; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0007810 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0007810
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr9:5214368..5218899
RNA-Seq ExpressionLag0007810
SyntenyLag0007810
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAE6523816.1 Tir4p [Saccharomyces cerevisiae PE-2]8.7e-0629.04Show/hide
Query:  SSFPPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSS---LSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAA
        SS  PSS  +      PSS   V SS    S  +  S  + +S+ +   +  PSS   +SS V +  + V SS             VAP SS+V+   ++
Subjt:  SSFPPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSS---LSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAA

Query:  QFLPQSSKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKAL
           P SS+V+   VA        S  +   + PSS     +S+A  PSS  ++S++ +PSS  ++S++ +PSS  ++S++ +PSS  ++S++ +PSS  +
Subjt:  QFLPQSSKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKAL

Query:  LSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVAVDGLVPLHLQMLAVDGVRCASSSNVGSDEVTTS
        +S++ +PSS  ++S++ +PSS  ++S++ +PSS  ++S      S +  S S+   S +      V    + P   ++  V     +SSS V S  V  S
Subjt:  LSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVAVDGLVPLHLQMLAVDGVRCASSSNVGSDEVTTS

Query:  ESD
         S+
Subjt:  ESD

KAE8553197.1 hypothetical protein EYB25_004579 [Talaromyces marneffei]1.7e-0638.33Show/hide
Query:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS
        PPS+          SS     SS    S +   S  S +S+ +      P+   S   +  +   SS       S +    +  SS      +A     S
Subjt:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS

Query:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS
        S V     A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S TPSPSS A++S   SPSS A++ST PS
Subjt:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP
        PSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS  ++ST P   SP
Subjt:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP

MBP7963185.1 PKD domain-containing protein [Caldilineaceae bacterium]1.0e-0640.37Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS
        PS      A+L PSPS    ++T PSPS    ++  PSPS    ++TTPSPS    ++   SPS    ++T PSPS    ++TTPSPS     +T PSPS
Subjt:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS

Query:  SKVLLSTLP
          +  +T P
Subjt:  SKVLLSTLP

MBP9072951.1 PKD domain-containing protein [Caldilineaceae bacterium]2.3e-0640.37Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS
        PS      A+L PSPS    ++T PSPS    ++  PSPS    ++TTPSPS    ++   SPS    ++T PSPS    ++TTPSPS     +T PSPS
Subjt:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS

Query:  SKVLLSTLP
             +T P
Subjt:  SKVLLSTLP

QGA16673.1 hypothetical protein EYB26_004340 [Talaromyces marneffei]1.7e-0638.33Show/hide
Query:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS
        PPS+          SS     SS    S +   S  S +S+ +      P+   S   +  +   SS       S +    +  SS      +A     S
Subjt:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS

Query:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS
        S V     A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S TPSPSS A++S   SPSS A++ST PS
Subjt:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP
        PSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS  ++ST P   SP
Subjt:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A4W3JE76 FHA domain-containing protein2.5e-0641.48Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS
        PS +  S A+  PSP  K+L +  PSP  K+L +  PSP  K+L + TPSP  K+L +   SP  K+L +  PSP  K+L + TPSP  K+L +  PSP 
Subjt:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPS

Query:  SKVLLSTLPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVA
         K L +  P   SP R S +    SP L  K L A
Subjt:  SKVLLSTLPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVA

A0A507CAM6 Uncharacterized protein9.3e-0644.26Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALL
        P +S  PS      +AS APSP +  L S APSP +  L SAAPSP +  L S  PSP +  L SAA SP +  L S APSP +  L S  PSP +  L 
Subjt:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALL

Query:  STAP-SPSSKVLLSTLPFEGSP
        S AP SP+   +LS+     +P
Subjt:  STAP-SPSSKVLLSTLPFEGSP

A0A7C8H5H8 Chitinase8.5e-0738.33Show/hide
Query:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS
        PPS+          SS     SS    S +   S  S +S+ +      P+   S   +  +   SS       S +    +  SS      +A     S
Subjt:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS

Query:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS
        S V     A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S TPSPSS A++S   SPSS A++ST PS
Subjt:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP
        PSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS  ++ST P   SP
Subjt:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFEGSP

B6QFQ7 Chitinase1.6e-0537.66Show/hide
Query:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS
        PPS+          SS     SS    S +   S  S +S+ +      P+   S   +  +   SS       S +    +  SS      +A     S
Subjt:  PPSSKVLTCFGEVPSSKPEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQS

Query:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS
        S V     A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S TPSPSS A++S   SPSS A++ST PS
Subjt:  SKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL
        PSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS  ++
Subjt:  PSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLL

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)3.6e-0554.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTA
        L P+S   S  SL+P  SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTA

Query:  PSPSSKVLLS
         SPSS   LS
Subjt:  PSPSSKVLLS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGCACCCAAGGACGTCTATTTATAGGCCTGGAATAGGGGTAGCGTCACGGCGCTGCCTTGCTAAGCGTCGCGACGCTGCTGCGCACGCGGCTTGGGCAACAAGAAA
GGGCAGCTTCCTTCTCTCCAAGTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTACTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTTTCATGCGCTT
TGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAG
CCTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCAAATGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAG
TTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGTAGTTCTTTCCTCCAAATTCGAAGGTTTCGAAGGTTCTCACGCGCTGCACTTTGTTGCACCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGC
GCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCAAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTGCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCA
AGTTCGAAGGTTCCCTCACGTGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAAGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTC
TCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCATTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTC
CAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCTTCCTTTTGAA
GGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGTGGCGGTTGACGGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGC
AGTTGACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGATGAAGTCACTACAAGTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGAGTCTGGTGACCACCCCT
ACAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTATAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGTGGACTGGTCTAGCA
GGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGCCGATCCAAGAGATCATCAAGTCAACAGACCGATCATCCAGGAGGATCAACAAGCTAACAACCGATCCAACAAATCAACAAGC
CAACAGGCTGATCCAAGAGATCATTAAGTCAACAGACCGATCATCCAGGAAGATCGACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGACCGATCATCCAG
GAAGATCAACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAACCTAGCA
GACCGATCATCCAAGAAGCTCAACAAACTGGCCCAAGAAGATCCTTCAAGACTGGAAGACTTCAACAATCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGCACCCAAGGACGTCTATTTATAGGCCTGGAATAGGGGTAGCGTCACGGCGCTGCCTTGCTAAGCGTCGCGACGCTGCTGCGCACGCGGCTTGGGCAACAAGAAA
GGGCAGCTTCCTTCTCTCCAAGTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTACTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTTTCATGCGCTT
TGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAG
CCTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCAAATGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAG
TTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGCTGTAGTTCTTTCCTCCAAATTCGAAGGTTTCGAAGGTTCTCACGCGCTGCACTTTGTTGCACCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGC
GCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCAAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTGCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCA
AGTTCGAAGGTTCCCTCACGTGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAAGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTC
TCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCATTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTC
CAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCTTCCTTTTGAA
GGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGTGGCGGTTGACGGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGC
AGTTGACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGATGAAGTCACTACAAGTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGAGTCTGGTGACCACCCCT
ACAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTATAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGTGGACTGGTCTAGCA
GGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGCCGATCCAAGAGATCATCAAGTCAACAGACCGATCATCCAGGAGGATCAACAAGCTAACAACCGATCCAACAAATCAACAAGC
CAACAGGCTGATCCAAGAGATCATTAAGTCAACAGACCGATCATCCAGGAAGATCGACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGACCGATCATCCAG
GAAGATCAACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAACCTAGCA
GACCGATCATCCAAGAAGCTCAACAAACTGGCCCAAGAAGATCCTTCAAGACTGGAAGACTTCAACAATCCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRHPRTSIYRPGIGVASRRCLAKRRDAAAHAAWATRKGSFLLSKYEGSLLQVEGSLTLLRCSSFLQVQRFSCALLQFLLSKFKGSHAFRYSSFPPSSKVLTCFGEVPSSK
PEVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSNVLTRFAAVPSSLSSKVLTRFAVVLSSKFEGFEGSHALHFVAPPSSKVLMRFAAQFLPQSSKVLMRFVATLLQVRRFSHALLQFLPP
SSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSAAHSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTLPFE
GSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLVAVDGLVPLHLQMLAVDGVRCASSSNVGSDEVTTSESDDDRCRRVESGDHPYRLLRSPNKMGTGLAGVHHYRQIWLLRSPNKMWTGLA
GVHHCRQIWPIQEIIKSTDRSSRRINKLTTDPTNQQANRLIQEIIKSTDRSSRKIDKPTSRSKRSSRQQTDHPGRSTSQQADPRDHHANRPIIQEDQQANRPIQEIINLA
DRSSKKLNKLAQEDPSRLEDFNNP