CuGenDBv2

Gene ID	Lag0008023
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	O-fucosyltransferase family protein
Genome location	chr9:10128971..10129417
RNA-Seq Expression	Lag0008023
Synteny	Lag0008023
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6588131.1 hypothetical protein SDJN03_16696, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

3.9e-43

65.62

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

KAG7022026.1 hypothetical protein SDJN02_15755, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.9e-43

65.62

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

XP_022933652.1 uncharacterized protein LOC111441008 [Cucurbita moschata]

3.9e-43

65.62

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

XP_023531579.1 uncharacterized protein LOC111793777 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.9e-43

65.62

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

XP_038879581.1 uncharacterized protein LOC120071391 [Benincasa hispida]

4.6e-44

66.46

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDS+PTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITYQP DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                          +L  VNCS PRILIAVERFN +AFKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LZA9 O-fucosyltransferase family protein

9.4e-43

64.6

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDS+PTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITYQP DPWL+ST AL K F +S+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                          +L  VNCS PRILIAVERFN +AFKSI FLEYQ+PVNGSKEDE
Subjt:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

A0A1S4DYB1 O-fucosyltransferase family protein

9.4e-43

64.6

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDS+PTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITYQP DPWL+ST AL K F +S+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                          +L  VNCS PRILIAVERFN +AFKSI FLEYQ+PVNGSKEDE
Subjt:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

A0A5D3CFF9 O-fucosyltransferase family protein

9.4e-43

64.6

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDS+PTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITYQP DPWL+ST AL K F +S+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                          +L  VNCS PRILIAVERFN +AFKSI FLEYQ+PVNGSKEDE
Subjt:  ------------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

A0A6J1F0F3 O-fucosyltransferase family protein

1.9e-43

65.62

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI FLEYQTPVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

A0A6J1HTM9 O-fucosyltransferase family protein

1.2e-42

64.38

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------
        MKDSNPTTEPIGQHLI LISNLCFSVFVF VLIITVIAITY+P DPWL+ST AL KLF AS+NA+F NDESVVKT EDLVSV P                
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPL---------------

Query:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                         +   VNCS P ILIAVERFN R FKSI F+EYQ PVNGSKEDE
Subjt:  -----------------QLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G04280.1 unknown protein

7.2e-11

45.83

Show/hide

Query:  EPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLV
        E +GQ+ +TLI N+ FS+FVF VLI T+IA TY+P DP    +  +     ++ NA+  +D+SVVKT ED +
Subjt:  EPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLV

AT4G08810.1 calcium ion binding

1.4e-35

52.15

Show/hide

Query:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSV------------------
        MK+S+ TTEPI Q+LI LISN+CFSVFVF VLI TVIA+TYQP DPWL+S  AL KL   ++NA+F  D S++KT EDL S                   
Subjt:  MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSV------------------

Query:  -----------------FPLQLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE
                             L +VNCS PR+L+AVERFN + FKSIVFLEY+TPVNGSK DE
Subjt:  -----------------FPLQLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFKSIVFLEYQTPVNGSKEDE

AT4G12700.1 unknown protein

1.5e-08

36.99

Show/hide

Query:  EPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVS
        E +GQ+ ++LI ++ FSV V  V++ T+IA TY+P DP    +  +     ++ NA+  +D+S+VKT ED ++
Subjt:  EPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAAAGATTCAAATCCAACCACAGAGCCCATTGGGCAACATCTGATTACGCTGATTAGTAATCTCTGTTTCTCTGTCTTTGTGTTTTTTGTTCTTATTATCACTGTTAT
TGCCATCACTTACCAGCCTCTAGATCCATGGCTGAAATCTACGCATGCTCTTAATAAGCTCTTTATTGCCTCGAAGAATGCCTCTTTTAATAACGACGAATCTGTTGTCA
AAACTATGGAGGATTTGGTCTCTGTTTTTCCCTTGCAATTGTGGGTTGTCAATTGTTCCTACCCGCGTATTTTGATTGCTGTTGAAAGGTTTAATTTTAGGGCCTTTAAG
TCTATTGTGTTCCTAGAGTATCAGACTCCAGTTAATGGGTCGAAAGAAGATGAGACGAAGGGGATTTCCCAAGATCCAGACTCGACTGCCTCGCAATTTCTTTACTGCTC
TTACTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKDSNPTTEPIGQHLITLISNLCFSVFVFFVLIITVIAITYQPLDPWLKSTHALNKLFIASKNASFNNDESVVKTMEDLVSVFPLQLWVVNCSYPRILIAVERFNFRAFK
SIVFLEYQTPVNGSKEDETKGISQDPDSTASQFLYCSY

Lag0008023 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome