| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 6.2e-131 | 94.35 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNG GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 2.8e-131 | 95.05 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022141921.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia] | 4.9e-128 | 92.25 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRS+SRG+SRSVDSASPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRGESP RNG+GGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 2.2e-128 | 90.54 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DER R+R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRS SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 2.5e-132 | 93.68 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER++RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRSRSRSRGRSRSVDS SPGR+SPSPRRS SPRRSLSPRRSPSPRG SPERNGN GGRSPT RSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 3.0e-131 | 94.35 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRD+DY+RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGNG GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.3e-131 | 95.05 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDS SPGRRSPSPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNGN GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGN-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 2.4e-128 | 92.25 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RDRDY+RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRS+SRG+SRSVDSASPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRGESP RNG+GGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.1e-128 | 90.54 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RDDYRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DER R+R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SRS SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 6.5e-126 | 87.75 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRR+RD+YRDRDY+R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DER R+R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS SRSRGRSRSV+SASPGRRSPSPRRSLSPR RSLSPRRSPSPRGESPERNG+GGRSPTPRSVSPRGQ ADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
Query: VD
V+
Subjt: VD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.3e-29 | 46.53 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
+G + S Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
Query: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSRSR RSRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.5e-28 | 46.12 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
Query: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSRSR RSRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.2e-28 | 46.53 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
Query: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSRSR RSRS A S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.5e-28 | 46.12 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + + S SRS
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRS
Query: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
RSRSRSR RSRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: RSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.7e-70 | 61.15 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
SPD K R RGRY++E RS SRS S S +R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
Query: P-RGQPADSRSPSP
P R A SRS SP
Subjt: P-RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 6.6e-14 | 38.3 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRS----RSRSRSR
+ R R R R RD +RR+ R SRS RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R RS R +SRS
Subjt: SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRS----RSRSRSR
Query: SRGRSRSVDSASPGRRSPSPR--RSLSPRRSL--SPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S RS+ + RSPSP+ RS+SPRRS+ SPRRS SPR RS TP +PA SRS SP D
Subjt: SRGRSRSVDSASPGRRSPSPR--RSLSPRRSL--SPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.0e-14 | 35.71 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSR
+ E SR+R R R+P R + S RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSR
Query: S----RSRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPR--RSLSPRRSL--SPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S R +SRS S RS+ + RSPSP+ RS+SPRRS+ SPRRS SPR RS TP +PA SRS SP D
Subjt: S----RSRSRSRSRGRSRSVDSASPGRRSPSPR--RSLSPRRSL--SPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.9e-13 | 36.79 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
+ + +S R++ R RSP R R R RRSRSRSR + + R +SRS+SP +D R + RS
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SRSRSRGRSRSVDSASPGR---RSPSPRRSLSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
SRS SR V S SPGR S SPRRS+SPR RS +P ++ R +SP + RSPTP PRG RSPS
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSASPGR---RSPSPRRSLSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.6e-71 | 61.15 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
SPD K R RGRY++E RS SRS S S +R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
Query: P-RGQPADSRSPSP
P R A SRS SP
Subjt: P-RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.6e-71 | 61.15 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DY++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRHRDDYRDRDYKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
SPD K R RGRY++E RS SRS S S +R RS S SP R RSPSPRRSLSPR + SPS + SPER N RSP+P S +
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSRSRSR--GRSRSVDSASPGR----------RSPSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGNGGRSPTPRSVS
Query: P-RGQPADSRSPSP
P R A SRS SP
Subjt: P-RGQPADSRSPSP
|
|
