; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0005675 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0005675
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description(thale cress) hypothetical protein
Genome locationchr6:25833936..25834399
RNA-Seq ExpressionLag0005675
SyntenyLag0005675
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB2089976.1 hypothetical protein ES319_A03G096000v1, partial [Gossypium barbadense]5.4e-3386.59Show/hide
Query:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
        R LLLTCYIPAFLHGSARSS+PASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRH+F VPACKG NPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGE +
Subjt:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
KAG2247429.1 hypothetical protein Bca52824_087057 [Brassica carinata]3.3e-3876Show/hide
Query:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKG
        MLTVTKVT FRWTRSQRVQS SVTS   RLQKRSPTLIVG +E   LL  +  + +  +     PASPFPL P YRPK +GRMEYSQVVRHRFLVPACKG
Subjt:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKG

Query:  SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
        SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
Subjt:  SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
KAG2308121.1 hypothetical protein Bca52824_027869 [Brassica carinata]3.3e-3876Show/hide
Query:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKG
        MLTVTKVT FRWTRSQRVQS SVTS   RLQKRSPTLIVG +E   LL  +  + +  +     PASPFPL P YRPK +GRMEYSQVVRHRFLVPACKG
Subjt:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKG

Query:  SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
        SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
Subjt:  SNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
KJB09807.1 hypothetical protein B456_001G168300, partial [Gossypium raimondii]2.1e-3775Show/hide
Query:  PTERLQKRSPTLIV------GQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT
        PT  +++R+ + +         + R LLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT
Subjt:  PTERLQKRSPTLIV------GQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT

Query:  TTGEASDC
        TTGEA+DC
Subjt:  TTGEASDC
TYH24629.1 hypothetical protein ES288_A03G106700v1 [Gossypium darwinii]1.1e-3387.8Show/hide
Query:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
        R LLLTCYIPAFLHGSARSS+PASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRH+F VPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGE +
Subjt:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0D2LZI2 Uncharacterized protein (Fragment)1.0e-3775Show/hide
Query:  PTERLQKRSPTLIV------GQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT
        PT  +++R+ + +         + R LLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT
Subjt:  PTERLQKRSPTLIV------GQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELT

Query:  TTGEASDC
        TTGEA+DC
Subjt:  TTGEASDC
A0A5D2H581 Uncharacterized protein5.3e-3487.8Show/hide
Query:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
        R LLLTCYIPAFLHGSARSS+PASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRH+F VPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGE +
Subjt:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
A0A5J5WF54 Uncharacterized protein (Fragment)2.6e-3386.59Show/hide
Query:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
        R LLLTCYIPAFLHGSARSS+PASPFPLSPF   K GRMEYSQVVRH+F VPACKG NPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGE +
Subjt:  RILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEAS
A5BTN0 Uncharacterized protein1.9e-3165.12Show/hide
Query:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGS
        MLTVTKVT FRWTRSQRVQSNSVTS  E L                LL   + A L           PFP+ P    K GRMEYSQVVRHRFLVPACKGS
Subjt:  MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGS

Query:  NPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEASDCSP
        NPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA+DCSP
Subjt:  NPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEASDCSP
R4I232 Uncharacterized protein2.3e-2190.16Show/hide
Query:  PASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
        PA PFPL P YRPK +GRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTT GEA
Subjt:  PASPFPLSPFYRPK-QGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHPIGSVKNELTTTGEA
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTGACGGTGACGAAGGTAACCTACTTTCGGTGGACGCGGAGCCAACGAGTTCAGTCGAACAGCGTAACGAGTCCCACGGAGCGGTTACAGAAGCGTTCGCCAACTTT
GATAGTCGGTCAACAAGAGAGAATCTTGCTGCTTACTTGCTATATCCCCGCGTTCTTGCACGGCTCGGCTCGTTCTTCGAGCCCTGCTTCTCCCTTCCCCCTCTCCCCGT
TCTACCGTCCAAAACAAGGCCGTATGGAGTATAGCCAAGTGGTAAGGCATCGGTTTTTGGTACCGGCATGCAAAGGTTCGAATCCTTTTACTCCAGATTATGAACACCCG
ATCGGATCTGTCAAGAACGAGCTGACGACTACAGGGGAAGCGTCTGACTGTAGTCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTGACGGTGACGAAGGTAACCTACTTTCGGTGGACGCGGAGCCAACGAGTTCAGTCGAACAGCGTAACGAGTCCCACGGAGCGGTTACAGAAGCGTTCGCCAACTTT
GATAGTCGGTCAACAAGAGAGAATCTTGCTGCTTACTTGCTATATCCCCGCGTTCTTGCACGGCTCGGCTCGTTCTTCGAGCCCTGCTTCTCCCTTCCCCCTCTCCCCGT
TCTACCGTCCAAAACAAGGCCGTATGGAGTATAGCCAAGTGGTAAGGCATCGGTTTTTGGTACCGGCATGCAAAGGTTCGAATCCTTTTACTCCAGATTATGAACACCCG
ATCGGATCTGTCAAGAACGAGCTGACGACTACAGGGGAAGCGTCTGACTGTAGTCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLTVTKVTYFRWTRSQRVQSNSVTSPTERLQKRSPTLIVGQQERILLLTCYIPAFLHGSARSSSPASPFPLSPFYRPKQGRMEYSQVVRHRFLVPACKGSNPFTPDYEHP
IGSVKNELTTTGEASDCSP