IG TQPRRVAA+SVA+RVSEE+G +LGEEVGYAIRFED +SE T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRESL + +L YS II+DEAHERSLNTD+L GL++ ++ R+S+LK+++TSAT+D +K + FF N P+ +PG+ +PV+IL++ + Y+E+ +K
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
++++H GD+LIFM GQ+DIE ++ E + LE + +LP++ LP +LQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| Q38953 Probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH5 | 6.3e-75 | 53.46 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI + ++++I+ V N V+V+IGETGSGK+TQ++Q L GYT G IG TQPRRVAA+SVA+RV+EE G LGEEVGYAIRFED + T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRE L D L QYSVI+LDEAHER+++TD+L GL+K+L++ R+ +L++++TSATLD +K S +FFNC + T+PG+ +PVEILY + YL++ L
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
++IH EPEGD+L+F+TGQ++I+ L ER+ L + + + IILP++ +LP E+Q+
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| Q92620 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 | 5.3e-74 | 51.15 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI +++++ + N +V+++GETGSGK+TQL+Q LH GYT G+IG TQPRRVAA+SVA+RVSEE+G +LGEEVGYAIRFED +SE T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRESL + +L YS II+DEAHERSLNTD+L GL++ ++ R+S+LK+++TSAT+D +K + FF N P+ +PG+ +PV+IL++ + Y+E+ +K
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
++++H GD+LIFM GQ+DIE ++ E + LE + +LP++ LP +LQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| Q93Y16 Probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH4 | 6.6e-117 | 80.92 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MA LPILQFEEKI+ETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQ+LHR GYTKSGVI +TQPRRVAAVSVARRV++EL V LGE+VGYAIRFEDR++ +TRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLS+P L YSVIILDEAHERSLNTDIL+GL+KRL+R+R SN KVLITSATLDG+KVS+FF CPVL VPGKLYPVEILY+ ERP SY+ES
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK+A++IH +EPEGD+LIFMTGQDDIEKLVS+LEE+V +L EGSCMDAII PLHGSLPPE+Q
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G27900.1 RNA helicase family protein | 4.7e-118 | 80.92 | Show/hide |
Query: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
MA LPILQFEEKI+ETVE+N VVVIIGETGSGKSTQLSQ+LHR GYTKSGVI +TQPRRVAAVSVARRV++EL V LGE+VGYAIRFEDR++ +TRIKYL
Subjt: MAQLPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYL
Query: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
TDGVLLRESLS+P L YSVIILDEAHERSLNTDIL+GL+KRL+R+R SN KVLITSATLDG+KVS+FF CPVL VPGKLYPVEILY+ ERP SY+ES
Subjt: TDGVLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESC
Query: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
LK+A++IH +EPEGD+LIFMTGQDDIEKLVS+LEE+V +L EGSCMDAII PLHGSLPPE+Q
Subjt: LKMAMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQ
|
|
| AT1G32490.1 RNA helicase family protein | 5.1e-72 | 50.77 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI + +++++ VE++ V+VI+G+TGSGK+TQ+ Q LH GYTK G +G TQPRRVAA+SVA RV++E+GV LG EVGY+IRFED +S++T +KY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRE L +P+L YSV+I+DEAHER+L+TDIL GL+K + R R +LK+LI+SAT+D +K S +F P+ + PG+ YPVEI Y + Y+++ +
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
+ IH +EP GD+L+F TGQ++IE L+ R+ L + II P++ +LP ELQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| AT1G32490.2 RNA helicase family protein | 5.1e-72 | 50.77 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI + +++++ VE++ V+VI+G+TGSGK+TQ+ Q LH GYTK G +G TQPRRVAA+SVA RV++E+GV LG EVGY+IRFED +S++T +KY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRE L +P+L YSV+I+DEAHER+L+TDIL GL+K + R R +LK+LI+SAT+D +K S +F P+ + PG+ YPVEI Y + Y+++ +
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
+ IH +EP GD+L+F TGQ++IE L+ R+ L + II P++ +LP ELQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| AT3G26560.1 ATP-dependent RNA helicase, putative | 4.5e-76 | 53.46 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI + ++++I+ V N V+V+IGETGSGK+TQ++Q L GYT G IG TQPRRVAA+SVA+RV+EE G LGEEVGYAIRFED + T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
+LLRE L D L QYSVI+LDEAHER+++TD+L GL+K+L++ R+ +L++++TSATLD +K S +FFNC + T+PG+ +PVEILY + YL++ L
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
++IH EPEGD+L+F+TGQ++I+ L ER+ L + + + IILP++ +LP E+Q+
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMDAIILPLHGSLPPELQA
|
|
| AT5G13010.1 RNA helicase family protein | 2.9e-75 | 50.57 | Show/hide |
Query: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
LPI +++++ + +N V+V++GETGSGK+TQL+Q LH GYT +G++G TQPRRVAA+SVA+RVSEE+ LG+++GYAIRFED + T IKY+TDG
Subjt: LPILQFEEKIIETVEQNPVVVIIGETGSGKSTQLSQMLHRKGYTKSGVIGVTQPRRVAAVSVARRVSEELGVHLGEEVGYAIRFEDRSSERTRIKYLTDG
Query: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
VLLRE+L D +L +Y V+++DEAHERSLNTD+L G++K+++ R+ + K+++TSATL+ K S FF + P+ +PG+ +PV ILY+ + Y+E+ +K
Subjt: VLLRESLSDPELGQYSVIILDEAHERSLNTDILMGLMKRLIRMRKSNLKVLITSATLDGDKVSKFFFNCPVLTVPGKLYPVEILYNNERPKSYLESCLKM
Query: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMD---AIILPLHGSLPPELQA
AM IH P GD+LIFMTGQD+IE L+ER+ L S + +ILP++ LP +LQA
Subjt: AMEIHTKEPEGDVLIFMTGQDDIEKLVSKLEERVYNLEEGSCMD---AIILPLHGSLPPELQA
|
|
