; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0013945 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0013945
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionAgamous-like putative transcription factor
Genome locationchr1:53893475..53899947
RNA-Seq ExpressionLag0013945
SyntenyLag0013945
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001292633.1 floral homeotic protein AGAMOUS [Cucumis sativus]1.7e-11496.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KID6 Uncharacterized protein8.3e-11596.07Show/hide
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A0A6J1ECE2 floral homeotic protein AGAMOUS8.9e-11798.25Show/hide
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A0A6J1IR53 floral homeotic protein AGAMOUS7.5e-11697.38Show/hide
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O64958 CUM18.3e-11596.07Show/hide
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Q9SBK1 Agamous-like putative transcription factor8.3e-11596.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q40168 Floral homeotic protein AGAMOUS1.9e-8773Show/hide
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Q40872 Floral homeotic protein AGAMOUS1.9e-8774.89Show/hide
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Q40885 Floral homeotic protein AGAMOUS2.3e-9077.49Show/hide
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        KLR QIGNLQN NRN LGESL++L+++DLRNLE K+EKGIS+IR+KKNELLFAE+EYM+KREIDLHNNNQ LRAKIAE+ER+   N+M G   ++L+   
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Q43585 Floral homeotic protein AGAMOUS2.8e-9177.22Show/hide
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        KLR QIGNLQN NRNMLGESL++LS++DL+NLE K+EKGIS+IRSKKNELLFAE+EYM+KREIDLHNNNQ LRAKIAE+ER          N+M G   +
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        EL+   H +D R++ QVNGLQ N  Y RQD  +LQLV
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Q93XH4 Agamous-like MADS-box protein MADS19.9e-8172.44Show/hide
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        I ++QN NR++LGE+LSSL+ K+L+NLE++LEKGISRIRSKKNELLFAE+EYM+KREI+L N+N  LRA+IAE+ER    M    G ++E +   PYD +
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        +   VN L  N  Y R D  ALQLV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42830.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.8e-7063.68Show/hide
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         QI ++QN NR++LGESL SL+ K+L+NLES+LEKGISR+RSKK+E+L AE+EYM+KREI+L N+N  LR+KI E       E +    G  +E      
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AT2G42830.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein8.9e-6963.14Show/hide
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         QI ++QN NR++LGESL SL+ K+L+NLES+LEKGISR+RSKK+E+L AE+EYM+KR  EI+L N+N  LR+KI E       E +    G  +E    
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AT3G58780.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein7.8e-7364.83Show/hide
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        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNSV+ TI+RYKKA SD+ N  S +EANTQ+YQQEA+KLR
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLR

Query:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER-NANMM------------GGEF
         QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+L+NLE +LEKGISR+RSKKNELL AE+EYM+KRE++L +NN  LRAKIAE  R N +               G  
Subjt:  VQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESER-NANMM------------GGEF

Query:  ELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQYPRQDNMALQLV
           QS  Y+ R++  VN L+ NQQ+  QD   LQLV
Subjt:  ELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQYPRQDNMALQLV

AT3G58780.3 K-box region and MADS-box transcription factor family protein1.2e-6858.62Show/hide
Query:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS
        +K+GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVAL++FS+RGRLYEYANNS                         V+ TI+RYKKA 
Subjt:  RKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNS-------------------------VKATIDRYKKAS

Query:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE
        SD+ N  S +EANTQ+YQQEA+KLR QI ++QNSNR+++GESL SL+ K+L+NLE +LEKGISR+RSKKNELL AE+EYM+KRE++L +NN  LRAKIAE
Subjt:  SDSSNTGSTSEANTQFYQQEAAKLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAE

Query:  SER-NANMM------------GGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQYPRQDNMALQLV
          R N +               G     QS  Y+ R++  VN L+ NQQ+  QD   LQLV
Subjt:  SER-NANMM------------GGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQYPRQDNMALQLV

AT4G18960.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.0e-8169.29Show/hide
Query:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA
        SP RK GRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEY+NNSVK TI+RYKKA SD+SNTGS +E N Q+YQQE+A
Subjt:  SPQRKMGRGKIEIKRIENTTNRQVTFCKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIVFSSRGRLYEYANNSVKATIDRYKKASSDSSNTGSTSEANTQFYQQEAA

Query:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN----ANMMGGE--FELM-
        KLR QI ++QNSNR ++GE++ S+S K+LRNLE +LE+ I+RIRSKKNELLF+E++YM+KRE+DLHN+NQ+LRAKIAE+ERN    + M GG    +LM 
Subjt:  KLRVQIGNLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERN----ANMMGGE--FELM-

Query:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQY----PRQDNMALQLV
            QS P+D R++FQV  LQ N  +     RQD  ALQLV
Subjt:  ----QSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQY----PRQDNMALQLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGACTCACCTCAGAGGAAGATGGGAAGAGGAAAGATTGAGATTAAGAGGATCGAAAATACAACAAATCGTCAAGTCACTTTCTGCAAGAGACGAAATGGGCTGCT
CAAAAAGGCCTATGAACTTTCTGTTCTGTGTGATGCTGAAGTTGCTCTCATCGTTTTCTCAAGCCGTGGCCGTCTCTATGAGTATGCTAACAACAGTGTGAAGGCAACGA
TTGATAGATATAAGAAGGCATCCTCAGATTCCTCCAACACTGGATCTACTTCTGAAGCTAACACTCAGTTTTACCAGCAAGAAGCTGCCAAACTCCGAGTTCAGATTGGT
AACTTGCAGAACTCAAACAGGAACATGCTGGGTGAATCTCTAAGTTCTTTGAGTGTAAAAGATCTGAGAAACCTAGAGAGCAAACTTGAGAAAGGAATTAGCAGAATTAG
ATCCAAAAAGAATGAACTCCTCTTTGCTGAAGTTGAGTATATGCGGAAAAGGGAAATTGATTTGCACAACAACAATCAGCTGCTTCGAGCAAAGATAGCTGAGAGTGAAA
GAAATGCCAACATGATGGGAGGAGAATTTGAGCTGATGCAATCTCATCCGTACGATCCAAGAGACTTCTTCCAAGTGAACGGCTTACAACATAATCAACAGTATCCACGA
CAAGACAACATGGCTCTTCAATTAGTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NLQNSNRNMLGESLSSLSVKDLRNLESKLEKGISRIRSKKNELLFAEVEYMRKREIDLHNNNQLLRAKIAESERNANMMGGEFELMQSHPYDPRDFFQVNGLQHNQQYPR
QDNMALQLV