; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0009739 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0009739
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationchr9:41883264..41884160
RNA-Seq ExpressionLag0009739
SyntenyLag0009739
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604731.1 Protodermal factor 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-10685.94Show/hide
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XP_022947015.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita moschata]3.1e-10685.54Show/hide
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]5.3e-10684.92Show/hide
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XP_023534009.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-10483.73Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]1.3e-10788.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein1.8e-9983.33Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like4.0e-9983.82Show/hide
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A0A6J1D8U7 protodermal factor 1-like2.5e-10183.26Show/hide
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like1.5e-10685.54Show/hide
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like2.6e-10684.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 11.3e-4343.62Show/hide
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        S  ++ L A LLS  L   V S    D K+YY SP     GTPPS                  + S+P PPSH                           
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Query:  ------GYGGTPPHYSTPTPSTPSKPPSSGGYYNPP--SSGGGSPPTIPVDPGTPSTPSTPSTP-STPSTPSTPFI--------GTCNYWLNHPGMIWGV
               +  TP H STP+  TPS PPS G Y +PP  +    +PP+  VDPGTP    +P TP   P TP TPFI        GTC+YW NHP +IWG+
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        LGW GT+G  FG     ++IPGF  ++NLLQALSNTR+D  G+L REG+AS+LNS+ +++FPFTT QVR  FV+ LSSN+AA  QA+ FKLANEG++K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 19.4e-4543.62Show/hide
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        S  ++ L A LLS  L   V S    D K+YY SP     GTPPS                  + S+P PPSH                           
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Query:  ------GYGGTPPHYSTPTPSTPSKPPSSGGYYNPP--SSGGGSPPTIPVDPGTPSTPSTPSTP-STPSTPSTPFI--------GTCNYWLNHPGMIWGV
               +  TP H STP+  TPS PPS G Y +PP  +    +PP+  VDPGTP    +P TP   P TP TPFI        GTC+YW NHP +IWG+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCAGCAGCAGATCAGGCCAACATCTTCAAGTTAGCCAACGAGGGAAAAATTAAGCACGGAGCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AAADQANIFKLANEGKIKHGA