; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0006558 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0006558
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationchr6:43593961..43594326
RNA-Seq ExpressionLag0006558
SyntenyLag0006558
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-5894.96Show/hide
Query:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSL WIP+QSTC+G+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022150733.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.3e-5793.39Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+SPT FLICAAVFVVF+CSSTAVHGGLGIHHSLAWIP QS+C+GSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]2.4e-5995.04Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSL WIP+QSTC+G+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.9e-6095.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSL WIP+QSTC+G+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]7.6e-6195.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGIHHSLAWIP+QSTC+GSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.7e-5891.74Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLICAAVF++FSCSST VH GLGI HSLAWIP+QSTC+GSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor9.3e-5790.08Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSPTFFLI AAVF++FSCSSTAVH G+GI +SLAWIP+QSTC+GSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 336.5e-5893.39Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+SPT FLICAAVFVVF+CSSTAVHGGLGIHHSLAWIP QS+C+GSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 331.2e-5995.04Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSL WIP+QSTC+G+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.4e-6095.87Show/hide
Query:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSL WIP+QSTC+G+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.5e-3077.11Show/hide
Query:  WIPHQSTCEGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPHQSTCEGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.4e-2858.77Show/hide
Query:  PTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQAN
        P+  ++C  +   F   S A  G  G +  +        C+GSI EC    EEFE DSE +RRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQAN
Subjt:  PTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQAN

Query:  PYSRGCSAITRCRS
        PYSRGCSAITRCRS
Subjt:  PYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.4e-2867.37Show/hide
Query:  PHQSTCEGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C G+IAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PHQSTCEGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 223.9e-2880.26Show/hide
Query:  STCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 12.1e-2962.07Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIH-HSLAWI---PHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VVF  SS  V  G       +AW     + S C GSIAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIH-HSLAWI---PHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.5e-3062.07Show/hide
Query:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIH-HSLAWI---PHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ
        T FL    + VVF  SS  V  G       +AW     + S C GSIAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
Subjt:  TFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIH-HSLAWI---PHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQ

Query:  ANPYSRGCSAITRCRS
        ANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  ANPYSRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.0e-1558.33Show/hide
Query:  EGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        +G I E  G  ++  DSE +RR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  EGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 222.8e-2980.26Show/hide
Query:  STCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCEGSIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 239.6e-3067.37Show/hide
Query:  PHQSTCEGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C G+IAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PHQSTCEGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.7e-3177.11Show/hide
Query:  WIPHQSTCEGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPHQSTCEGSIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGGCGGCCTCGGGATCCACCA
CAGCCTCGCATGGATTCCTCACCAATCGACCTGCGAGGGCTCCATAGCCGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGCCGCATCTTGGCCA
CCAGCCAGTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGGAGGAACACGGTGCCGTGTTCTAGACGCGGTGCATCCTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCGTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTGCGCCGCCGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGGCGGCCTCGGGATCCACCA
CAGCCTCGCATGGATTCCTCACCAATCGACCTGCGAGGGCTCCATAGCCGAGTGTTTCGGCGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGCCGCATCTTGGCCA
CCAGCCAGTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGGAGGAACACGGTGCCGTGTTCTAGACGCGGTGCATCCTACTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCGTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSPTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIHHSLAWIPHQSTCEGSIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCSAITRCRS