; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0011750 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0011750
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein rough sheath 2 homolog
Genome locationchr1:32172694..32174720
RNA-Seq ExpressionLag0011750
SyntenyLag0011750
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036747.1 Transcription factor AS1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.7e-2078.05Show/hide
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XP_022949284.1 protein rough sheath 2 homolog [Cucurbita moschata]9.7e-2078.05Show/hide
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XP_023521553.1 transcription factor AS1-like, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.7e-2078.05Show/hide
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XP_023525837.1 protein rough sheath 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.7e-2078.05Show/hide
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XP_038907190.1 protein rough sheath 2 homolog [Benincasa hispida]2.2e-1984.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CEX4 LOW QUALITY PROTEIN: transcription factor AS1-like5.4e-1676.47Show/hide
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A0A5D3CNU9 Transcription factor AS1-like5.4e-1676.47Show/hide
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A0A6J1FAF4 protein rough sheath 2 homolog2.2e-1774.07Show/hide
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        PRL VP+ DPVLSL SVSSTTSS TVLPLWMNVNSTSTASSST+STTP PS+SLTL+PSEPA L+SE  R      + ALV
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A0A6J1GCE3 protein rough sheath 2 homolog4.7e-2078.05Show/hide
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A0A6J1KCH4 protein rough sheath 2 homolog1.8e-1976.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTCGCCTTCCCGTACCCGACGTCGATCCGGTCCTCTCGCTCAGATCCGTCAGCTCCACGACGTCGTCTTCCACCGTCCTCCCTCTGTGGATGAACGTCAAC
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GGTTTCGGCTGTAGTGGGGGCGTGGGTGTTGATTGTGCGGCGTGGGTCTCGACAGAAGGGCTATTTCCGACGAGTTTTACGATGTTTTTCGACGAGCAACAATTC
GATCTAAGCGAACAACTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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