CuGenDBv2

Gene ID	Lag0010818
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Photosystem II D2 protein
Genome location	chr1:7183434..7185446
RNA-Seq Expression	Lag0010818
Synteny	Lag0010818
Gene Ontology terms	GO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0009523 - photosystem II (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0042170 - plastid membrane (cellular component) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function) GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000484 - Photosynthetic reaction centre, L/M IPR036854 - Photosystem II protein D1/D2 superfamily

Homology

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AGW04893.1 photosystem II protein D2 [Telosma cordata]

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ASD45088.1 photosystem II protein D2 [Taeniatherum caput-medusae]

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KAB2011708.1 hypothetical protein ES319_D09G038800v1 [Gossypium barbadense]

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NP_039294.1 photosystem II protein D2 [Marchantia paleacea]

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YP_009471439.1 PsbD [Allium victorialis]

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A0A1B1MT53 Photosystem II D2 protein

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A0A218KG45 Photosystem II D2 protein

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A0A4D5YC34 Photosystem II D2 protein

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A0A5J5PYM0 Uncharacterized protein

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Q4FFP0 Photosystem II D2 protein (Fragment)

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A4QJB0 Photosystem II D2 protein

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A4QJJ4 Photosystem II D2 protein

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Q3V539 Photosystem II D2 protein

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Q4FFP4 Photosystem II D2 protein

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Q85FM2 Photosystem II D2 protein

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Arabidopsis top hits

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ATCG00020.1 photosystem II reaction center protein A

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44.44

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        S P+A   +VFLIYP+GQ  +      G++  F F++ FQ  HN  ++PFHM+GVAGV G +L  A+HG+ +
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ATCG00270.1 photosystem II reaction center protein D

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Sequences

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CDS sequence

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ATGAATCTCCTTCTTTTTGCCACTGAAGTTCCCAATCAAATTCGTCATAACACTCATAATGATCGACTTTACGAAGATCCCATGATCCAACTTTCTATTCACTCGTGGGA
TCCGGGCGGTCCGGGGGACCACCTCGGCTCCTCTCTTCTCGAGAATCCATACATCCCTTATCAGTATATGGACAGCTATCTCTCAAGCACAGGTTTAGGTTCGGGTCCAA
TTGCTGTTTTTGTTTCTGTATTCTTGATTTATCCACTAGGTCAGTCTGGTTGGTTCTTTACGCCTAGTTTTGGTGTAGCAGCTATATTTCGTTTCATCCTCTTTTTCCAG
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mRNA sequence

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Protein sequence

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GFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGASIPLM

Lag0010818 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome