; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0009357 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0009357
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr9:38485361..38487861
RNA-Seq ExpressionLag0009357
SyntenyLag0009357
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
No hits found
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A4Z2J208 Uncharacterized protein9.2e-0424.16Show/hide
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        +FPP++   + L   P+  F  S         A   AI   SS++ T        +S++ T                P+  F  S  L   S +    S 
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         L + +P+  F  S  L  +P+  F  S  L  +   P     +R A +P   F   +R A + +  F  S  L     +    FS + L FLP K+  +
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          H  S  +  +LQ     LP  ++++        SL+ +P  ++  GS +L   P+S          ISS          C  +  V R+  VS+C  +
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        P V R+ R S+    PS  +  R+  V
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A0A6Q2XP57 Uncharacterized protein4.9e-0535.87Show/hide
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        GSHALR  S    EGSHALR        EGSHALR    +  EGSHALR                                    EGSHALR        
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                      EGSH     S AL +          +LR    +  EGSHALR    +  EGSHALR  S    EGSHALR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAGGGTCCTTACACTGTACGCTATTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTTCGTT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTATCCTGCTGCGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAGGGTTCTCAGTTGTACACTGCTACGTTGTTCCTCCTCCAAGTGCGAAGGATCTTATGTGGTGCGTTGTTGCATTGT
TCCTCTTCTCTCAAGTTCGATGGTTCTCACGCAGCTTTGCTGAGTTTCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTCCGTTGCAGTTCCTTCTTTCCAAGGTCGAAG
GTTCTCACTCGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTC
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TCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCACTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTTGAAGGTT
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CTCGGCTACACTGCTGCGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTCAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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CSSFLQIRRFSRASLHFLPPKFEGSHALRCSSYLQVRGSHALRWSSFLQVRGFSRASLQFLPPSSRFSRASLQFLPPSSKVHALRCSSFSQIRRFSRASHCSSFPPSLKV
LTSLRCDPSSKFEGSHALRSAIPSPSSKVLTRFVQFLPPNSKVLTSFVAFPSPKFEGSHALRCNSFLQVEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHALRCISFP
PNSKVLTRFAAVPTSKFEVLTRFAGVPSSKFEGSHALRCSSFLQVRGFSRASLQFLPPKFEGSHVASLRSCALLQFLPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRAVPSSKFE
GSHALRCISSPKFEGSHALRCSSFLQVRRFSRVSLCNSFPQVRRFSRASLQFLPPSSKVLTRFVAVPSSKFEGPHATLGCTAVLLPKVQRRQLSSRCAASFSKFEGPHAT
LGYTAALLPKVQRRQLSLHSC