; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0009971 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0009971
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationchr9:43674041..43675033
RNA-Seq ExpressionLag0009971
SyntenyLag0009971
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605469.1 hypothetical protein SDJN03_02786, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-12179.44Show/hide
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XP_022947973.1 uncharacterized protein LOC111451693 [Cucurbita moschata]3.8e-12379.75Show/hide
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XP_023007066.1 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1 [Cucurbita maxima]2.5e-12279.14Show/hide
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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-12380.06Show/hide
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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]1.1e-12281.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein4.4e-10974.38Show/hide
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A0A6J1D323 uncharacterized protein LOC1110171172.9e-12177.38Show/hide
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A0A6J1G835 uncharacterized protein LOC1114516931.8e-12379.75Show/hide
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A0A6J1KXJ9 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X21.2e-11779.81Show/hide
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X11.2e-12279.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein6.0e-2638.64Show/hide
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        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS     +   D  T   +E   + C         +++++ SSS  +++S  N +  + +    L 
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                       +NG E       N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L  P PL PL
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           S       I+ LFESS+D + NRL+            SSP  +F+FLR+AEEKLY++ + E
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AT5G59350.1 unknown protein2.3e-4148.66Show/hide
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        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL     KKR  + E E+E         YAKE   L C+K+              SLQ NN  R  EV   E
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Query:  S---DIELGSSKDLLLKSSSGGGEDNGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKAPSP
            D+ELG     L+K  +GG  D G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP   +   
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Query:  LNPLSSFKPHGFNINPLFESSADLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEESKKK
         +PL S+  HGF  NPLFES  +L+ N+     SSPPPKF+F+R+AEEKL +RL+EE+K++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCTCACAGTATTCTTCTTCTTCTTCAAGTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCTCCTTCAGAGCATAGGTTTAATGATAATGTTTCATTAGATAGGTCTTTA
TGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGATAGGAGCAGAAAAGGATCAAGAACAAGAAGCTTAAGTGATCTTATTTTAACTGTTGACACTCCATTTCTAACTCCTTTGCCTTCTCCTCCATTGAAGGCTCCATCCC
CTTTAAACCCTTTGAGTTCTTTCAAACCCCATGGATTCAATATAAACCCTCTCTTTGAATCATCAGCAGATTTAGATTTGAACAGGCTATTGTCTTCACCTCCACCAAAA
TTTAGGTTCCTAAGGGAGGCAGAAGAGAAACTGTACAGAAGATTGATGGAAGAATCCAAGAAAAAGGCCTGTAAAAATGGTGGGTCAGTTGAGAATTCTGAAACTAAATC
CATTTCCAACCCCACAGCTGCAGTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGATGGGTTTTGTTCTACAAAAGAGAAAGAGCATCAAAATCATAATGTATCAGTCTCAG
TCTCACAGTATTCTTCTTCTTCTTCAAGTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCTCCTTCAGAGCATAGGTTTAATGATAATGTTTCATTAGATAGGTCTTTA
TGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSFASEVEDEFTNYAKEFFHLICWKRAAAAAAAAASSSSSSLQANNSQRNQEVRNQESDIELGSSKDLLLKSSSGG
GEDNGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKAPSPLNPLSSFKPHGFNINPLFESSADLDLNRLLSSPPPK
FRFLREAEEKLYRRLMEESKKKACKNGGSVENSETKSISNPTAAVEEEEEEEKEDGFCSTKEKEHQNHNVSVSVSQYSSSSSSSSQVLPLASSPPSEHRFNDNVSLDRSL