; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0004890 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0004890
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr6:8147874..8148398
RNA-Seq ExpressionLag0004890
SyntenyLag0004890
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008004 - Protein OCTOPUS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598702.1 hypothetical protein SDJN03_08480, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-3161.82Show/hide
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KAG7029644.1 hypothetical protein SDJN02_07984, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-3061.21Show/hide
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XP_008444863.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis melo]4.3e-3359.49Show/hide
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        MPKN     SKLK HAA    A MAR+S+HG   GGG  +CRKHPKHKQSPGVCS+CLREKL NLTIT +  S++ ++S  + S SSSSLSSLSSYYSSS
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        SPSSSSSPYF  +K S SSMSS LFKRR +++  +SS +  +        +  K  H GFWSKLMMNRRGKEIVEE TLR S+++    HQT+ +
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XP_022131967.1 uncharacterized protein LOC111004952 [Momordica charantia]1.5e-3063.19Show/hide
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        M KNL KLKDHAAAA   A AR S  GGGGRCRKHPKH+QSPGVCSLCLREKLS L  T   GS+  K A     S SSSSLSS+SS YSS SS SS SS
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        P     RK S S MSSLFKRRS+A N L+SSRSLAD         G WSKL++NRRGK   E+TLRRS S T DHHH  + +
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XP_031736533.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Cucumis sativus]6.9e-3156.44Show/hide
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         +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPJ0 Uncharacterized protein3.3e-3156.44Show/hide
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A0A1S3BC83 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like2.1e-3359.49Show/hide
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A0A6J1BSJ2 uncharacterized protein LOC1110049527.4e-3163.19Show/hide
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A0A7N2QY54 Uncharacterized protein1.7e-1451.03Show/hide
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               D D  K+   GFWS L+  R  ++  EE+L  S + R+
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B9GUZ8 Uncharacterized protein2.4e-1350Show/hide
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        G+C+KHPKHKQSPGVCS+CL EKLS L+ T +S ++++ST    CSSS  SSLSSYYSSSS  S SSP     +P +    S+ SLF  +S  NFLT SR
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Query:  SLA--DGDRKKESHH-----GFWSKLMMNRRGKEIVEETLRRSTSTRD
        SLA       K+ H      G WSKL+   + K+ VEE L  S + R+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22470.1 unknown protein1.6e-0647.22Show/hide
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        C+KHPKH+QSPG+CSLCL E LS L+      + S ++ + +  M SCSS+S  S        +SSYYSS S
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AT1G35210.1 unknown protein3.3e-0740.62Show/hide
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        C+KHPKH+QSPGVCSLCL E+LS L I  +S+ +  S ++ S SSS+ SSLSS   SSS SS  SP   R+          +     +++T SRS+A   
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         D  R+K   +++ GF+  L+M  + ++
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AT1G72240.1 unknown protein1.3e-0848.98Show/hide
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        NS+      C+KH KH+QSPG+CSLCL E+LS L++     TK A   +T  GS S+SS SS+SS YSSSS SS SSP    Y  +K      S LF+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTGTTCAAACGAAGATCAACCGCTAATTTCTTGACCTCGAGTAGATCTCTCGCCGATGGAGATAGAAAGAAGGAATCCCATCATGGGTTTTGGTCGAAATTGATGATGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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