| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| ADJ18449.1 gag/pol protein, partial [Bryonia dioica] | 3.3e-31 | 66.67 | Show/hide |
Query: QAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRV
+AP T K KK AD+GKCFHC +DGHWKRNC KYL EKKA+K A Q KYDL+++ETCLVE D ST IL++GATNH+C S QE SSWK L+EGE+TL+V
Subjt: QAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRV
Query: GTRHAVSAKAV
GT VSA+AV
Subjt: GTRHAVSAKAV
|
|
| KAA0041922.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.0e-29 | 54.41 | Show/hide |
Query: FEKGASTTP-----ARQAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
FE+G+S+ P I KKGK KK A +GKC+HC EDGHW RNCLKY+ +KKA+K Q K+DL+++ETCLVE +NST IL++GA
Subjt: FEKGASTTP-----ARQAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
Query: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
NH+C S QE SSWK L EG++TL+VGTR SAKAV
Subjt: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| KAA0048404.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.8e-28 | 58.68 | Show/hide |
Query: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
+KG A A K KK A +G CFHC ++GHWKRNC KYL EKK AKQ KYDL+++ETCLVE D+S I+++GATNHVCSS Q ISSW+
Subjt: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
Query: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
LE GE+T+RVGT H VSA AV
Subjt: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| KAA0059877.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.4e-29 | 55.88 | Show/hide |
Query: FEKGASTT----PAR-QAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
F++G+S+ P+R I KKGK KK A++GKC+HC E+GHW RNCLKYL +KKA+K Q KYDL+++ETCLVE +NST IL++GAT
Subjt: FEKGASTT----PAR-QAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
Query: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
NH+C S QE SSWK L EG++TL+VGT VSAKAV
Subjt: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| TYK14550.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.8e-28 | 58.68 | Show/hide |
Query: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
+KG A A K KK A +G CFHC ++GHWKRNC KYL EKK AKQ KYDL+++ETCLVE D+S I+++GATNHVCSS Q ISSW+
Subjt: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
Query: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
LE GE+T+RVGT H VSA AV
Subjt: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SMH8 Gag/pol protein | 2.8e-28 | 58.68 | Show/hide |
Query: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
+KG A A K KK A +G CFHC ++GHWKRNC KYL EKK AKQ KYDL+++ETCLVE D+S I+++GATNHVCSS Q ISSW+
Subjt: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
Query: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
LE GE+T+RVGT H VSA AV
Subjt: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| A0A5D3CPJ6 Gag/pol protein | 2.8e-28 | 58.68 | Show/hide |
Query: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
+KG A A K KK A +G CFHC ++GHWKRNC KYL EKK AKQ KYDL+++ETCLVE D+S I+++GATNHVCSS Q ISSW+
Subjt: EKGASTTPARQAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKV
Query: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
LE GE+T+RVGT H VSA AV
Subjt: LEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| A0A5D3D345 Gag/pol protein | 1.9e-29 | 54.41 | Show/hide |
Query: FEKGASTTP-----ARQAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
FE+G+S+ P I KKGK KK A +GKC+HC EDGHW RNCLKY+ +KKA+K Q K+DL+++ETCLVE +NST IL++GA
Subjt: FEKGASTTP-----ARQAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
Query: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
NH+C S QE SSWK L EG++TL+VGTR SAKAV
Subjt: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| A0A5D3DMH3 Gag/pol protein | 6.7e-30 | 55.88 | Show/hide |
Query: FEKGASTT----PAR-QAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
F++G+S+ P+R I KKGK KK A++GKC+HC E+GHW RNCLKYL +KKA+K Q KYDL+++ETCLVE +NST IL++GAT
Subjt: FEKGASTT----PAR-QAPITKKGK---------KKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGAT
Query: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
NH+C S QE SSWK L EG++TL+VGT VSAKAV
Subjt: NHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRVGTRHAVSAKAV
|
|
| E2GK51 Gag/pol protein (Fragment) | 1.6e-31 | 66.67 | Show/hide |
Query: QAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRV
+AP T K KK AD+GKCFHC +DGHWKRNC KYL EKKA+K A Q KYDL+++ETCLVE D ST IL++GATNH+C S QE SSWK L+EGE+TL+V
Subjt: QAPITKKGKKKAADEGKCFHCREDGHWKRNCLKYLVEKKAKKAEAAKQDKYDLIIIETCLVEQDNSTQILNTGATNHVCSSLQEISSWKVLEEGEVTLRV
Query: GTRHAVSAKAV
GT VSA+AV
Subjt: GTRHAVSAKAV
|
|
