; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0005534 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0005534
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionNucleolar protein 58-like
Genome locationchr6:21016651..21017112
RNA-Seq ExpressionLag0005534
SyntenyLag0005534
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
PON50458.1 hypothetical protein PanWU01x14_223230, partial [Parasponia andersonii]1.1e-1336.3Show/hide
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PON59596.1 hypothetical protein PanWU01x14_158080 [Parasponia andersonii]1.6e-1540.48Show/hide
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        L P   VW HF+K+RL+PTTH  T+S +R++LLYS++ G  IN+G +   EI +C  ++ G LF  SLITQLC+  +     +EE+      ID   + +
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PON62892.1 hypothetical protein PanWU01x14_135680 [Parasponia andersonii]3.9e-1438.06Show/hide
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        S L P   VW HF+K+RL+PTTH  T+S ERV+LLYS++ G  IN+G I   EI +   ++ G LF  SLIT++C   +     +EE+      ID   +
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         ++ Q+   + + + S+SR  +   A S  TS T
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PON65869.1 hypothetical protein PanWU01x14_113580, partial [Parasponia andersonii]3.0e-1437.78Show/hide
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        S L P   VW HF+K+RL+PTTH   +S E V+LLYS++ G  IN+G I   EI +C  ++ G LF  SLIT++C+  +     +EE+      ID   +
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XP_024971944.1 uncharacterized protein LOC112510826 [Cynara cardunculus var. scolymus]1.0e-1435.88Show/hide
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        S+LKP   VW++FI+  L PTTHDS+IS+E+++LLY ++ G  IN+G +  + IL C ++R GKLF  SLI +L  +  +    D+   +    + TID+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2P5BCG4 Uncharacterized protein (Fragment)9.4e-1437.9Show/hide
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A0A2P5BNT0 Uncharacterized protein (Fragment)5.5e-1436.3Show/hide
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A0A2P5CEY2 Uncharacterized protein7.7e-1640.48Show/hide
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A0A2P5CPE8 Uncharacterized protein1.9e-1438.06Show/hide
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A0A2P5CXU3 Uncharacterized protein (Fragment)1.5e-1437.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTAGTGATCTCAAGCCAGAACCGGCAGTGTGGCTTCACTTCATCAAAAACAGACTGATGCCCACAACCCACGATAGTACCATTTCAATAGAGAGGGTTATGCTTCT
CTACAGCATCATGAAGGGGTTGGAGATCAATATAGGGAGCATCAACAGAGAGGAGATCCTTTCATGTGGAAGGAAGAGAGTTGGGAAGTTGTTCATTGGGTCCCTCATAA
CCCAATTATGCCAGAGGGTGAAAATTGTTCCTGGAAAAGATGAGGAACGCCACTTTTTCAGACCCACTATCGACTTGCCTCTGATAGGGAAGCTTCAACAGAACAATGTG
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ATGCCCTAAAACTCGTAGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATGCCCTAAAACTCGTAGATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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