CuGenDBv2

Gene ID	Lag0012105
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	chr1:37371599..37373694
RNA-Seq Expression	Lag0012105
Synteny	Lag0012105
Gene Ontology terms	GO:0050789 - regulation of biological process (biological process)
InterPro domains	IPR036691 - Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

1.0e-104

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        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SS
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        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F AAP  G+S + +FG   S+ S
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        S  PSFG   S  S       A               S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
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        AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   
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        K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSA VSLSLPTK+LTAAS
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        SSQAPASF
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XP_022959229.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata]

1.0e-104

67.72

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        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F AAP  G+S + +FG   S+ S
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        S  PSFG   S  S       A               S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
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XP_023006514.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima]

2.6e-105

65.25

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        G SGS+LF A+SSSGGL+SF FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP                                          APLFG+AP    
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Query:  ------------------------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA
                                 SGSSS   F AAPSVGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGT A TAS G ++  ASAAASGS+S L          
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            FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSF
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        GTPASSASQSSFGF+ISNAAS  GS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPS  SSGA
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        ASSFTGFG+TSTA+SSSA VSLSLPTK+LTAASSSQAPASF
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.8e-104

66.48

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        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SS
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        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG+SSS                            SGTS APL G+  SSGSSP P FGAAP SGSS   LF +APS G+
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Query:  SASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSS
        S    FG   S  SS  PSFG  +S+ S       A               S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SS
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        S+STS LF SSSSSAS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNA
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        ASTGGS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSA 
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        VSLSLPTK+LTAASSSQAPASF
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

2.6e-105

72.49

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        S   + SSSSPFSS+TGF+FGSTSAFSFG        SSSSSSNP SSSS FSNQ+ NPA SSS  FG   FPSS SSP SFS       LFG+  SSG 
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Query:  LTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFG-TPASTASQGLTLLAASAAASGS
         ++  FG +SSSG+S AP  G  +SSGSS  P FGA P SGSSS  LF A PS G SA S+FGG+SS T+SSAP FG T ASTAS G  L  AS AASGS
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        +S LFGTS++SGS+GSA FGS+PF     G SSS+STS LF SSSSS S SPFQNS SSSSSQNL+SSS FAA   SSSSGF FST SLSK TSIT  +S
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        SSSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+AP T  TK PTSL  S+SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFS SSSAAT
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        TLSIAASS PS +SSGA SSFTGFGVTS ASSSSA  SLSLPTKT TAASSSQAPASF
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

1.3e-102

68.57

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        MSGF FG      SSSSPFSS TGF+FGST+ FSFG         SSSSSSNP SSSS F N +SNP PSSS SFG     F SSTSSP SF        
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Query:  --------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASS----------GSSPAPLFGAAPFSGS---------------SSGSLFA
                SS  S SSLFG +SSS G  SF FG SSSS  SSAPL GA +SS          GSSPAP FGAAP SGS               SS  LF 
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Query:  AAPSVG-TSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSS-SSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA
        AAPS G +SA S+FGG SS T+SSAP FGT AS AS G  L  ASA ASGS + LFGTS+ SSGS GS  FGS+PF ASSSGTSSS+STS LF SS SS 
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Query:  SVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNV--SSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAV
          SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGF F T++LSK TSITNV  SSSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGS+AP T  
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Query:  TKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAA
        TK PTSL  S SVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASSAPS ASSG  SSFTGFGVTS+ASSSSA  SLSLPTKT TAA
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Query:  SSSQAPASF
        SSSQAPASF
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A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2

1.7e-89

65.1

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Query:  MSGFSFGSSS---------SPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLT
        MSGF FGSSS         SPFSS++GFAFGSTS FSFGSS     P++S      SSNP    SP FG PSS                     SSGGL 
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Query:  SFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAP------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAA
        SF FG + S+G+SS  L GA  ++GSS   +FGAAP       +GSSS SLF AAPS G SA S+FGG SS            A T + G  L  ASAAA
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Query:  SGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSK
        SGS SPLFGT+SSSGS+GSA F         GSNPF  SSSG         LF SS+S AS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAASSSSGF F TTS SK
Subjt:  SGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSK

Query:  ATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA
        AT+    SSSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST  SAAPGT  TK PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQ SFSVPA
Subjt:  ATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPA

Query:  FSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF
        FSLSSSAATT+S AASS PS ASSGAASS+TGFGVT+TASSSSA VSLSLPTKTLTA+SSSQAPASF
Subjt:  FSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

4.9e-105

67.72

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SS
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Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTS
        GSSGSSLF A+SSSGGL+SF FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F AAP  G+S + +FG   S+ S
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Query:  SSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS
        S  PSFG   S  S       A               S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
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Query:  ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVT
        AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   
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        K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA+SSSA VSLSLPTK+LTAAS
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        SSQAPASF
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A0A6J1H7F5 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2

4.9e-105

67.72

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Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SS
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Query:  SSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS
        S  PSFG   S  S       A               S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
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        SSQAPASF
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A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

1.3e-105

65.25

Show/hide

Query:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SS
        MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSNQ+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SS
Subjt:  MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SS

Query:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP------------------------------------------APLFGAAP----
        G SGS+LF A+SSSGGL+SF FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP                                          APLFG+AP    
Subjt:  GSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP------------------------------------------APLFGAAP----

Query:  ------------------------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA
                                 SGSSS   F AAPSVGTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGT A TAS G ++  ASAAASGS+S L          
Subjt:  ------------------------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA

Query:  GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSF
            FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSF
Subjt:  GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSF

Query:  GTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGA
        GTPASSASQSSFGF+ISNAAS  GS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPS  SSGA
Subjt:  GTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGA

Query:  ASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF
        ASSFTGFG+TSTA+SSSA VSLSLPTK+LTAASSSQAPASF
Subjt:  ASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q75JC9 Uncharacterized protein DDB_G0271670

4.1e-08

42.21

Show/hide

Query:  SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAP
        +SSS  SS++  +  S+S+ S  SSSSSS+ SSSS+ S+ SS+ + SSS S    SS+SS  S SS SS SS   ++SSS   +S +   SSSS +SS+ 
Subjt:  SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAP

Query:  LLGAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF
           + +SS SS +    ++  S SSS S  +++ S  +S+SS     SS++SSS+ S  + +S++S   +  ++S+++S S+S    +SSSS S+ S+  
Subjt:  LLGAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF

Query:  GSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPAS
         S+  ++SSS +SSS S+S+  +SSSSS+S S   +S SSSSS + SSSS  ++SSSS    S++S S ++S ++ SSSSSS +S+S+SSSS S  + +S
Subjt:  GSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPAS

Query:  SASQSSFG
        S+S SS G
Subjt:  SASQSSFG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

9.1e-16

40.04

Show/hide

Query:  SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFG
        +GF FGS  SS+P SS T   GF   ST +F FGSS+SSS P  S  F + +S    S++PSFGF ++ SS     S   GSS   A+S++ G + F F 
Subjt:  SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFG

Query:  ISSSSGTS--SAPLLGAPASSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGS
         SS+S T+  S+ L GAPASS ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A  S   S SS+FG  SS  +S++P FG P S+A+      + +++A GS
Subjt:  ISSSSGTS--SAPLLGAPASSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGS

Query:  NSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT
        +S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS   SS+ ST +LF SSSS A   S SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GF F  +
Subjt:  NSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT

Query:  SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-
        + S  TS    S++ S+    ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG SAAP ++ +    S+          +T TTTS+STPAA S    S 
Subjt:  SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-

Query:  ----FSVPAFSLSSSAATTLSIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKTLTA--ASSSQAPASFVCMIP
             + P+F ++SSA  T   ++++         A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SLP+ T T   A+SS        ++P
Subjt:  ----FSVPAFSLSSSAATTLSIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKTLTA--ASSSQAPASFVCMIP

Query:  LFNGKFT
          +G  T
Subjt:  LFNGKFT

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

6.5e-17

40.04

Show/hide

Query:  SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFG
        +GF FGS  SS+P SS T   GF   ST +F FGSS+SSS P  S  F + +S    S++PSFGF ++ SS     S   GSS   A+S++ G + F F 
Subjt:  SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFG

Query:  ISSSSGTS--SAPLLGAPASSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGS
         SS+S T+  S+ L GAPASS ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A  S   S SS+FG  SS  +S++P FG P S+A+      + +++A GS
Subjt:  ISSSSGTS--SAPLLGAPASSGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGS

Query:  NSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT
        +S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS   SS+ ST +LF SSSS A   S SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GF F  +
Subjt:  NSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT

Query:  SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-
        + S  TS    S++ S+    ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG SAAP ++ +    S+          +T TTTS+STPAA S    S 
Subjt:  SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-

Query:  ----FSVPAFSLSSSAATTLSIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKTLTA--ASSSQAPASFVCMIP
             + P+F ++SSA  T   ++++         A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SLP+ T T   A+SS        ++P
Subjt:  ----FSVPAFSLSSSAATTLSIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKTLTA--ASSSQAPASFVCMIP

Query:  LFNGKFT
          +G  T
Subjt:  LFNGKFT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAA
CCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTG
GAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGG
GCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGC
TTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAG
CGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCG
TCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTC
ACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTT
CAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCA
GGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCAC
AACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGA
GTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCA
GCCTCTTTCGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATAC
CTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGA
ACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLG
APASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTS
SSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAP
GTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAP
ASFVCMIPLFNGKFTWANNRACSRIDRILCAQGWMDTFKCVKQSLGPRVTSDHWPLIFVSGPQKWGPCPFRFENMWLDHPSFKSSFQSWWMLRFQGSGKATDL

Lag0012105 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome