; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0009326 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0009326
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionDUF1279 domain-containing protein
Genome locationchr9:38154906..38155322
RNA-Seq ExpressionLag0009326
SyntenyLag0009326
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-5885.53Show/hide
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XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-5986.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC1110153799.6e-5884.87Show/hide
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A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC1114484542.5e-5887.59Show/hide
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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC1114513205.1e-5986.18Show/hide
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A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC1114698888.7e-5985.53Show/hide
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A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC1114839517.4e-5884.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)5.6e-3460Show/hide
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        R +E+++KYGKVA+GVHFS+S  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  FSSK+ P  S  ++  E Q +V  +    N+T +LA S GGALALAVLCNK
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        AL PIRVPIT+ALTPPIAR L +R I+++G
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AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)1.2e-0431.15Show/hide
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        +ELL KYG   +    ++S  S +  YV + + VDV++LL K+   G S+                          N T E      GA ALA   +KA 
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         PIR P T+ALTP +A  + ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTTCTTCACCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAATGTCGGCGGCTTCGATCACCGGCCTCTA
CGTCGCCATCAAGAATAATGTCGATGTTGAATCGCTACTCGATAAGTTACACATGGATGGATTCTCTTCCAAGGATCAGCCGCAGACAAGTCCCTCCGAAGTTACGTCGG
AAATTCAATCGACGGTGGCGCAAGAGCCGAGGACGAGGAATCGTACTGCGGAGCTCGCAGCGTCGACTGGCGGTGCGTTGGCTTTGGCCGTGCTTTGTAACAAGGCATTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTTCTTCACCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAATGTCGGCGGCTTCGATCACCGGCCTCTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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