; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0014876 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0014876
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationchr12:5458635..5459731
RNA-Seq ExpressionLag0014876
SyntenyLag0014876
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-3785.04Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYG--GGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY
        MSSK F+FLGLL A+VLL+SSEVAARDLAETST+K NEAT ETNGVEDAK+GGYDGGYG  GGYGRGG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGG GGY
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYG--GGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY

Query:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
        G  CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-3684.92Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYG--GGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY
        MSSK F+FLGLL A+VLL+SSEVAARDLAETST+K NEAT ETNGVEDAK+GGYDGGYG  GGYGRGG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGG GGY
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYG--GGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY

Query:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAK
        G  CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAK
Subjt:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAK
XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.0e-3684Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK F+FLGLL A+VLL+SSEVAARDLAETST+K NEAT ETNGVEDAK+GGYDGGYGG     GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGG GGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]4.3e-3582.4Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK F+FLGLL A +LL+SSEVAARDLAETS  K  EATVETNGVEDAK+GGYDGGYG   GRGG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY GGRGGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-3581.6Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK F+FLG L A++L++SSEVAARDLAETS +K NEATVETNGVEDAK+GGYDGGYG   GRGG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGG GGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein3.7e-3277.95Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKH--GGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY
        MSSK FVFLGLLLA VLL+SSEVAARDLAETS++ +NEATVETNGVEDAK+  GGYD GYGGG+ RG G GRGGY       GRG YGGRGGYGGGRGGY
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKH--GGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY

Query:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
        G  CRYGRCGH +CCSYAGE VEGAKP
Subjt:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like9.7e-3383.2Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK FVFLGLLLA VLL+SSEVAARDLAETS++ +NEATVETNGVEDAK+G   GGY  GYG GGGYGRGGY GRGGY GRGGYGGRGGYGGGRGGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X15.0e-3784Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK F+FLGLL A+VLL+SSEVAARDLAETST+K NEAT ETNGVEDAK+GGYDGGYGG     GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGG GGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like2.1e-3582.4Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG
        MSSK F+FLGLL A +LL+SSEVAARDLAETS  K  EATVETNGVEDAK+GGYDGGYG   GRGG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY GGRGGYG 
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGG

Query:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
         CRYGRCG+ RCCSYAGE VEGAKP
Subjt:  HCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein3.7e-3277.95Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKH--GGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY
        MSSK FVFLGLLLA VLL+SSEVAARDLAETS++ +NEATVETNGVEDAK+  GGYD GYGGG+ RG G GRGGY       GRG YGGRGGYGGGRGGY
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKH--GGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGY

Query:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
        G  CRYGRCGH +CCSYAGE VEGAKP
Subjt:  GGHCRYGRCGHGRCCSYAGEAVEGAKP
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q07202 Cold and drought-regulated protein CORA3.1e-0448.44Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGG---YDGGY-GGGYGRGGGYGRGGYG----------GRGGYGGRGGYG
        M SK  + +  LLA+  L+SS ++ARDL ETST+   E   +TN V DAK+GG   + GGY GGGY  GGGY  GG G          G GGY G GG+G
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGG---YDGGY-GGGYGRGGGYGRGGYG----------GRGGYGGRGGYG

Query:  GRGG----YGGGRGGYGGHCRYGRCGHG
        G GG     GGG GG+GG    G  GHG
Subjt:  GRGG----YGGGRGGYGGHCRYGRCGHG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family6.5e-0548.03Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GGGRGGYG
        M+SK  V  GL    VLLV +EVAA              TV++   E  +   Y+GG+GG  G  GG   GGY G GG+ G GGY G GGY GGG GG  
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GGGRGGYG

Query:  GHCRYGRC-----GHGRCCSYAGEAVE
        G+CRYG C     G  RCCSYAGEAV+
Subjt:  GHCRYGRC-----GHGRCCSYAGEAVE
AT2G05540.1 Glycine-rich protein family4.3e-0953.03Show/hide
Query:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYG---RGGYGGR-GGYGGR-GGYGGRGGYGGGR
        M+SK  +FL L+  VVLL++SEV ARDLAE S E+ N    E    E  + GG+ GG  GG+  GGGYG    GGYG R GGY  R GGYG RGG  G R
Subjt:  MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYG---RGGYGGR-GGYGGR-GGYGGRGGYGGGR

Query:  GGYGGHCRYGRCGHG------RCCSYAGEAVE
        G  GG+CRYG C  G      RCC+YAG+AV+
Subjt:  GGYGGHCRYGRCGHG------RCCSYAGEAVE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAAGACTTTCGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCGTTGTCCTCCTCGTCTCCTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACCTCTACCGAGAAGAACAA
TGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGTGTAGAGGACGCCAAGCATGGAGGATATGACGGAGGCTACGGTGGAGGATATGGTCGTGGTGGCGGTTACGGTCGTGGTGGCTATG
GCGGTCGTGGAGGCTATGGCGGTCGTGGAGGCTACGGTGGCCGCGGTGGTTACGGTGGTGGCCGAGGTGGCTATGGAGGGCATTGCCGGTACGGTCGGTGCGGGCACGGC
CGTTGCTGCAGCTACGCCGGTGAAGCAGTAGAGGGAGCAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTTCCAAGACTTTCGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCGTTGTCCTCCTCGTCTCCTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACCTCTACCGAGAAGAACAA
TGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGTGTAGAGGACGCCAAGCATGGAGGATATGACGGAGGCTACGGTGGAGGATATGGTCGTGGTGGCGGTTACGGTCGTGGTGGCTATG
GCGGTCGTGGAGGCTATGGCGGTCGTGGAGGCTACGGTGGCCGCGGTGGTTACGGTGGTGGCCGAGGTGGCTATGGAGGGCATTGCCGGTACGGTCGGTGCGGGCACGGC
CGTTGCTGCAGCTACGCCGGTGAAGCAGTAGAGGGAGCAAAGCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKTFVFLGLLLAVVLLVSSEVAARDLAETSTEKNNEATVETNGVEDAKHGGYDGGYGGGYGRGGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGHCRYGRCGHG
RCCSYAGEAVEGAKP