; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0013584 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0013584
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRWP-RK domain-containing protein
Genome locationchr1:51396417..51397348
RNA-Seq ExpressionLag0013584
SyntenyLag0013584
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003035 - RWP-RK domain
IPR044607 - Transcription factor RKD-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004134999.1 protein RKD5 isoform X2 [Cucumis sativus]2.3e-8586.08Show/hide
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XP_011658076.1 protein RKD5 isoform X1 [Cucumis sativus]8.8e-8583.92Show/hide
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XP_016899254.1 PREDICTED: protein RKD5 [Cucumis melo]1.9e-8786.67Show/hide
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XP_038882831.1 protein RKD5 isoform X1 [Benincasa hispida]1.1e-8786.8Show/hide
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XP_038882834.1 protein RKD5 isoform X2 [Benincasa hispida]2.9e-8889.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGY8 RWP-RK domain-containing protein1.1e-8586.08Show/hide
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A0A1S4DTD9 protein RKD59.1e-8886.67Show/hide
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        M+N HLSCF  GEL +L +GK HQPRNLPLLDQDLNFLPCSV+VS+GS NQM+ESC+     EKKRRATSEHIAGI LSDL+K FGVPITEASRNLNVGL
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A0A5A7SHH9 Protein RKD59.1e-8886.67Show/hide
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A0A6J1BWV1 protein RKD52.8e-8186.96Show/hide
Query:  SKLNDGKFHQPRNLPLLDQDLNFLPCSVAVSEGSENQMKESCEP--------EKKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREF
        S LN+GKFHQPRNLPLL+QDLNFLPCS A SEGSENQMKES EP        EKK+RATSEHIAGI LSDL+KYF +PITEASRNLNVGLTVLKRKCREF
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        GIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQ MLQ+ERESIE TPFRELE ET+RFRQDVFRRRHKARALESQG
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A0A6J1GEC7 protein RKD5-like isoform X16.8e-7577.14Show/hide
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        S F +E   VAD M +++LSCF      KLND KF        L QDLNFLPC  S+AVS+G E +QMKE CEP   +KKRRATSEHIAGIALSDL+KYF
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Query:  GVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRH
         VPITEASR+LNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREED KALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELE ETKRFRQDVF+RRH
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Query:  KARALESQGP
        KARAL S  P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81791 Protein RKD51.7e-3851.89Show/hide
Query:  QPRNLPLLDQDLNFLPCSVAVSEGSENQMKESCEPE-----------------KKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREF
        +PR L +L QDLN LP S   SE S N+  E  E E                 KK+R  S H+A ++L +LSKYF + I EASRNL VGLTVLK+KCREF
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Query:  GIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEA-KHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKA-RALESQ
        GI RWPHRKIKS+D LI DLQ EA K +E++  A MAV K+Q  L+ E+ +I + PF E+ IETK+FRQ+ F++RH+A RA ++Q
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Q9CA66 Protein RKD22.8e-1741.13Show/hide
Query:  TSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRE
        TS     ++   +S+YF +PIT+A+  LNVGLT+LKR+CRE GI RWPHRK+ S++ LI +++E  K   E++   +       ML+ E+ +IE  P  E
Subjt:  TSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRE

Query:  LEIETKRFRQDVFRRRHKARALES
         + +TKR RQ  F+  HK +   S
Subjt:  LEIETKRFRQDVFRRRHKARALES

Q9FGD1 Protein RKD34.0e-1638.36Show/hide
Query:  NQMKESCEPEK---KRRATSEHIAGIALSDLSK-YFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLI---RDLQEEAKHREEDHKALMA
        N MKE    ++   KRR   + +      ++ K YF +PIT+A++ LN+G+T+LK++CRE GI RWPHRK+ S++ LI   +DL    K R    K   A
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Query:  VTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKARALES
        +     +L+ E++ IE  P  E   +TKR RQ  F+ ++K R L S
Subjt:  VTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKARALES

Q9LVU8 Protein RKD41.4e-1634.73Show/hide
Query:  PRNLPLLDQDLNFLPCSVAVS------EGSENQMK-ESCEPEKKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIK
        P ++ LL Q+  F   S + S      +G  + +K E    +KKR    +    + +S++ ++F  PI +A++ LNVGLTVLK++CRE GI+RWPHRK+K
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Query:  SIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR
        S++ LI++L+      E  +            L+  R  IE+ P  EL   TK+ RQ  F+  +K R
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Q9M9U9 Protein RKD14.3e-1838.89Show/hide
Query:  SENQMKESCEPEKKRRATSEHIAGIALS------DLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQE-EAKHREEDHKAL
        S+   K      KKRR   E  +  ++S       +S YF +PIT+A+R LN+GLT+LK++CRE GI RWPHRK+ S+  LI +++E E    EE+   L
Subjt:  SENQMKESCEPEKKRRATSEHIAGIALS------DLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQE-EAKHREEDHKAL

Query:  MAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR
            ++   L+ E+++IE+ P  + E +TKR RQ  F+  HK +
Subjt:  MAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18790.1 RWP-RK domain-containing protein3.1e-1938.89Show/hide
Query:  SENQMKESCEPEKKRRATSEHIAGIALS------DLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQE-EAKHREEDHKAL
        S+   K      KKRR   E  +  ++S       +S YF +PIT+A+R LN+GLT+LK++CRE GI RWPHRK+ S+  LI +++E E    EE+   L
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Query:  MAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR
            ++   L+ E+++IE+ P  + E +TKR RQ  F+  HK +
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AT1G74480.1 RWP-RK domain-containing protein2.0e-1841.13Show/hide
Query:  TSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRE
        TS     ++   +S+YF +PIT+A+  LNVGLT+LKR+CRE GI RWPHRK+ S++ LI +++E  K   E++   +       ML+ E+ +IE  P  E
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Query:  LEIETKRFRQDVFRRRHKARALES
         + +TKR RQ  F+  HK +   S
Subjt:  LEIETKRFRQDVFRRRHKARALES

AT4G35590.1 RWP-RK domain-containing protein1.2e-3951.89Show/hide
Query:  QPRNLPLLDQDLNFLPCSVAVSEGSENQMKESCEPE-----------------KKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREF
        +PR L +L QDLN LP S   SE S N+  E  E E                 KK+R  S H+A ++L +LSKYF + I EASRNL VGLTVLK+KCREF
Subjt:  QPRNLPLLDQDLNFLPCSVAVSEGSENQMKESCEPE-----------------KKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREF

Query:  GIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEA-KHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKA-RALESQ
        GI RWPHRKIKS+D LI DLQ EA K +E++  A MAV K+Q  L+ E+ +I + PF E+ IETK+FRQ+ F++RH+A RA ++Q
Subjt:  GIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEA-KHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKA-RALESQ

AT5G53040.1 RWP-RK domain-containing protein9.8e-1834.73Show/hide
Query:  PRNLPLLDQDLNFLPCSVAVS------EGSENQMK-ESCEPEKKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIK
        P ++ LL Q+  F   S + S      +G  + +K E    +KKR    +    + +S++ ++F  PI +A++ LNVGLTVLK++CRE GI+RWPHRK+K
Subjt:  PRNLPLLDQDLNFLPCSVAVS------EGSENQMK-ESCEPEKKRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIK

Query:  SIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR
        S++ LI++L+      E  +            L+  R  IE+ P  EL   TK+ RQ  F+  +K R
Subjt:  SIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKAR

AT5G66990.1 RWP-RK domain-containing protein2.9e-1738.36Show/hide
Query:  NQMKESCEPEK---KRRATSEHIAGIALSDLSK-YFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLI---RDLQEEAKHREEDHKALMA
        N MKE    ++   KRR   + +      ++ K YF +PIT+A++ LN+G+T+LK++CRE GI RWPHRK+ S++ LI   +DL    K R    K   A
Subjt:  NQMKESCEPEK---KRRATSEHIAGIALSDLSK-YFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLI---RDLQEEAKHREEDHKALMA

Query:  VTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKARALES
        +     +L+ E++ IE  P  E   +TKR RQ  F+ ++K R L S
Subjt:  VTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETKRFRQDVFRRRHKARALES


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCATGGTCTGAATCTGGTTTATAACCTCTCAATCTGCTTCTCTTTTTACCAACTCGGTTCGTCACTTTGTCCTGTTATTTCTGCAGACTATCATTTGCAGATAAAAGA
TAGTTTTTTTGATTCAGAACTTCAAAAAGTTGCAGATCAGATGGAGAATGCTCACCTATCTTGTTTCTCCAAGGGAGAATTAAGTAAACTGAACGATGGCAAATTTCATC
AACCAAGAAATTTACCTCTACTTGATCAGGACCTTAACTTCCTTCCTTGTTCTGTTGCTGTATCTGAAGGGTCTGAGAATCAAATGAAAGAATCCTGTGAACCAGAAAAG
AAGAGGAGGGCAACAAGTGAGCACATTGCTGGGATTGCTTTATCAGATCTGTCTAAATACTTCGGTGTTCCAATTACAGAAGCATCAAGAAATTTAAATGTTGGGTTAAC
AGTACTGAAAAGAAAATGCAGAGAGTTTGGGATTCATCGCTGGCCACACAGGAAGATCAAGTCCATTGATGGTCTAATCCGAGATCTTCAGGAAGAAGCAAAGCATAGAG
AGGAAGATCACAAAGCTTTGATGGCAGTGACAAAGAGGCAAATGATGTTGCAGAATGAAAGGGAGAGCATTGAGAGAACACCATTTAGAGAGCTGGAGATTGAGACCAAG
AGATTTAGGCAAGATGTTTTCAGGAGAAGGCATAAAGCTAGAGCTCTAGAAAGTCAAGGTCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCATGGTCTGAATCTGGTTTATAACCTCTCAATCTGCTTCTCTTTTTACCAACTCGGTTCGTCACTTTGTCCTGTTATTTCTGCAGACTATCATTTGCAGATAAAAGA
TAGTTTTTTTGATTCAGAACTTCAAAAAGTTGCAGATCAGATGGAGAATGCTCACCTATCTTGTTTCTCCAAGGGAGAATTAAGTAAACTGAACGATGGCAAATTTCATC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MHGLNLVYNLSICFSFYQLGSSLCPVISADYHLQIKDSFFDSELQKVADQMENAHLSCFSKGELSKLNDGKFHQPRNLPLLDQDLNFLPCSVAVSEGSENQMKESCEPEK
KRRATSEHIAGIALSDLSKYFGVPITEASRNLNVGLTVLKRKCREFGIHRWPHRKIKSIDGLIRDLQEEAKHREEDHKALMAVTKRQMMLQNERESIERTPFRELEIETK
RFRQDVFRRRHKARALESQGP