; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0006206 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0006206
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPentraxin 4, long
Genome locationchr6:39072228..39072976
RNA-Seq ExpressionLag0006206
SyntenyLag0006206
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_014053877.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X1 [Salmo salar]6.5e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

XP_014053878.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X2 [Salmo salar]8.5e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

XP_014053880.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X4 [Salmo salar]6.5e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

XP_014053881.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X5 [Salmo salar]6.5e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

XP_014053882.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X6 [Salmo salar]1.9e-1126.09Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ +++   LGL+ + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ + +G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3RNG7 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X53.1e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

A0A1S3RNI6 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X43.1e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

A0A1S3RNN6 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X24.1e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

A0A1S3RPX7 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X13.1e-1226.57Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ + +   LGLL + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

A0A1S3RPY0 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X69.1e-1226.09Show/hide
Query:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF
        M+ +++G  LGL  +   K     G+ TM+ +++   LGL  +   K     G+ TM+ +++G  L L  +   K      + TM+ +++   LGL+ + 
Subjt:  MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLF

Query:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR
          K     G+ TM+ + +G  LGL  +   K     G+ TM+ +++G   GL  +   +V   LGL  +   K     G+ T + +++G  LGL    P 
Subjt:  PQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIV-KFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPR

Query:  RVYAPLG
        + Y  +G
Subjt:  RVYAPLG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTCCTAGGCCTCCCAAAACTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGAGAATTT
CCTAGGTCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTCCTAAACCTCCCCAAGCTTTTTCCCC
AGAAGAGTGTACGCACCCCTTGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGAGAATTTCCTAGGTCTCCTCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATG
ACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTTTTAGGCCTCCCCAAGATTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGG
GAACTTCCCAGGCCTCCCTAAGCTTTTCCCCAGAATAGTGAAATTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGAGTACCACACTTG
AAGAGAGGCTTGGGAATTTCCTTGGCCTCCCCAAGTTTTTCCCCAGGAGAGTGTACGCACCTTTAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTCCTAGGCCTCCCAAAACTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGAGAATTT
CCTAGGTCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTCCTAAACCTCCCCAAGCTTTTTCCCC
AGAAGAGTGTACGCACCCCTTGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGAGAATTTCCTAGGTCTCCTCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATG
ACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAATTTTTTAGGCCTCCCCAAGATTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGACGACGATGCTTGAAGAGAGGCTCGG
GAACTTCCCAGGCCTCCCTAAGCTTTTCCCCAGAATAGTGAAATTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGAGTACCACACTTG
AAGAGAGGCTTGGGAATTTCCTTGGCCTCCCCAAGTTTTTCCCCAGGAGAGTGTACGCACCTTTAGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLEERLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLENFLGLPKLFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFLNLPKLFPQKSVRTPWMTTMLEERLENFLGLLKLFPQKSVRTPGM
TTMLEERLGNFLGLPKIFPQKSVRTPGMTTMLEERLGNFPGLPKLFPRIVKFLGLPKLFPQKSVRTPGMSTTLEERLGNFLGLPKFFPRRVYAPLG