| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0046028.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.4e-15 | 52.58 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVNLLDGV
V + RNRTLL+MVRSM+SYAQLPSSF G+ V A VE LS+++ MNDVD DQ +K MDLEM+S++FNS+W+LV+L +GV
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVNLLDGV
|
|
| KAA0048103.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.9e-09 | 42.11 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
V + RNRTLL+MVR M+S+AQLP SF G+A+ TA +E L++++ MND+D DQ +K +DL+M+S++ NS+W LV+
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
|
|
| TYJ96447.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-09 | 43.16 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
V + RNRTLL+MVR M+S+AQLP SF G+A+ TA +E L++++ MND+D DQ +K +DLEM+S++ NS+W LV+
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
|
|
| TYK01836.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.0e-09 | 40.19 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFN
VL+ RNRTLL+MVRSM+S+AQLP SF +A+ TA ++ L++++ MNDVD DQ +K MDLEM+S++ N
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFN
Query: SIWDLVN
S+W LV+
Subjt: SIWDLVN
|
|
| TYK11909.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.7e-12 | 42.86 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAV-------------------------------LT---------AVEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLE
V + RNRTLLNM RSM+SYAQLPSSF G+ V LT VE LS+++ MNDVD DQ +K MDLE
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAV-------------------------------LT---------AVEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLE
Query: MKSLHFNSIWDLVNLLDGV
++S++FNS+W+LV+L +GV
Subjt: MKSLHFNSIWDLVNLLDGV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TT32 Gag/pol protein | 3.1e-15 | 52.58 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVNLLDGV
V + RNRTLL+MVRSM+SYAQLPSSF G+ V A VE LS+++ MNDVD DQ +K MDLEM+S++FNS+W+LV+L +GV
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVNLLDGV
|
|
| A0A5A7TWX1 Gag/pol protein | 3.3e-09 | 42.11 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
V + RNRTLL+MVR M+S+AQLP SF G+A+ TA +E L++++ MND+D DQ +K +DL+M+S++ NS+W LV+
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
|
|
| A0A5D3BBF3 Gag/pol protein | 1.1e-09 | 43.16 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
V + RNRTLL+MVR M+S+AQLP SF G+A+ TA +E L++++ MND+D DQ +K +DLEM+S++ NS+W LV+
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFNSIWDLVN
|
|
| A0A5D3BUC7 Gag/pol protein | 4.3e-09 | 40.19 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFN
VL+ RNRTLL+MVRSM+S+AQLP SF +A+ TA ++ L++++ MNDVD DQ +K MDLEM+S++ N
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAVLTA---------------------------------VEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLEMKSLHFN
Query: SIWDLVN
S+W LV+
Subjt: SIWDLVN
|
|
| A0A5D3CNQ8 Gag/pol protein | 4.2e-12 | 42.86 | Show/hide |
Query: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAV-------------------------------LT---------AVEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLE
V + RNRTLLNM RSM+SYAQLPSSF G+ V LT VE LS+++ MNDVD DQ +K MDLE
Subjt: VLKTRNRTLLNMVRSMLSYAQLPSSFRGHAV-------------------------------LT---------AVEGSLSFRKKMNDVDNDQRIKVMDLE
Query: MKSLHFNSIWDLVNLLDGV
++S++FNS+W+LV+L +GV
Subjt: MKSLHFNSIWDLVNLLDGV
|
|
