; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0005478 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0005478
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr6:19248518..19250466
RNA-Seq ExpressionLag0005478
SyntenyLag0005478
Gene Ontology termsGO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process (biological process)
GO:0016579 - protein deubiquitination (biological process)
GO:0004843 - thiol-dependent ubiquitin-specific protease activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001607 - Zinc finger, UBP-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036757.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.2e-3493.15Show/hide
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KAF7836785.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 [Senna tora]9.7e-3576.4Show/hide
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KAG2396694.1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Vigna angularis]7.4e-3557.94Show/hide
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XP_008454624.1 PREDICTED: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 isoform X2 [Cucumis melo]2.2e-3493.15Show/hide
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XP_038898417.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 [Benincasa hispida]2.2e-3493.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A059BN02 Ubiquitinyl hydrolase 14.0e-3490.41Show/hide
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A0A1S3BYL9 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.0e-3493.15Show/hide
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A0A1S3C0A1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.0e-3493.15Show/hide
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A0A5A7T588 Ubiquitinyl hydrolase 11.0e-3493.15Show/hide
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A0A5D3BBG1 Ubiquitinyl hydrolase 13.0e-3491.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
E1BY77 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 132.2e-2660.23Show/hide
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P45974 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 51.7e-2673.91Show/hide
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P56399 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 51.7e-2673.91Show/hide
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Q5R407 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 55.0e-2672.46Show/hide
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Q8L6Y1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 143.5e-3584.93Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G20630.1 ubiquitin-specific protease 142.5e-3684.93Show/hide
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AT5G04590.1 sulfite reductase2.1e-1155Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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