CuGenDBv2

Gene ID	Lag0011055
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	F-box protein
Genome location	chr1:13385456..13386102
RNA-Seq Expression	Lag0011055
Synteny	Lag0011055
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR040275 - F-box domain containing protein At5g39450-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0034917.1 F-box protein [Cucumis melo var. makuwa]

2.8e-50

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KAG7027562.1 F-box protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.4e-49

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TYK05457.1 F-box protein [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_004146388.1 F-box protein At5g39450 [Cucumis sativus]

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XP_008442106.1 PREDICTED: F-box protein At5g39450 [Cucumis melo]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0KYP4 F-box domain-containing protein

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A0A1S3B4Y6 F-box protein At5g39450

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A0A5A7T016 F-box protein

1.4e-50

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A0A5D3C0Y1 F-box protein

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A0A6J1HMF8 F-box protein At5g39450

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SwissProt top hits

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Q8RWD6 F-box protein At5g39450

3.1e-23

46.46

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        LRKG  V  LPP +NF+YL K ++NVF
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Q9FLY7 Probable F-box protein At5g39490

4.0e-15

37.69

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        L+K  G  VP   P  NF+Y+  S  N FT
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Q9FLY8 Putative F-box protein At5g39480

9.9e-22

42.86

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Q9FLZ1 Putative F-box protein At5g39460

2.8e-16

38.41

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        ++    TKIL  +++  HPNGS+MF VNI+ PS +PFP+++DG     +         Y +R    +        N  LAF+W+ ++ V+T QR+NL E+
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        L+K  G  V  L PT NF+Y  +SYSNVF      S+S
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G39450.1 F-box family protein

2.2e-24

46.46

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        LRKG  V  LPP +NF+YL K ++NVF
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AT5G39460.1 F-box family protein

2.0e-17

38.41

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AT5G39480.1 F-box family protein

7.0e-23

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AT5G39490.1 F-box family protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAGAAATCCCAAGGACAAGTATTTCATTGCAACAAAAATATTGGAAGGCACCCACTACGTTTTACATCCTAATGGTTCTGCAATGTTCAGAGTGAATATTAACGAACC
TTCGTCAGATCCATTTCCTTGGGAGTCTGATGGGGATCTATTGCCTTTGAATGTTCAGTACGTTTACAGGAGAGCGAATTGCCAATGGAATGGTCAACTGGCCTTCATTT
GGAAGGAGTCTAAATCTGTCCTGACCTTTCAAAGATTGAACTTACAAGAGCTTCTGAGAAAAGGTGAAAGAGTACCTTCTCTACCACCAACTGTCAACTTTTCCTATCTA
ACCAAGTCATACTCAAATGTCTTCACTGGCTTCCCGAACACTTCTACTAGTTTCTCCTTGCCAAGGAGCAAAAACTTGTTTCTCTGTTCACCATATTTTTGCTACAAGTT
ACTTGTCAAACTGGGAGTTGATAAAGTTGATTCAGCTGAAACCAAGTGGTGGGCTTTAGTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MRNPKDKYFIATKILEGTHYVLHPNGSAMFRVNINEPSSDPFPWESDGDLLPLNVQYVYRRANCQWNGQLAFIWKESKSVLTFQRLNLQELLRKGERVPSLPPTVNFSYL
TKSYSNVFTGFPNTSTSFSLPRSKNLFLCSPYFCYKLLVKLGVDKVDSAETKWWALV

Lag0011055 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome