; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0010459 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0010459
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptiontranscription factor HHO6-like
Genome locationchr9:47420566..47421237
RNA-Seq ExpressionLag0010459
SyntenyLag0010459
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR044787 - Myb family transcription factor HRS1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022439.1 Transcription factor HHO6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-4470.5Show/hide
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XP_022927686.1 transcription factor HHO6-like [Cucurbita moschata]5.6e-4470.5Show/hide
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XP_022988809.1 transcription factor HHO6-like [Cucurbita maxima]3.0e-4571.94Show/hide
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XP_023530102.1 transcription factor HHO6-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-4470.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BZ76 uncharacterized protein LOC1034952151.5e-4273.19Show/hide
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A0A5D3C8P3 Two-component response regulator1.5e-4273.19Show/hide
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A0A6J1C203 transcription factor HHO62.1e-4473.76Show/hide
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        M SLSP  +WD  F PK+I DFLR+IS         S LD F++NLE+E+ KIDAFKRELPFCMLLLNDAILALKDSSLQC SS SSPKPKPVLEEF+SL
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A0A6J1EIC3 transcription factor HHO6-like2.7e-4470.5Show/hide
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A0A6J1JMM1 transcription factor HHO6-like1.4e-4571.94Show/hide
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        M S+SPKFTWDFRP++++DFL QIS         S L  F+ +LE+E+ KIDAFKRELPFCMLLLNDAILALK SSLQC SSS SSPK KPVLEEF+SLN
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        KDSS++NEK++DCRDK+EWMSSVQL  TDDFQN Q KTK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JRB0 Transcription factor HHO55.1e-0837.29Show/hide
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        PK ++ FL ++       S  S +D ++  LE+E NKID FKRELP CMLLLN+       AI ALKD + +  S  +S                  D+ 
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        E+ +   DK+ WMSS QL
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Q5VRW2 Transcription factor NIGTH19.1e-0535.92Show/hide
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        L  FL  LE+E  KIDAFKRELP CM LLN A+ A +         S   A+++++ +   VLEEF+ +     D    ++           +K  WM S
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Query:  VQL
         QL
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Q8VZS3 Transcription factor HHO22.0e-0430.77Show/hide
Query:  FLQNLEDELNKIDAFKRELPFCMLLLNDAILALK--------DSSLQCASSSSSPKPKPVLEEFMSLNK--------------DSSDENEKERDCRDKRE
        +++ LE+E  KI  F+RELP C+ L+  AI A +         +S QC+  ++S    PV EEF+ + K              D   E+  E     K +
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Query:  WMSSVQLLKTDDFQNPQ
        W+ SVQL       NP+
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Q9FX84 Transcription factor HHO69.1e-0533.01Show/hide
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        +D  ++ LE+E  K+++ + ELP  + +LNDAIL LKD   +C    S  + +P+L++F+S+NK    E   E   R++       Q  K +D    +IK
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        +K+
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Q9ZQ85 Myb family transcription factor EFM3.3e-0734.38Show/hide
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        MAS S + + D +P+S +  L+   +          L+  L  LE E  KIDAFKRELP CM LLN+A+   K           +++ S   +PVLEEF+
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         L       N+ E+       WM++ QL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G49560.1 Homeodomain-like superfamily protein6.5e-0633.01Show/hide
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        +D  ++ LE+E  K+++ + ELP  + +LNDAIL LKD   +C    S  + +P+L++F+S+NK    E   E   R++       Q  K +D    +IK
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        +K+
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AT1G68670.1 myb-like transcription factor family protein1.4e-0530.77Show/hide
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        +++ LE+E  KI  F+RELP C+ L+  AI A +         +S QC+  ++S    PV EEF+ + K              D   E+  E     K +
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        W+ SVQL       NP+
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AT2G03500.1 Homeodomain-like superfamily protein2.4e-0834.38Show/hide
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AT4G37180.1 Homeodomain-like superfamily protein3.0e-1139.64Show/hide
Query:  PKSITDFLRQI-------SNASTLDHFLQNLEDELNKIDAFKRELPFCMLLLNDAILALKDSSLQCASSSSSPKPKPVLEEFMSLNKDSSDENEKERDCR
        PK ++ FL ++       S  S +D ++  LE+E NKID FKRELP CMLLLN+AI ALKD + +  S  +S                  D+ E+ +   
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Query:  DKREWMSSVQL
        DK+ WMSS QL
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AT4G37180.2 Homeodomain-like superfamily protein3.7e-0937.29Show/hide
Query:  PKSITDFLRQI-------SNASTLDHFLQNLEDELNKIDAFKRELPFCMLLLND-------AILALKDSSLQCASSSSSPKPKPVLEEFMSLNKDSSDEN
        PK ++ FL ++       S  S +D ++  LE+E NKID FKRELP CMLLLN+       AI ALKD + +  S  +S                  D+ 
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Query:  EKERDCRDKREWMSSVQL
        E+ +   DK+ WMSS QL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCTTTCCCCCAAATTCACCTGGGATTTCCGTCCCAAATCCATCACTGATTTCCTCCGCCAGATTTCCAATGCCTCCACCCTCGATCATTTCCTCCAGAACTT
GGAGGATGAGTTGAACAAGATCGATGCCTTCAAGCGGGAGCTCCCCTTCTGCATGCTTCTCTTGAACGATGCCATTCTTGCTTTGAAGGACTCTTCACTGCAATGTGCCT
CTTCTTCCTCTTCCCCCAAGCCCAAACCGGTTCTCGAGGAATTCATGTCTTTGAACAAAGACTCTTCTGATGAGAACGAGAAGGAACGGGATTGTAGAGATAAGAGGGAA
TGGATGAGCTCTGTGCAGCTATTGAAGACTGATGACTTTCAAAACCCCCAAATCAAAACCAAGGTAGGTAGCTGGATAGATAGAGTAATTGTGTGTGATCTTTGTTTGTT
GCATTATTTGTCTGGAAACGAGAGGAGGGAGGCCCTCCCTCCTCCCGTCGCCGGTCCCGGAGAGGGAGGAGGGCTCCTCCTCCCTCTCCCTTTTTTTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTCTTTCCCCCAAATTCACCTGGGATTTCCGTCCCAAATCCATCACTGATTTCCTCCGCCAGATTTCCAATGCCTCCACCCTCGATCATTTCCTCCAGAACTT
GGAGGATGAGTTGAACAAGATCGATGCCTTCAAGCGGGAGCTCCCCTTCTGCATGCTTCTCTTGAACGATGCCATTCTTGCTTTGAAGGACTCTTCACTGCAATGTGCCT
CTTCTTCCTCTTCCCCCAAGCCCAAACCGGTTCTCGAGGAATTCATGTCTTTGAACAAAGACTCTTCTGATGAGAACGAGAAGGAACGGGATTGTAGAGATAAGAGGGAA
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GCATTATTTGTCTGGAAACGAGAGGAGGGAGGCCCTCCCTCCTCCCGTCGCCGGTCCCGGAGAGGGAGGAGGGCTCCTCCTCCCTCTCCCTTTTTTTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASLSPKFTWDFRPKSITDFLRQISNASTLDHFLQNLEDELNKIDAFKRELPFCMLLLNDAILALKDSSLQCASSSSSPKPKPVLEEFMSLNKDSSDENEKERDCRDKRE
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