; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0006923 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0006923
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationchr6:47144355..47145605
RNA-Seq ExpressionLag0006923
SyntenyLag0006923
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599412.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.3e-16482.61Show/hide
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KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.3e-16482.61Show/hide
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XP_008457806.1 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucumis melo]2.5e-16483.29Show/hide
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XP_022946029.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita moschata]3.3e-16482.9Show/hide
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XP_023546561.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.7e-16382.32Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein2.8e-16181.56Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.2e-16483.29Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.2e-16483.29Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.6e-16482.9Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.6e-16182.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 282.7e-2026.33Show/hide
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        S +       +E    +  S        GQ                       KP       KWKGP KI+R+Y DW+DD+
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 312.5e-1030.99Show/hide
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        K+K C KF++   CP+G+ C+F H  P  ++        +  +++G    P           P+RA          A GN+ P S  KT++C K+     
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        C FGDKCHFAHG+  +   A  S   AM+ P      G+ +P
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 562.7e-4433.73Show/hide
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        Q PP K++R     +            N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    NCNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+    +   ++ +I   
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Query:  RANG-NARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHG--------------------------QSVVAMEASSSLAMSVPTSALP---------------
          NG   +PS WKT++C KWE+TG+CPFG KCHFAHG                          Q+VV+ +A +  A +  T+ LP               
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Query:  -----EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDD
              GQ +  + KWKGP KI+RIY DW+D+
Subjt:  -----EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDD

Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 125.6e-4231.3Show/hide
Query:  DATGCWSQFPRNDLFDSQSQFEPQQPPFKRARNSEENQSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQE
        D    W+  P N   D+        PP K+ R S  + S+    + ++       K I  +FFKT++C KF+ G C    NCNFAH VE++R+PPPNWQE
Subjt:  DATGCWSQFPRNDLFDSQSQFEPQQPPFKRARNSEENQSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQE

Query:  IVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS
        IV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH       D++ R RES AIS+G  G     G 
Subjt:  IVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS

Query:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNA---------RPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSVV-------------------------------A
         S         S S    +   G +         +PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG + +                                
Subjt:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNA---------RPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSVV-------------------------------A

Query:  MEASSSLAMSVP----------------TSALPEGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
         + ++ L+  VP                +SA+ +        KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  MEASSSLAMSVP----------------TSALPEGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 391.3e-7545.8Show/hide
Query:  NDLFDSQSQFEPQ---QPPFKRARNSEEN----------QSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNW
        + L +SQSQ +P    QP  KR R  ++N           SS  P+        PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NW
Subjt:  NDLFDSQSQFEPQ---QPPFKRARNSEEN----------QSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNW

Query:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS
        QEIVG             RE ++          +NW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T     + +
Subjt:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS

Query:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSV-------VAMEASSSLAMSVPTSALP----------------
         S+  E +R  S  V   +   G  +  +WKT+LCMK++ITG CPFGDKCHFAHGQ+        V  EA +++A     + +P                
Subjt:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSV-------VAMEASSSLAMSVPTSALP----------------

Query:  ------EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKLE
              EG+ K CLLKW   KKINRIY DW+DDLP+   S   +E
Subjt:  ------EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKLE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein4.0e-4331.3Show/hide
Query:  DATGCWSQFPRNDLFDSQSQFEPQQPPFKRARNSEENQSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQE
        D    W+  P N   D+        PP K+ R S  + S+    + ++       K I  +FFKT++C KF+ G C    NCNFAH VE++R+PPPNWQE
Subjt:  DATGCWSQFPRNDLFDSQSQFEPQQPPFKRARNSEENQSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQE

Query:  IVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS
        IV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH       D++ R RES AIS+G  G     G 
Subjt:  IVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS

Query:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNA---------RPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSVV-------------------------------A
         S         S S    +   G +         +PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG + +                                
Subjt:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNA---------RPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSVV-------------------------------A

Query:  MEASSSLAMSVP----------------TSALPEGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
         + ++ L+  VP                +SA+ +        KWKGP KI+RIY DW+DD+
Subjt:  MEASSSLAMSVP----------------TSALPEGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein8.7e-0628.04Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G +C FAHG++++R           IR                 K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT1G68200.2 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein8.7e-0628.04Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G +C FAHG++++R           IR                 K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein1.9e-2126.33Show/hide
Query:  SSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGANCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGE
        +S G  S +    +  +  I   FFKT++C KF+ G C  + ++C+FAH  E++R    PPPNWQE V                                
Subjt:  SSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLC-RNGANCNFAHGVEDMR---QPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGE

Query:  ECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQ
                            ++ R RES A+S+G  G                    +V+  +++        WKT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG 
Subjt:  ECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQ

Query:  SVV------AMEASSSLAMSVPTSALPEGQA----------------------KP----CLLKWKGPKKINRIYADWLDDL
        S +       +E    +  S        GQ                       KP       KWKGP KI+R+Y DW+DD+
Subjt:  SVV------AMEASSSLAMSVPTSALPEGQA----------------------KP----CLLKWKGPKKINRIYADWLDDL

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein9.4e-7745.8Show/hide
Query:  NDLFDSQSQFEPQ---QPPFKRARNSEEN----------QSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNW
        + L +SQSQ +P    QP  KR R  ++N           SS  P+        PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NW
Subjt:  NDLFDSQSQFEPQ---QPPFKRARNSEEN----------QSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGVEDMRQPPPNW

Query:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS
        QEIVG             RE ++          +NW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T     + +
Subjt:  QEIVG------------IREDDQS--------VSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGS

Query:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSV-------VAMEASSSLAMSVPTSALP----------------
         S+  E +R  S  V   +   G  +  +WKT+LCMK++ITG CPFGDKCHFAHGQ+        V  EA +++A     + +P                
Subjt:  DSSYSEPSRAASCSVSDAIRANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSV-------VAMEASSSLAMSVPTSALP----------------

Query:  ------EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKLE
              EG+ K CLLKW   KKINRIY DW+DDLP+   S   +E
Subjt:  ------EGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAACGATATTCGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTGCCAATGTCGATGCCACTGGTTGTTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATTTATT
TGATTCACAATCACAATTTGAGCCACAGCAGCCTCCATTCAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCAATCTAGCCCTGGGCCTTATTCCAGAGCGCACCCACAGAATG
CTCCAGTGAATAAAGGGATAAGCAATATCTTCTTCAAGACAAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCGAATTGCAACTTTGCTCATGGTGTT
GAAGATATGCGACAACCCCCACCGAATTGGCAAGAGATTGTGGGGATACGTGAGGATGATCAATCAGTTAGCAACTGGAATGATGATCAGAAAATAATCCAGAAAATGAA
GCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGGGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGCAATTTTCTCCATGAAGATCCTGCTAAATTTAGAGATGATTCAGGTAGGTTTAGAGAGA
GTTCAGCTATAAGTATTGGCACTACTGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTAGCTATTCTGAACCTAGCAGAGCAGCTTCTTGTTCTGTTTCTGATGCTATTCGA
GCTAATGGAAATGCAAGACCTTCATTCTGGAAGACAAAATTATGCATGAAGTGGGAGATTACTGGTCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATC
TGTTGTGGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGGCGATGAGTGTTCCGACCTCCGCCCTACCGGAGGGCCAGGCGAAGCCATGCTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGA
TAAACCGGATCTATGCTGATTGGCTTGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAGCGAGCAAATTGGAGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTTTCAACGATATTCGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTGCCAATGTCGATGCCACTGGTTGTTGGTCTCAGTTTCCTAGGAATGATTTATT
TGATTCACAATCACAATTTGAGCCACAGCAGCCTCCATTCAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCAATCTAGCCCTGGGCCTTATTCCAGAGCGCACCCACAGAATG
CTCCAGTGAATAAAGGGATAAGCAATATCTTCTTCAAGACAAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGGAATGGTGCGAATTGCAACTTTGCTCATGGTGTT
GAAGATATGCGACAACCCCCACCGAATTGGCAAGAGATTGTGGGGATACGTGAGGATGATCAATCAGTTAGCAACTGGAATGATGATCAGAAAATAATCCAGAAAATGAA
GCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGGGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGCAATTTTCTCCATGAAGATCCTGCTAAATTTAGAGATGATTCAGGTAGGTTTAGAGAGA
GTTCAGCTATAAGTATTGGCACTACTGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTAGCTATTCTGAACCTAGCAGAGCAGCTTCTTGTTCTGTTTCTGATGCTATTCGA
GCTAATGGAAATGCAAGACCTTCATTCTGGAAGACAAAATTATGCATGAAGTGGGAGATTACTGGTCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATC
TGTTGTGGCCATGGAAGCATCTTCGAGTTTGGCGATGAGTGTTCCGACCTCCGCCCTACCGGAGGGCCAGGCGAAGCCATGCTTGCTGAAATGGAAAGGACCCAAGAAGA
TAAACCGGATCTATGCTGATTGGCTTGATGATTTGCCTCTATCTCCAAGCTCAGCGAGCAAATTGGAGGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDIRGSVIPPPLHSYGANVDATGCWSQFPRNDLFDSQSQFEPQQPPFKRARNSEENQSSPGPYSRAHPQNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGANCNFAHGV
EDMRQPPPNWQEIVGIREDDQSVSNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSYSEPSRAASCSVSDAIR
ANGNARPSFWKTKLCMKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSVVAMEASSSLAMSVPTSALPEGQAKPCLLKWKGPKKINRIYADWLDDLPLSPSSASKLEG