| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 6.9e-117 | 95.24 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
|
|
| KAG6598682.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 8.5e-115 | 94.42 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDR H+SERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSAS SDRSMSPAR+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSDDE SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo] | 7.7e-116 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 6.5e-115 | 94.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+T PSR RSDDE SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_022997247.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 2.5e-114 | 94.02 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDR H+SERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSAS SDRSMSPAR+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 3.1e-115 | 94.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+T PSR RSDDE SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.7e-116 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.4e-117 | 95.24 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDR H+SERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSAS SDRSMSP R+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
|
|
| A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.7e-114 | 94.02 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDR H+SERER+RSRSRSASPDR KDR RGRDD ERRSAS SDRSMSPAR+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSDDE SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 1.2e-114 | 94.02 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDR H+SERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSAS SDRSMSPAR+S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.6e-26 | 44.54 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S R+ R + + RS SRS RS S +R+ P
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
Query: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
T S R + SR RS + G+
Subjt: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.6e-26 | 44.1 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S R+ R + + RS SRS RS S +R+ P
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
Query: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.6e-26 | 44.1 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S R+ R + + RS SRS RS S +R+ P
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
Query: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.6e-26 | 44.1 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S R+ R + + RS SRS RS S +R+ P
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSP
Query: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: DTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGS
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.1e-64 | 63.57 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R +R K R R+RSRSASPD K R R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
Query: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
GR D+E RS SRS S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.3e-12 | 38.55 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ E +K M + + GR
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSD-RSM
SRSRSP RSR D Y R + RS S ERYD R + SR RS +P R K R RRS SRS RS
Subjt: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSD-RSM
Query: SPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP
SP SP RS+SPRR+ SR SP+R S +P SRS SP
Subjt: SPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.8e-09 | 34.02 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRS-----RERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSD-RSMSP
R + ++ R + R RSP R R R RSRSR +R+ + +R + RS S SP N R R +S SRS RS+SP
Subjt: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRS-----RERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSD-RSMSP
Query: ARN-----------SPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKR
+N SP R+S SP P RG + + SP +
Subjt: ARN-----------SPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKR
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 6.0e-10 | 33.5 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRG--
LL+ N+ +DL F+++G + D+++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+ N + ++ R +S G
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRG--
Query: -RSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPS
R+ RSPR R+R R R RR S+ R D L+ S R R RS SRS P RN+ + R+ + R +R ++P R+ R +S R+ S
Subjt: -RSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPS
Query: RGR
R
Subjt: RGR
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-65 | 63.57 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R +R K R R+RSRSASPD K R R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
Query: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
GR D+E RS SRS S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-65 | 63.57 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R +R K R R+RSRSASPD K R R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRLHKSERERHRSRSRSASPDRNKDRRR
Query: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
GR D+E RS SRS S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: GRDDDERRSASRSDRSMSPARNSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEDSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
