; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0013912 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0013912
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionDOG1 domain-containing protein
Genome locationchr1:53672123..53672920
RNA-Seq ExpressionLag0013912
SyntenyLag0013912
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR025422 - Transcription factor TGA like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594542.1 Protein DOG1-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-11282.95Show/hide
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KAG7026521.1 Protein DOG1-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-11283.33Show/hide
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XP_022926401.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Cucurbita moschata]9.2e-11282.95Show/hide
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XP_023003298.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Cucurbita maxima]6.6e-11081.82Show/hide
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XP_023518649.1 protein DELAY OF GERMINATION 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-11182.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNL1 DOG1 domain-containing protein1.5e-9975.57Show/hide
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A0A1S3B031 transcription factor TGA61.1e-9774.05Show/hide
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A0A5D3CMS6 Transcription factor TGA66.3e-9874.43Show/hide
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        MAE GS+SD A S+RCF EWMKLQ+ S +EL  AL+ +ENRANSN    EE ER+L +LVDKSIEQF DYIDRR QLAK D S FFAPVWC+ RE SLLW
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A0A6J1EET8 protein DELAY OF GERMINATION 1-like4.5e-11282.95Show/hide
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A0A6J1KW35 protein DELAY OF GERMINATION 1-like3.2e-11081.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0SVK0 Protein DELAY OF GERMINATION 16.2e-3436.12Show/hide
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        GSSS + E +   + EWM LQ     EL   L   + R++ +    E+ + KL KL  K I  F +Y  +R  LA R  S ++AP W +  E +L+W+ G
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        CRPS F RL ++L     E R+ +FL+ +   E         L DLS  Q+ +++ L ++ I EEE++T +++  QE+ AD  +  +A       EP+  
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        +++AL+KQ+  M R++ EAD LR+ TL ++  IL P+Q    L   KKLHL + EWG   DRR
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Q58FV0 Protein DOG1-like 31.7e-3133.21Show/hide
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        MA S SS    +  + C+ EWM +Q     +L +AL          +    + + KL +LV K +  F  Y ++R++L++R  S++FAP W +  E  LL
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Query:  WIAGCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRM-KSVE-----ELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPS
        W+ GCRPS FIR+ +SL     ET+L ++L ++ ++VE      + DL+  Q+ ++++L ++ I++E+++T + A  QE +AD   + IA  +       
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Query:  EELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGK-RSDRRHG
          +E AL+K +  M  +M EADKLR  TL ++ +++ P+QA   L   K+LH+ + EWG+ R ++R G
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Q9SLV1 Protein ZW22.1e-1023.67Show/hide
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        F +W+      HR+ +  L  + +   + +  P E E     LV   +  +  Y + ++    +A  D+  FF+P W ++ E  +LWI G +P +  +L 
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Query:  FSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVEELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTV------VGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNM
                                + DL+  Q++QL+++++ T + E  L    A  Q+ + D  +      +G+      EQ    E+E A+E     M
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Query:  LRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWG
        ++ M+ AD+LR +T+ ++ E+L P Q++ LL  + + +L +R+ G
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Q9SN45 Protein DOG1-like 26.0e-2933.2Show/hide
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        M  S S        RC+ EWM LQ     +L +AL         N DD      KL  LV K +  +H Y  +R++L+ R  + +FAP W T  E S+LW
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Query:  IAGCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVEE------LGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSE
        + GCRPS FIRL ++L     ET+L ++L ++    +      + DL+  Q+ +L++L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +    V       
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Query:  ELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGK
         +E AL+K +  M  ++ EADKLR  TL ++ +++ PLQAV  L   K+L L + + G+
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Q9SN47 Protein DOG1-like 11.4e-3032.36Show/hide
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        E+ SS+       C+ EWM LQ     EL +A++             E+ + KL+ L+  +I  F DY  +R++ ++R  S +FAP W T  E +LLW+ 
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Query:  GCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQR-------------------MKSVEELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIA
        GCRPS FIRL +++     E RL  F                      +   E + DL+  Q+ +++ L ++T++ E +LT   A  QE+ AD  +   A
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Query:  MRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRR
               +    +ERAL+K + +M  ++ EADKLR+ TL ++ +IL  +QA   L   KKLHL + EWGK  + R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14880.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transcription factor-related (TAIR:AT4G18650.1)5.2e-2029.03Show/hide
Query:  KLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLLWIAGCRPSLFIRLAFSLTSLDL
        K QQ    +L + LN + +  N + +     E +L + VD+ +E F +Y   +     +DV    A  W +A E SL W+ G RP+    L ++ +S+  
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Query:  ETRLVEFLQRMKSVEELGDLSPRQM-------EQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEA
        E+R+V+ L+  ++  +L DLSP Q          +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  V+G +       +P + + R  E        I+   
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Query:  DKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRRHGRD
        D LR+ T+  + E+L PLQ    L  + +L   V  WG   DRR   +
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AT3G14880.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown4.2e-2229.88Show/hide
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        K QQ    +L + LN + +  N + +     E +L + VD+ +E F +Y   +     +DV    A  W +A E SL W+ G RP+    L ++ +S+  
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Query:  ETRLVEFLQRMKSVEELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILT
        E+R+V+ L+  ++  +L DLSP Q   +  LQ  T+KEE  +T EL+  Q++ +D  V+G +       +P + + R  E        I+   D LR+ T
Subjt:  ETRLVEFLQRMKSVEELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILT

Query:  LNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRRHGRD
        +  + E+L PLQ    L  + +L   V  WG   DRR   +
Subjt:  LNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRRHGRD

AT4G18680.1 unknown protein7.5e-2734.15Show/hide
Query:  KLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLLWIAGCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVEE------LGDLSPRQMEQ
        KL  LV K +  +H Y  +R++L+ R  + +FAP W T  E S+LW+ GCRPS FIRL ++L     ET+L ++L ++    +      + DL+  Q+ +
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Query:  LDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCV
        L++L +  IK+E+++T   A  Q+++AD  +  +    V        +E AL+K +  M  ++ EADKLR  TL ++ +++ PLQAV  L   K+L L +
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Query:  REWGK
         + G+
Subjt:  REWGK

AT4G18690.1 unknown protein1.2e-3233.21Show/hide
Query:  MAESGSSSDHAESDR-CFQEWMKLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLL
        MA S SS    +  + C+ EWM +Q     +L +AL          +    + + KL +LV K +  F  Y ++R++L++R  S++FAP W +  E  LL
Subjt:  MAESGSSSDHAESDR-CFQEWMKLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLL

Query:  WIAGCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRM-KSVE-----ELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPS
        W+ GCRPS FIR+ +SL     ET+L ++L ++ ++VE      + DL+  Q+ ++++L ++ I++E+++T + A  QE +AD   + IA  +       
Subjt:  WIAGCRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRM-KSVE-----ELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPS

Query:  EELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGK-RSDRRHG
          +E AL+K +  M  +M EADKLR  TL ++ +++ P+QA   L   K+LH+ + EWG+ R ++R G
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AT5G45830.1 delay of germination 14.4e-3536.12Show/hide
Query:  GSSSDHAE-SDRCFQEWMKLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLLWIAG
        GSSS + E +   + EWM LQ     EL   L   + R++ +    E+ + KL KL  K I  F +Y  +R  LA R  S ++AP W +  E +L+W+ G
Subjt:  GSSSDHAE-SDRCFQEWMKLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLLWIAG

Query:  CRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVE--------ELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEE
        CRPS F RL ++L     E R+ +FL+ +   E         L DLS  Q+ +++ L ++ I EEE++T +++  QE+ AD  +  +A       EP+  
Subjt:  CRPSLFIRLAFSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVE--------ELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEE

Query:  LERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRR
        +++AL+KQ+  M R++ EAD LR+ TL ++  IL P+Q    L   KKLHL + EWG   DRR
Subjt:  LERALEKQDGNMLRIMEEADKLRILTLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAAAGCGGAAGCAGCAGCGACCATGCTGAATCAGACCGGTGTTTCCAGGAATGGATGAAGCTCCAGCAAGTAAGCCACAGGGAGCTTTTGGATGCCCTCAACGA
CGTCGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCGACGACCCCGAAGAAACCGAACGAAAACTCATCAAGCTGGTTGACAAGAGCATCGAGCAATTCCATGACTACATTGACCGAC
GAACCCAGCTGGCAAAAAGAGACGTGTCGGCATTCTTCGCCCCTGTGTGGTGCACCGCCAGGGAAACCTCTCTCCTGTGGATCGCCGGGTGCCGCCCCTCCCTCTTCATC
CGGCTGGCCTTCTCCCTCACAAGCCTCGATCTGGAAACCCGACTGGTGGAATTCCTGCAGCGGATGAAATCGGTGGAGGAATTAGGAGATCTGTCGCCGCGTCAAATGGA
GCAGCTGGACAATCTGCAGATGAGAACGATCAAGGAAGAGGAGAGGCTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGCGCAGGAGGAGATAGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTGCGA
TGAGATCGGTGAAAGAGCAGGAGCCGAGTGAGGAGCTGGAGAGGGCTCTGGAAAAGCAGGACGGGAACATGCTCAGAATCATGGAGGAAGCCGACAAACTCAGGATCCTT
ACGCTGAATGAGCTGACCGAGATTCTCAGACCGTTGCAAGCGGTGATGCTCTTAGCGTTCAGCAAGAAGCTTCATCTGTGTGTGCGCGAGTGGGGAAAACGAAGCGATCG
GAGGCACGGCAGAGATGGTATCCGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGAAAGCGGAAGCAGCAGCGACCATGCTGAATCAGACCGGTGTTTCCAGGAATGGATGAAGCTCCAGCAAGTAAGCCACAGGGAGCTTTTGGATGCCCTCAACGA
CGTCGAAAACAGAGCAAATTCCAACCTCGACGACCCCGAAGAAACCGAACGAAAACTCATCAAGCTGGTTGACAAGAGCATCGAGCAATTCCATGACTACATTGACCGAC
GAACCCAGCTGGCAAAAAGAGACGTGTCGGCATTCTTCGCCCCTGTGTGGTGCACCGCCAGGGAAACCTCTCTCCTGTGGATCGCCGGGTGCCGCCCCTCCCTCTTCATC
CGGCTGGCCTTCTCCCTCACAAGCCTCGATCTGGAAACCCGACTGGTGGAATTCCTGCAGCGGATGAAATCGGTGGAGGAATTAGGAGATCTGTCGCCGCGTCAAATGGA
GCAGCTGGACAATCTGCAGATGAGAACGATCAAGGAAGAGGAGAGGCTGACGTCGGAGCTGGCGAGGGCGCAGGAGGAGATAGCGGACCAGACGGTGGTGGGGATTGCGA
TGAGATCGGTGAAAGAGCAGGAGCCGAGTGAGGAGCTGGAGAGGGCTCTGGAAAAGCAGGACGGGAACATGCTCAGAATCATGGAGGAAGCCGACAAACTCAGGATCCTT
ACGCTGAATGAGCTGACCGAGATTCTCAGACCGTTGCAAGCGGTGATGCTCTTAGCGTTCAGCAAGAAGCTTCATCTGTGTGTGCGCGAGTGGGGAAAACGAAGCGATCG
GAGGCACGGCAGAGATGGTATCCGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAESGSSSDHAESDRCFQEWMKLQQVSHRELLDALNDVENRANSNLDDPEETERKLIKLVDKSIEQFHDYIDRRTQLAKRDVSAFFAPVWCTARETSLLWIAGCRPSLFI
RLAFSLTSLDLETRLVEFLQRMKSVEELGDLSPRQMEQLDNLQMRTIKEEERLTSELARAQEEIADQTVVGIAMRSVKEQEPSEELERALEKQDGNMLRIMEEADKLRIL
TLNELTEILRPLQAVMLLAFSKKLHLCVREWGKRSDRRHGRDGIR