; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0014800 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0014800
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr12:4757697..4758080
RNA-Seq ExpressionLag0014800
SyntenyLag0014800
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4291060.1 unnamed protein product [Prunus armeniaca]1.3e-2646.97Show/hide
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KAG6589096.1 AP-1 complex subunit sigma-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.0e-2973.68Show/hide
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KAG7022803.1 AP-1 complex subunit sigma-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-2875.82Show/hide
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MBA0556883.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]3.7e-2645.45Show/hide
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        MISL       C A ++F+TCVWIP  Q K  + S++G +  R+S  +        V LPV RFE+L+   G      E++CS+CL EF  +D VSQ+ +
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VVA26628.1 PREDICTED: AP-1 complex subunit [Prunus dulcis]3.7e-2647.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K513 RING-type domain-containing protein2.1e-4373.44Show/hide
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A0A0D2SLB9 RING-type domain-containing protein4.0e-2644.7Show/hide
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        C HVFH+ CIE W+ R HFTCPLCRS LF+ +
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A0A5E4FLS0 PREDICTED: AP-1 complex subunit1.8e-2647.01Show/hide
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        MI L + +  + MATI F+TC WIPL Q+K  +  ++G +   T Q    E      ++ LPV RF++LQ  G        LE+ CS+CL EF +ED+VS
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A0A6J5VPD4 RING-type domain-containing protein6.2e-2746.97Show/hide
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A0A7J8LWW2 RING-type domain-containing protein1.8e-2645.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL475.1e-1047.76Show/hide
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Q940Q4 RING-H2 finger protein ATL131.3e-1058.82Show/hide
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        C+VCL EF  ED +  L +CSH FH++CI+ WL  SH TCPLCRS L S L
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Q9FL07 RING-H2 finger protein ATL466.6e-1046.05Show/hide
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        LPV  ++E+    GGG  +        C+VCL EF+ +D +  L  CSH FHL CI+ WL +S+ TCPLCR  LFS
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Q9SZL4 RING-H2 finger protein ATL181.5e-1738.52Show/hide
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        MIS+   R P+C A IVF+TCV IPL +LK              +++G++ G   +                  EE       E  C +CL EF  ED V
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        + L RC+H+FH+ CIE WL R H TCPLCRSF+ +
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Q9ZV53 Putative RING-H2 finger protein ATL493.9e-1061.22Show/hide
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        C VCL EF  ED +  L +CSH FH+ECI+ WL  SH TCPLCRS L S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23980.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-1147.76Show/hide
Query:  LPVCRFEELQRGGGLEDICSVCLAEFTREDLVSQLHRCSHVFHLECIENWLHRSHFTCPLCRSFLFS
        LPV  ++E+ +G      C+VCL EF+ +D +  L  CSH FH++CI+ WL  S+ TCPLCR  LFS
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AT1G24580.1 RING/U-box superfamily protein7.3e-1233.33Show/hide
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        + +  LK  + SV  I+   T   +  +  P +     ++ + +F       EE +   G+E  C VCL  F  E+ VS+L  C H FH  C++NW   +
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Query:  HFTCPLCRSFL
        H TCPLCRS L
Subjt:  HFTCPLCRSFL

AT2G18650.1 RING/U-box superfamily protein2.8e-1161.22Show/hide
Query:  CSVCLAEFTREDLVSQLHRCSHVFHLECIENWLHRSHFTCPLCRSFLFS
        C VCL EF  ED +  L +CSH FH+ECI+ WL  SH TCPLCRS L S
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AT4G30400.1 RING/U-box superfamily protein9.5e-1258.82Show/hide
Query:  CSVCLAEFTREDLVSQLHRCSHVFHLECIENWLHRSHFTCPLCRSFLFSTL
        C+VCL EF  ED +  L +CSH FH++CI+ WL  SH TCPLCRS L S L
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AT4G38140.1 RING/U-box superfamily protein1.0e-1838.52Show/hide
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        MIS+   R P+C A IVF+TCV IPL +LK              +++G++ G   +                  EE       E  C +CL EF  ED V
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        + L RC+H+FH+ CIE WL R H TCPLCRSF+ +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAAGCTTGGCGTTAGGTCGAGGTCCAATGTGCATGGCCACCATTGTCTTCTTCACTTGTGTATGGATCCCTCTGTGTCAACTGAAAACAACCATCGAGAGCGTGAT
CGGTATACTGTTAGGCAGGACGTCTCAGCCACTCACGACGGAGTCGCCACCGTTCGAGGTAAAACTTCCGGTTTGTAGGTTCGAAGAGCTGCAGCGAGGGGGTGGATTGG
AGGATATTTGCTCCGTTTGCTTGGCGGAGTTCACCAGGGAAGATTTGGTTAGCCAACTGCATAGATGTAGCCATGTTTTCCATTTGGAGTGTATTGAGAATTGGCTCCAT
AGAAGTCACTTTACCTGCCCTCTCTGCCGATCCTTCCTCTTCTCAACATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATAAGCTTGGCGTTAGGTCGAGGTCCAATGTGCATGGCCACCATTGTCTTCTTCACTTGTGTATGGATCCCTCTGTGTCAACTGAAAACAACCATCGAGAGCGTGAT
CGGTATACTGTTAGGCAGGACGTCTCAGCCACTCACGACGGAGTCGCCACCGTTCGAGGTAAAACTTCCGGTTTGTAGGTTCGAAGAGCTGCAGCGAGGGGGTGGATTGG
AGGATATTTGCTCCGTTTGCTTGGCGGAGTTCACCAGGGAAGATTTGGTTAGCCAACTGCATAGATGTAGCCATGTTTTCCATTTGGAGTGTATTGAGAATTGGCTCCAT
AGAAGTCACTTTACCTGCCCTCTCTGCCGATCCTTCCTCTTCTCAACATTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MISLALGRGPMCMATIVFFTCVWIPLCQLKTTIESVIGILLGRTSQPLTTESPPFEVKLPVCRFEELQRGGGLEDICSVCLAEFTREDLVSQLHRCSHVFHLECIENWLH
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