; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0012402 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0012402
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationchr1:40822079..40823834
RNA-Seq ExpressionLag0012402
SyntenyLag0012402
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005874 - microtubule (cellular component)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QFZ79246.1 tubulin beta-1 chain [Luffa aegyptiaca]1.2e-26099.78Show/hide
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA+++YYEE+EEE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29501 Tubulin beta-2 chain (Fragment)1.4e-25395.49Show/hide
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        MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAE+D YEE+EE+  +E
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P37392 Tubulin beta-1 chain5.3e-25695.96Show/hide
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA++D YE ++EEE+ E
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Q40106 Tubulin beta-2 chain1.0e-25495.96Show/hide
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA++D YE ++EEEV E
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Q6VAF4 Tubulin beta-9 chain3.8e-25495.72Show/hide
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        EGMDEMEFTEAES+MNDLVSEYQQYQDATA+D+ YEE+EE E E
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Q8H7U1 Tubulin beta-2 chain1.0e-25496.17Show/hide
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA+D+   EDEEEE +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G12250.1 beta-6 tubulin1.8e-25194.58Show/hide
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AT5G23860.1 tubulin beta 81.0e-25495.72Show/hide
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AT5G23860.2 tubulin beta 81.0e-25495.72Show/hide
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        VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMM
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AT5G62690.1 tubulin beta chain 22.3e-25496.37Show/hide
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AT5G62700.1 tubulin beta chain 32.3e-25496.37Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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