; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0007843 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0007843
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr9:6219849..6220184
RNA-Seq ExpressionLag0007843
SyntenyLag0007843
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0026217.1 hypothetical protein E6C27_scaffold19G001920 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2267.59Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+R SSSS SAP PMS DQYAMDLGFT VTRSRSR  GI    P ESST PPRPSANL+RP G VVQ++PP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

KAA0043136.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2265.74Show/hide
Query:  RDKASSSRGSR-PSSSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+R PSSS+SAP P+S DQYAMDLGFT VTR  SR  GI    P ESST PPRPS NL+RPS GVVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSR-PSSSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

KAA0049709.1 hypothetical protein E6C27_scaffold76G00530 [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-2367.62Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+RPSSSS S P PMS DQYAMDLGFT VTRSRSR   IR   P ESST PP+PS NL+RPSGGVVQ+R PVSP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKR
         P+KR
Subjt:  VPEKR

KAA0056175.1 hypothetical protein E6C27_scaffold697G00720 [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-2366.67Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+ PSSSS SA  PM+ DQYAMDL FT VTRSRSR   IR   P ESST PPRP ANL+RPSGGVVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

TYK11076.1 hypothetical protein E5676_scaffold73G00620 [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-2467.59Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+RPSSSS SAP PMS DQY MDLGFT V RSRSR   IR   P ESST PPRP ANL+RPSG VVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TM80 Putative Retrotransposon protein8.1e-2365.74Show/hide
Query:  RDKASSSRGSR-PSSSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+R PSSS+SAP P+S DQYAMDLGFT VTR  SR  GI    P ESST PPRPS NL+RPS GVVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSR-PSSSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

A0A5A7U8A0 Uncharacterized protein3.6e-2367.62Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+RPSSSS S P PMS DQYAMDLGFT VTRSRSR   IR   P ESST PP+PS NL+RPSGGVVQ+R PVSP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKR
         P+KR
Subjt:  VPEKR

A0A5A7URC1 Uncharacterized protein2.1e-2366.67Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+ PSSSS SA  PM+ DQYAMDL FT VTRSRSR   IR   P ESST PPRP ANL+RPSGGVVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

A0A5D3CKX1 Uncharacterized protein2.5e-2467.59Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+RPSSSS SAP PMS DQY MDLGFT V RSRSR   IR   P ESST PPRP ANL+RPSG VVQ+RPP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

A0A5D3E4J4 Uncharacterized protein8.1e-2367.59Show/hide
Query:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV
        R  ++SS+G+R SSSS SAP PMS DQYAMDLGFT VTRSRSR  GI    P ESST PPRPSANL+RP G VVQ++PP SP S   SST  P++YSQAV
Subjt:  RDKASSSRGSRPSSSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAV

Query:  VPEKRFVP
         P+KRFVP
Subjt:  VPEKRFVP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGGAAATAGGGACAAAGCCTCCTCTTCAAGGGGCAGTCGCCCATCTTCCTCTTCCTCAGCACCTCCACCCATGAGTGTTGATCAATATGCGATGGATTTAGGGTT
TACTCCGGTAACCCGATCAAGGTCCAGGCAAGGCGGTATACGCCCAATGCCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACCTCCAAGGCCTTCGGCCAACCTTGTCCGTCCTTCTG
GCGGAGTTGTTCAATTGAGACCTCCGGTCTCACCAGATTCAAGGATAGGGTCATCAACCTCTTCACCTTCTTCCTACTCTCAGGCGGTAGTACCAGAAAAGAGGTTTGTA
CCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGGAAATAGGGACAAAGCCTCCTCTTCAAGGGGCAGTCGCCCATCTTCCTCTTCCTCAGCACCTCCACCCATGAGTGTTGATCAATATGCGATGGATTTAGGGTT
TACTCCGGTAACCCGATCAAGGTCCAGGCAAGGCGGTATACGCCCAATGCCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACCTCCAAGGCCTTCGGCCAACCTTGTCCGTCCTTCTG
GCGGAGTTGTTCAATTGAGACCTCCGGTCTCACCAGATTCAAGGATAGGGTCATCAACCTCTTCACCTTCTTCCTACTCTCAGGCGGTAGTACCAGAAAAGAGGTTTGTA
CCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGNRDKASSSRGSRPSSSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRSRQGGIRPMPPMESSTPPPRPSANLVRPSGGVVQLRPPVSPDSRIGSSTSSPSSYSQAVVPEKRFV
P