; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0005323 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0005323
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1645)
Genome locationchr6:14301908..14302807
RNA-Seq ExpressionLag0005323
SyntenyLag0005323
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598211.1 hypothetical protein SDJN03_07989, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-9669.18Show/hide
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XP_022961773.1 uncharacterized protein LOC111462443 [Cucurbita moschata]1.0e-9569.18Show/hide
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XP_022996541.1 uncharacterized protein LOC111491759 [Cucurbita maxima]4.3e-9769.18Show/hide
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XP_023545738.1 uncharacterized protein LOC111805087 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.3e-9769.51Show/hide
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XP_038885805.1 uncharacterized protein LOC120076099 [Benincasa hispida]5.7e-9471.32Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BQM9 uncharacterized protein LOC1110047274.0e-7763.25Show/hide
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        PF
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A0A6J1GJY5 uncharacterized protein LOC1114545811.8e-9371.91Show/hide
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A0A6J1HCS7 uncharacterized protein LOC1114624435.1e-9669.18Show/hide
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A0A6J1K530 uncharacterized protein LOC1114917592.1e-9769.18Show/hide
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A0A6J1KKS8 uncharacterized protein LOC1114966091.1e-9371.54Show/hide
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        EK          +SES++E EGVV+GTYCEWSP TAE  KKSNSTGFSKLWRFR+ MTM RSSSDGKDAFVFLSNP  +T KSP+N   KLQPQP+ ++ 
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23710.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.9e-5044.37Show/hide
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        LG        +++E +   L  ++ ++ ++ DE+E+EEFSF C+N +GSPI+AD+ F +GQIRPV+PLFNRDLLF  E++ +  D    +   RP LRKL
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        FVE R+      E+E  SE EP     G YC W     + A+ ET +KSNSTGFSKLWRFRDL+   RS+SDG+DAFVFL+N           ++S++ +
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         +N    +  + + +  TSTS+ T      + K  T  SAHE  Y+R+RA ++  K +SYLPY+Q  VGFFT+VNG S+N+HPF
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AT1G70420.1 Protein of unknown function (DUF1645)4.2e-4242.52Show/hide
Query:  SSSSSSSSSSSSSSSSTATATMNLGVSANSSLAERVETNLESLAFDDRLQLDDGDEQEDEEFSFVCLNPDGSPISADDVFHNGQIRPVYPLFNRDLLFVD
        S SS +   +     S     +N    +   ++ + E N +  ++ ++   D  DE  +E+FSF  +N D SPI+AD+ F +GQIRPVYPLFNR++ F D
Subjt:  SSSSSSSSSSSSSSSSTATATMNLGVSANSSLAERVETNLESLAFDDRLQLDDGDEQEDEEFSFVCLNPDGSPISADDVFHNGQIRPVYPLFNRDLLFVD

Query:  EDDSETPDKSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESESEPEGVVQGTYCEWS-----PATAETVKKSNSTGFSKLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVFL
         ++        +LR PL+KLFVE   T   E ES++           G YC W+      A+ ET +KSNSTGFSKLWRFRDL+   RS+SDGKDAFVFL
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Query:  SNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLNRHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF
        SN ++STS S  +   +L    +S       T T   K    K RT  SAHE  Y+R+RA ++  KR+SYLPY+   VGFFT+VNG ++NVHP+
Subjt:  SNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLNRHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF

AT3G27880.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.3e-1932.68Show/hide
Query:  EQEDEEFSFVCLNPDGSPISADDVFHNGQIRPVYPLFNRDLLFVDEDDSETPDKSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAP------ESESESESESEPEGVVQGT
        E+ D EF F          S      +G    V+P+FN++L+        + D SP    PL+ LF+ +R+   P       S  E E + E + +    
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Query:  YCEWSPA--TAET-----VKKSNSTGFS-------KLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVFLSNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLN
        YC W+PA  TA+       +KS STG S       K WR RD   + RS SDGK +  FL NPT        +K+ K       + S S +         
Subjt:  YCEWSPA--TAET-----VKKSNSTGFS-------KLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVFLSNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLN

Query:  RHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF
                SAHE  Y+R++A ++ DKRKSYLPY+QDLVG F++++ + K   PF
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AT3G62630.1 Protein of unknown function (DUF1645)5.7e-0726.95Show/hide
Query:  SPISADDVFHNGQIRP------------VYPLFNRDLLFVDEDDSETPD------------------KSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESE--
        S  SA+++F NGQI+P            + PL + +    D+DD   P+                  K+ SL  PLR    +       E E   E E  
Subjt:  SPISADDVFHNGQIRP------------VYPLFNRDLLFVDEDDSETPD------------------KSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESE--

Query:  ------SEPEGVVQGTYCEWSPATAETVKKSNSTG-FSKLWRF-RDLMTMHRSSSDGKDAFVFLSNPTTSTS--KSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTST
               E E V      E +P+ + +  +S+S G  SK W F +DL+   +S   G     F SN + S S  K  K K+ +L+ +P   T  +   S 
Subjt:  ------SEPEGVVQGTYCEWSPATAETVKKSNSTG-FSKLWRF-RDLMTMHRSSSDGKDAFVFLSNPTTSTS--KSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTST

Query:  SAPKLN--------RHKPRTA--------PSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGF-------FTSVNGFSKNVHP
           +            KP           PSAHE HY  +RAQ +  K+++YLPYR  L G        ++++NG +++++P
Subjt:  SAPKLN--------RHKPRTA--------PSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGF-------FTSVNGFSKNVHP

AT5G62770.1 Protein of unknown function (DUF1645)5.5e-1829.94Show/hide
Query:  MQASELLSFNSSSSSSSSSSSSSSSSTATATMNLGVSANSSLAERVETNLESLAFDDRLQLDDG---DEQEDEEFSFVC-LNPDGSPI-SADDVFHNGQI
        MQ S LLSF+S+S S  S SS+                 +++A RV   +E     D+ Q D     D+  D +F+F C  N    P+ +AD++F NGQI
Subjt:  MQASELLSFNSSSSSSSSSSSSSSSSTATATMNLGVSANSSLAERVETNLESLAFDDRLQLDDG---DEQEDEEFSFVC-LNPDGSPI-SADDVFHNGQI

Query:  RPVYPLFNRDLLFVDEDDSETPDKSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESESEPEGVVQGTYCEWSP---------------ATAETVKKSNSTGFS
        RP+ P      +        T       RP LRKL  E RD   P S S SE+E +  GV   TYC W P               + + +  KS+S GFS
Subjt:  RPVYPLFNRDLLFVDEDDSETPDKSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESESEPEGVVQGTYCEWSP---------------ATAETVKKSNSTGFS

Query:  KLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVF-----LSNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLNRHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSY
        K W+ R+L+ + RSSS+G D  VF      ++ T S  +  +    K+  + E R                                   +++  KR++Y
Subjt:  KLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVF-----LSNPTTSTSKSPKNKTHKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLNRHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSY

Query:  LPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF
        +PYR+D++G   +VNG S+++ PF
Subjt:  LPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGCTTCTGAGCTATTATCCTTCAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACTGCAACTGCAACCATGAACCTCGGTGTCTC
TGCTAATTCCAGCCTAGCGGAGCGGGTGGAAACGAACCTCGAATCCTTGGCTTTCGACGACAGACTGCAGCTGGACGACGGCGATGAGCAAGAAGATGAAGAGTTCTCCT
TTGTTTGCCTCAATCCTGACGGTTCCCCAATAAGCGCCGACGATGTCTTCCATAACGGCCAGATCCGCCCCGTCTACCCACTCTTCAATCGAGACCTCCTGTTTGTCGAC
GAGGACGATTCCGAAACGCCGGACAAGTCTCCATCGCTTCGGCCGCCCTTGAGGAAGCTGTTCGTCGAAAAGCGCGATACCTTAGCACCCGAATCGGAATCGGAGTCCGA
GTCCGAGTCGGAGCCGGAGGGAGTTGTTCAGGGCACCTACTGTGAATGGTCTCCGGCGACGGCAGAGACCGTCAAGAAGAGCAACTCCACAGGCTTCTCCAAGCTCTGGA
GATTCCGGGACTTAATGACGATGCACCGAAGCAGCAGCGATGGCAAGGACGCCTTCGTTTTCTTGAGCAATCCCACCACCTCCACCTCCAAATCCCCCAAGAACAAGACC
CACAAGCTTCAACCTCAACCCGAATCCAGGACCTCCACCTCCACCTCCACCTCCACCTCCGCCCCAAAACTCAACCGCCACAAACCCCGAACGGCGCCCTCTGCCCACGA
GACGCACTACGTCAGAAGCAGAGCCCAGCAGCAAGTCGACAAACGCAAATCCTATCTCCCCTACCGCCAGGATTTGGTTGGCTTCTTCACCAGCGTCAATGGATTCAGCA
AAAATGTTCATCCTTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAGCTTCTGAGCTATTATCCTTCAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACTGCAACTGCAACCATGAACCTCGGTGTCTC
TGCTAATTCCAGCCTAGCGGAGCGGGTGGAAACGAACCTCGAATCCTTGGCTTTCGACGACAGACTGCAGCTGGACGACGGCGATGAGCAAGAAGATGAAGAGTTCTCCT
TTGTTTGCCTCAATCCTGACGGTTCCCCAATAAGCGCCGACGATGTCTTCCATAACGGCCAGATCCGCCCCGTCTACCCACTCTTCAATCGAGACCTCCTGTTTGTCGAC
GAGGACGATTCCGAAACGCCGGACAAGTCTCCATCGCTTCGGCCGCCCTTGAGGAAGCTGTTCGTCGAAAAGCGCGATACCTTAGCACCCGAATCGGAATCGGAGTCCGA
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GACGCACTACGTCAGAAGCAGAGCCCAGCAGCAAGTCGACAAACGCAAATCCTATCTCCCCTACCGCCAGGATTTGGTTGGCTTCTTCACCAGCGTCAATGGATTCAGCA
AAAATGTTCATCCTTTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EDDSETPDKSPSLRPPLRKLFVEKRDTLAPESESESESESEPEGVVQGTYCEWSPATAETVKKSNSTGFSKLWRFRDLMTMHRSSSDGKDAFVFLSNPTTSTSKSPKNKT
HKLQPQPESRTSTSTSTSTSAPKLNRHKPRTAPSAHETHYVRSRAQQQVDKRKSYLPYRQDLVGFFTSVNGFSKNVHPF