; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0011581 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0011581
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein cornichon homolog 1 isoform X2
Genome locationchr1:28269915..28276024
RNA-Seq ExpressionLag0011581
SyntenyLag0011581
Gene Ontology termsGO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003377 - Cornichon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008442270.1 PREDICTED: protein cornichon homolog 1 isoform X2 [Cucumis melo]4.5e-6893.84Show/hide
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XP_022928681.1 protein cornichon homolog 1-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.0e-6793.15Show/hide
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XP_022967917.1 protein cornichon homolog 1-like isoform X2 [Cucurbita maxima]5.9e-6893.15Show/hide
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XP_038883916.1 protein cornichon homolog 1 isoform X2 [Benincasa hispida]7.7e-6893.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4V0 protein cornichon homolog 1 isoform X22.2e-6893.84Show/hide
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A0A6J1DFC9 protein cornichon homolog 1-like isoform X21.2e-6690.41Show/hide
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A0A6J1EKZ6 protein cornichon homolog 1-like isoform X24.9e-6893.15Show/hide
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A0A6J1HS45 protein cornichon homolog 1-like isoform X22.9e-6893.15Show/hide
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A0A6J1HTX3 protein cornichon homolog 1-like isoform X12.7e-6689.04Show/hide
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        + LKREKYFR AKLIFYLLLFL+VIFRLTLSAFN+LSDEDDVLHLF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3EDD7 Probable protein cornichon homolog 25.4e-2448.33Show/hide
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        L   + IF +  SA +   D
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Q84W04 Protein cornichon homolog 42.4e-2749.62Show/hide
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          RL KL + +L   + IF +  SA +   D
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Q8GWT5 Protein cornichon homolog 39.9e-2648.85Show/hide
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        W ISF I + LL L  YQL+ L DLE DY+N YDS+SRIN +V+PE ++QG LC  +++TGHWFM L+ VP   Y+ +L+ +++HLIDVTE+F  L  EK
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Q9C7D7 Protein cornichon homolog 12.4e-4056.85Show/hide
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        R +  EK  R  KL FY+ LF++V+FRLTLSA  S +++DD+LHLF
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Q9SZ74 Protein cornichon homolog 53.3e-2142.86Show/hide
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        K E+  R+ K+    L   I  + L  SA   +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12340.1 Cornichon family protein3.9e-2548.33Show/hide
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        L    + L+ L DLE DY+N YDS+SRIN +V+PEF+VQGVLC  +++TGHWFM L+ +P   Y+ +L+ KR+HL+DVTE+F  L  EK  RL KL + +
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        L   + IF +  SA +   D
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AT1G12390.1 Cornichon family protein1.7e-2849.62Show/hide
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          RL KL + +L   + IF +  SA +   D
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AT1G62880.1 Cornichon family protein7.0e-2748.85Show/hide
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        W ISF I + LL L  YQL+ L DLE DY+N YDS+SRIN +V+PE ++QG LC  +++TGHWFM L+ VP   Y+ +L+ +++HLIDVTE+F  L  EK
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          RL KL + +L   + IF L  S  +   D
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AT3G12180.1 Cornichon family protein1.7e-4156.85Show/hide
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        R +  EK  R  KL FY+ LF++V+FRLTLSA  S +++DD+LHLF
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AT4G12090.1 Cornichon family protein2.3e-2242.86Show/hide
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        +L+ W ISF     L+++  YQL  L DLE D +N YD SSRIN++V+PEF +QG+LC  +++TGHWFM ++++P   Y++ L++KREHL DVTE++   
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        K E+  R+ K+    L   I  + L  SA   +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTGGAATCTGATCTTTTGGTTCATCTCTTTCTGTATCAACGTCGCCCTCCTCGTCCTCAACTTTTACCAGCTTTTGGTATTGACGGATTTGGAGGCAGATTATTT
GAACATCTATGATTCATCTTCCCGCATTAATAAACTTGTCATTCCAGAGTTCTTAGTGCAAGGAGTACTTTGCTCTCTTTTCGTCATCACAGGCCACTGGTTCATGTTCC
TTATAACCGTCCCTCTTACCTGCTATCACCTAAATTTGTTCCTGAAGAGGGAGCATCTTATTGATGTTACTGAGGTGTTTAGAGCTCTTAAACGTGAGAAGTATTTTCGT
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A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAWNLIFWFISFCINVALLVLNFYQLLVLTDLEADYLNIYDSSSRINKLVIPEFLVQGVLCSLFVITGHWFMFLITVPLTCYHLNLFLKREHLIDVTEVFRALKREKYFR
LAKLIFYLLLFLIVIFRLTLSAFNSLSDEDDVLHLF